r语言编程的步骤

Python027

r语言编程的步骤,第1张

r语言编程的步骤?R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。

工具原料一台电脑下载完毕的R software

方法/步骤分步阅读

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安装完毕R语言,新建属于自己的R变成文件夹,然后 File ->Change Dir..,设置成自己的工作文件,自己工作空间将都会产生在这个文件夹下。

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然后Files - >New Script,打开新的脚本编辑,在这里键入自己代码,编辑。

在此模式下,摁F5键意味着执行这一行,当我们编辑很多行的时候,我们可以进行全选,然后摁下F5,这样就会执行所有行的代码。

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下面进行实战,我们下面将会用R语言画出一个简单房子,具体的代码含义不解释,推荐Manning出版的《R语言实战》,里面有大量的联系及讲解。

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选中,然后执行F5按键,R语言就会画出一个简单的房子,具体代码可以参见下图。

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总之,R语言是一个非常好的统计软件,在生物统计,金融统计中发挥着越来越多的作用,同时R语言作为一款开源软件,也被世界的R语言兴趣者优化着。

注意事项

R作为一款免费的软件,有时候即使编正确的情况下,仍然可能出现错误

软件的学习在于多联系

内容仅供参考并受版权保护

用BLAS库进行。

现在做的DNN、CNN都是在底层把计算转换为矩阵乘法。加速矩阵乘法就是用的BLAS库。很多情况下,application叫做R standard interface,就是单线程实现的矩阵乘的库,可以很容易地把这个库替换下面的部分,既可以替换成GPU加速的cuBLAS库,也可以是多核或多线程的intel的MKL库和OpenBLAS。通过这种方式,可以很快地提高矩阵运算速度。

Linux下有个NVBLAS库,它其实是cuBLAS的wrapper,从它里面就可以调整各种精度的矩阵乘。

它不仅支持单GPU,还支持多GPU。它的主要好处是对code不需要做任何改变,也就是zero programming effort,只需要把NVBLAS库load在前面,这个库就被替换成cuBLAS,跑到GPU上。

所以在做应用程序开发,大家通常有一种思路,如果想加速一个计算,就尝试把这个计算转换成矩阵计算,并加载各种多线程库或并行库,那么程序可以得到很快地提高,这其中不需要太多code的重写。然后看下benchmark,有两种benchmark。

蓝色的线是用原来的的R跑的程序,可以看到运行时间多很多,加载了NVBLAS库以后,运行时间少了很多。其他是一些在很多程序里运用的基础算法。当程序比较依赖于这种基础算法,就可以考虑加载很多并行库,来看程序的运行效果。

如果是程序包中自己带的函数,可用以下操作:

https://cran.r-project.org/

点击左侧Packages

点击中间Table of available packages, sorted by date of publication链接,进入包的列表界面

ctrl+F组合键在网页中搜索你关心的R包,例如包WGCNA,点击进入此R包主界面

点击Downloads下面的Package source:

 WGCNA_1.51.tar.gz

解压此包,然后找到里面名字为R的文件夹,里面都是R语言包中包含的R的函数的代码

如果是在bioconductor中的包,可以在bioconductor官网中搜索此R包,进入此包界面,下载.tar.gz的这个文件,寻找方法如上.