求炼数成金-数据分析展现与R语言15周完整版视频?

Python011

求炼数成金-数据分析展现与R语言15周完整版视频?,第1张

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炼数成金:Python数据分析。Python是一种面向对象、直译式计算机程序设计语言。也是一种功能强大而完善的通用型语言,已经具有十多年的发展历史,成熟且稳定。Python 具有脚本语言中最丰富和强大的类库,足以支持绝大多数日常应用。 Python语法简捷而清晰,具有丰富和强大的类库。它常被昵称为胶水语言,它能够很轻松的把用其他语言制作的各种模块(尤其是C/C++)轻松地联结在一起。

课程将从Python的基本使用方法开始,一步步讲解,从ETL到各种数据分析方法的使用,并结合实例,让学员能从中借鉴学习。

课程目录:

Python基础

Python的概览——Python的基本介绍、安装与基本语法、变量类型与运算符

了解Python流程控制——条件、循环语句与其他语句

常用函数——函数的定义与使用方法、主要内置函数的介绍

.....

mycounts<-read.csv("2020武汉加油.csv")

head(mycounts)

rownames(mycounts)<-mycounts[,1]

mycounts<-mycounts[,-1]

head(mycounts)

kb <- mycounts$Length / 1000

kb

countdata <- mycounts[,1:9]

rpk <- countdata / kb

rpk

tpm <- t(t(rpk)/colSums(rpk) * 1000000)

head(tpm)

write.table(tpm,file="2020武汉加油_tpm.xls",sep="\t",quote=F)

fpkm <- t(t(rpk)/colSums(countdata) * 10^6) (之前这里写成了10^9,多谢@不爱说话的生物狗 提醒,现在已经修改)

head(fpkm)

write.table(fpkm,file="2020武汉加油_fpkm.xls",sep="\t",quote=F)

fpkm_to_tpm = t(t(fpkm)/colSums(fpkm))*10^6

head(fpkm_to_tpm)

当然,已知所有基因的FPKM情况下,可以通过上述公式直接在excel里计算相应基因的TPM值。