linux服务器安装R语言及Rstudio server

Python010

linux服务器安装R语言及Rstudio server,第1张

在linux服务器上使用R语言及Rstudio server

cat /etc/redhat-release: 查看服务器系统版本

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gz

checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no

configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals

configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals

configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages

6.安装

make

make install

安装成功!

R #在命令行直接输入“R”即可进入R 编辑。

q() ##退出R编辑

7.安装R-studio-server

wget https://download2.rstudio.org/server/centos6/x86_64/rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm

yum install rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm

8.R-studio-server的一些命令

rstudio-server start ##启动 rstudio

rstudio-server stop ## 关闭rstudio

rstudio-server status ## 查看rstudio 运行状态

运行rstudio-server status出现 “Active: active (running) ” 表示rstudio 已启动

rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安装错误

rstudio-server restart ##重启

ifconfig ##查看服务器ip地址。

查看运行中R进程

rstudio-server active-sessions

指定PID,停止运行中的R进程

rstudio-server suspend-session <pid>

停止所有运行中的R进程

rstudio-server suspend-all

强制停止运行中的R进程,优先级最高,立刻执行

rstudio-server force-suspend-session <pid>

rstudio-server force-suspend-all

RStudio Server临时下线,不允许web访问,并给用户友好提示

rstudio-server offline

RStudio Server临时上线

rstudio-server online

8.rstudio-server系统设置

主要有两个配置文件,默认文件不存在(非必要,可不做修改)

/etc/rstudio/rserver.conf

/etc/rstudio/rsession.conf

vi /etc/rstudio/rserver.conf

www-port=8080#监听端口,默认是8787,可以不做修改

www-address=127.0.0.0#允许访问的IP地址,默认0.0.0.0

rstudio-server restart

vi /etc/rstudio/rsession.conf

session-timeout-minutes=30#会话超时时间

r-cran-repos= http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN #CRAN资源库

rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安装,更改R所在目录。

9.通过浏览器连接Rstudio-server

直接打开浏览器,输入http://<服务器ip>:8787 ## 如果修改过rserver.conf文件,后面的8787端口改为相应的端口即可。

这里需要我们输入用户名和密码。关于用户名有2点注意事项:

(1).不允许使用system 用户登陆,即用户ids小于100的用户。只能用普通用户登录

(2).用户的认证可以使用RSA。

如果没有普通用户,可以添加:

useradd newname # 添加一个名为newname的用户

passwd newname###给新用户newname 设置密码,密码需是复杂密码,否则可能通不过。

usermod -G happy newname ####将新用户newname添加到happy 用户组中,

在用useradd添加用户之后,在默认的情况下,该账号是暂时被封锁的, 也就是说,该账号是无法登录,须要用passwd命令来给新创建的用户设置密码之后才可以使用。

10可能存在的问题

10.1如果你的rstudio-server没有启动 很大程度是安装有误,这里我将我遇到的错误分享出来

rstudio-server verify-installation

There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that

it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did not

configure with --enable-R-shlib.

这里就提到无法找到libR.so文件,原因是配置R语言文件时,没有加参数--enable-R-shlib.

这就必须要重新安装R语言。使用make uninstall 删除之前的安装,最好也删除R-3.6.1所在的文件夹,用“rm -r -f R-3.6.1".

使用rm 命令 -r 参数表示全部删除, -f 参数表示强制删除,不会提醒。 同时使用这两个参数要小心。

10.2 普通用户无法启动rstudio-server

sudo rstudio-server start## 以管理员方式执行命令

这时会需要输入密码并提示

xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported.

如果不想出现上面的提示,就是给该用户提高权限,添加用户使用sudo的权利。

su root ###切换到root用户,如果有root权限的话。

chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的写权限

vi /etc/sudoers ###编辑sudoers文件,添加权限。

找到这行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (这里的xxx是你的用户名)

youuserALL=(ALL)ALL

%youuser ALL=(ALL)ALL

youuserALL=(ALL)NOPASSWD: ALL

%youuser ALL=(ALL)NOPASSWD: ALL

chmod u-w /etc/sudoers ##撤销sudoers文件写权限

是的。每次使用程序包都必须首先加载。比如:library(rootSolve)library(tm)在R中加载包是非常容易的,有两个函数可以做到:library和require。他们之间有一些细微的差别,主要的区别在于require会返回一个布尔值(True或False)来表示被加

R语言做单位根检验的两个方法:

1、用fUnitRoots包中的UnitrootTests()和adfTest()。

2、用tseries包中的adf.test()和pp.test()。

用法都基本类似,可以看一下help的example。

R语言

R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。

R是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的S语言的一个分支。可以认为R是S语言的一种实现。而S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析和作图的解释型语言。

R语言的功能

R是一套完整的数据处理、计算和制图软件系统。其功能包括:数据存储和处理系统数组运算工具(其向量、矩阵运算方面功能尤其强大)完整连贯的统计分析工具优秀的统计制图功能简便而强大的编程语言:可操纵数据的输入和输出,可实现分支、循环,用户可自定义功能。

单位根检验

单位根检验是指检验序列中是否存在单位根,因为存在单位根就是非平稳时间序列了。单位根就是指单位根过程,可以证明,序列中存在单位根过程就不平稳,会使回归分析中存在伪回归。

单位根检验是随机过程的问题。定义随机序列{x_t},t=1,2,…是一单位根过程,若x_t=ρx_t-1+ε,t=1,2…其中ρ=1,{ε}为一平稳序列(白噪声),且E[ε]=0,V(ε)=σ<∞,Cov(ε,ε)=μ<∞这里τ=1,2…。特别地,若{ε}是独立同分布的,且E[ε]=0,V(ε)=σ<∞,则上式就变成一个随机游走序列,因此随机游走序列是一种最简单的单位根过程。