Hosmer-Lemeshow拟合度检验?

Python09

Hosmer-Lemeshow拟合度检验?,第1张

Hosmer-Lemeshow检验(HL检验)为模型拟合指标,其原理在于判断预测值与真实值之间的gap情况,如果p值大于0.05,则说明通过HL检验,即说明预测值与真实值之间并无非常明显的差异。反之如果p值小于0.05,则说明没有通过HL检验,预测值与真实值之间有着明显的差异,即说明模型拟合度较差。 SPSSAU计算的HL检验与R软件、Stata软件等保持一致,但与IBM SPSS软件的结果有一定出入,这是由于边界问题的处理方式不一致。。我的回答不知你是否满意?

1 读取,计算均值,箱图观察

2 查看数据分布

2.1 hist直方图

2.2 qqnorm散点图

3 Shapiro-Wilk正态性检验

4 方差齐性检验

意义:方差分析就是在大家误差水平差不多的条件下看控制和对照组是不是有显著差异。那方差其实就是误差水平了。当方差不一致的时候,这个方法就没法分辨出究竟是控制造成的差异还是,内在的波动造成的差异。

参考: https://www.zhihu.com/question/21195390

参考: https://blog.csdn.net/tiaaaaa/article/details/58130363

4.1 F检验

使用条件:数据正态分布,只可以检验两个样本

4.2 bartlett检验

使用条件:正态分布的数据,多个样本

4.3 levene检验

没有条件:数据可不具正态性,可以检验多个总体的方差齐性

SPSS的默认方差齐性检验方法

5 差异检验

5.1 参数检验:T检验

使用条件:两样本来自正太分布总体,方差齐

5.2 非参数检验:Wilcoxon秩和检验(两样本)

参数:

参考: https://www.jianshu.com/p/f30d1fe877ea

5.3 非参数检验:Kruskal-Wallis(KS)秩和检验(多样本)

5.4 Deseq两组reads count差异分析