R语言中有哪些包可以处理批次效应

2023-02-27 00:21:02Python029

R语言中有哪些包可以处理批次效应,第1张

可以用sva包处理，

R sva包去除批次效应(batch effect)

标签：batch-effectr生物信息学

前言：sva包可以去除高通量实验中的批次效应和其它一些无关变量带来的影响。分为两个步骤：

1.鉴定和评估实验中潜在的影响变量；

2.直接应用ComBat去除已知的批次效应；

在sva包中，假定有两种变量需要考虑：1.兴趣变量（如癌症和正常对照）。2.调整变量（如：病人的性别、病人的年龄等）。另外有两种模型矩阵（model matrices):1. full model(全模型):包含以上的两种变量；2. null model：只包含调整变量。

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纽约视觉艺术学院是美国纽约市区内的著名私立艺术学院，以培养新一代艺术家、设计师、创意人才为教学使命。艺术类留学生如何申请sva？计划申请纽约视觉艺术学院的学生，怎能错过下面的内容呢？

纽约视觉艺术学院（SVA），成立于1947年，为美国规模最大的独立艺术学院，自1983年起开设现代艺术研究所的课程，成为更完善的艺术教育机构。

SVA的地理位置位于纽约市区，校舍分布于纽约上城区的东区与西区，整个纽约都是SVA学生创意思考设计资源无穷的校园所在。SVA认为，选择一所专门培养优秀艺术家来应付未来专业需求的好学校是不容易的，学生的发展结果往往在于个人的喜好、需求、能力与专业。

艺术类留学生如何申请sva？我们来看看它的申请要求吧！

申请流程

提交申请（官方网站下载）→申请费50美元→艺术作品样例→五百字目标陈述→高中成绩单→英语水平证明+财产证明。

申请要求

（1）申请费50美元；

（2）意向书500字左右，陈述为何选择来SVA学习所申请的方向；

作品集包括15-20张图 / 短片 / 电影论文等；

（3）官方成绩单；

语言成绩：本科要求雅思6.5分，托福80分；