怎么用python计算高斯定律

Python013

怎么用python计算高斯定律,第1张

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# -*- coding: utf-8 -*-

"""

Created on Tue Mar 08 16:16:36 2016

@author: SumaiWong

"""

import numpy as np

import pandas as pd

from numpy import dot

from numpy.linalg import inv

iris = pd.read_csv('D:\iris.csv')

dummy = pd.get_dummies(iris['Species']) # 对Species生成哑变量

iris = pd.concat([iris, dummy], axis =1 )

iris = iris.iloc[0:100, :] # 截取前一百行样本

X = iris.ix[:, 0:4]

Y = iris['setosa'].reshape(len(iris), 1) #整理出X矩阵 和 Y矩阵

def GDA(Y, X):

theta1 = Y.mean() #类别1的比例

theta0 = 1-Y.mean() #类别2的比例

mu1 = X[Y==1].mean() #类别1特征的均值向量

mu0 = X[Y==0].mean() #类别2特征的均值向量

X_1 = X[Y==1]

X_0 = X[Y==0]

A = dot(X_1.T, X_1) - len(Y[Y==1])*dot(mu1.reshape(4,1), mu1.reshape(4,1).T)

B = dot(X_0.T, X_0) - len(Y[Y==0])*dot(mu0.reshape(4,1), mu0.reshape(4,1).T)

sigma = (A+B)/len(X) #sigma = X'X-n(X.bar)X.bar'=X'[I-1/n 1 1]X

return theta1, theta0, mu1, mu0, sigma

1. 不同类型的参数简述

#这里先说明python函数调用得语法为:

复制代码

代码如下:

func(positional_args,

keyword_args,

*tuple_grp_nonkw_args,

**dict_grp_kw_args)

#为了方便说明,之后用以下函数进行举例

def test(a,b,c,d,e):

print a,b,c,d,e

举个例子来说明这4种调用方式得区别:

复制代码

代码如下:

#

#positional_args方式

>>>

test(1,2,3,4,5)

1 2 3 4 5

#这种调用方式的函数处理等价于

a,b,c,d,e = 1,2,3,4,5

print a,b,c,d,e

#

#keyword_args方式

>>>

test(a=1,b=3,c=4,d=2,e=1)

1 3 4 2 1

#这种处理方式得函数处理等价于

a=1

b=3

c=4

d=2

e=1

print a,b,c,d,e

#

#*tuple_grp_nonkw_args方式

>>>

x = 1,2,3,4,5

>>>test(*x)

1 2 3 4

5

#这种方式函数处理等价于

复制代码

代码如下:

a,b,c,d,e = x

print

a,b,c,d,e

#特别说明:x也可以为dict类型,x为dick类型时将键传递给函数

>>>y

{'a': 1,

'c': 6, 'b': 2, 'e': 1, 'd': 1}

>>>test(*y)

a c b e d

#

#**dict_grp_kw_args方式

>>>

y

{'a': 1, 'c': 6, 'b': 2, 'e': 1, 'd': 1}

>>>test(**y)

1 2 6

1 1

#这种函数处理方式等价于

a = y['a']

b = y['b']

... #c,d,e不再赘述

print

a,b,c,d,e

2.

不同类型参数混用需要注意的一些细节

接下来说明不同参数类型混用的情况,要理解不同参数混用得语法需要理解以下几方面内容.

首先要明白,函数调用使用参数类型必须严格按照顺序,不能随意调换顺序,否则会报错. 如 (a=1,2,3,4,5)会引发错误,

(*x,2,3)也会被当成非法.

其次,函数对不同方式处理的顺序也是按照上述的类型顺序.因为#keyword_args方式和**dict_grp_kw_args方式对参数一一指定,所以无所谓顺序.所以只需要考虑顺序赋值(positional_args)和列表赋值(*tuple_grp_nonkw_args)的顺序.因此,可以简单理解为只有#positional_args方式,#*tuple_grp_nonkw_args方式有逻辑先后顺序的.

最后,参数是不允许多次赋值的.

举个例子说明,顺序赋值(positional_args)和列表赋值(*tuple_grp_nonkw_args)的逻辑先后关系:

复制代码

代码如下:

#只有在顺序赋值,列表赋值在结果上存在罗辑先后关系

#正确的例子1

>>>x =

{3,4,5}

>>>test(1,2,*x)

1 2 3 4 5

#正确的例子2

>>>

test(1,e=2,*x)

1 3 4 5 2

#错误的例子

>>>test(1,b=2,*x)

Traceback (most recent call

last):

File "<stdin>", line 1, in <module>

TypeError: test()

got multiple values for keyword argument 'b'

#正确的例子1,处理等价于

a,b = 1,2 #顺序参数

c,d,e = x #列表参数

print a,b,c,d,e

#正确的例子2,处理等价于

a = 1 #顺序参数

e = 2 #关键字参数

b,c,d = x #列表参数

#错误的例子,处理等价于

a = 1 #顺序参数

b = 2 #关键字参数

b,c,d = x

#列表参数

#这里由于b多次赋值导致异常,可见只有顺序参数和列表参数存在罗辑先后关系

函数声明区别

理解了函数调用中不同类型参数得区别之后,再来理解函数声明中不同参数得区别就简单很多了.

1. 函数声明中的参数类型说明

函数声明只有3种类型, arg, *arg , **arg 他们得作用和函数调用刚好相反.

调用时*tuple_grp_nonkw_args将列表转换为顺序参数,而声明中的*arg的作用是将顺序赋值(positional_args)转换为列表.

调用时**dict_grp_kw_args将字典转换为关键字参数,而声明中**arg则反过来将关键字参数(keyword_args)转换为字典.

特别提醒:*arg

和 **arg可以为空值.

以下举例说明上述规则:

复制代码

代码如下:

#arg, *arg和**arg作用举例

def

test2(a,*b,**c):

print a,b,c

#

#*arg 和

**arg可以不传递参数

>>>test2(1)

1 () {}

#arg必须传递参数

>>>

test2()

Traceback (most recent call last):

File "<stdin>", line 1,

in <module>

TypeError: test2() takes at least 1 argument (0 given)

#

#*arg将顺positional_args转换为列表

>>>

test2(1,2,[1,2],{'a':1,'b':2})

1 (2, [1, 2], {'a': 1, 'b': 2})

{}

#该处理等价于

a = 1 #arg参数处理

b = 2,[1,2],{'a':1,'b':2} #*arg参数处理

c =

dict() #**arg参数处理

print a,b,c

#

#**arg将keyword_args转换为字典

>>>

test2(1,2,3,d={1:2,3:4}, c=12, b=1)

1 (2, 3) {'c': 12, 'b': 1, 'd': {1: 2, 3:

4}}

#该处理等价于

a = 1 #arg参数处理

b= 2,3 #*arg参数处理

#**arg参数处理

c =

dict()

c['d'] = {1:2, 3:4}

c['c'] = 12

c['b'] = 1

print

a,b,c

2. 处理顺序问题

函数总是先处理arg类型参数,再处理*arg和**arg类型的参数.

因为*arg和**arg针对的调用参数类型不同,所以不需要考虑他们得顺序.

复制代码

代码如下:

def test2(a,*b,**c):

print

a,b,c

>>>test2(1, b=[1,2,3], c={1:2, 3:4},a=1)

Traceback (most

recent call last):

File "<stdin>", line 1, in

<module>

TypeError: test2() got multiple values for keyword argument

'a'

#这里会报错得原因是,总是先处理arg类型得参数

#该函数调用等价于

#处理arg类型参数:

a = 1

a = 1

#多次赋值,导致异常

#处理其他类型参数

...

print a,b,c

>>>def foo(x,y):

... def bar():

... print

x,y

... return bar

...

#查看func_closure的引用信息

>>>a =

[1,2]

>>>b = foo(a,0)

>>>

b.func_closure[0].cell_contents

[1, 2]

>>>

b.func_closure[1].cell_contents

0

>>>b()

[1, 2] 0

#可变对象仍然能被修改

>>>a.append(3)

>>>

b.func_closure[0].cell_contents

[1, 2, 3]

>>>b()

[1, 2, 3] 0

利用python进行线性回归

理解什么是线性回归

线性回归也被称为最小二乘法回归(Linear Regression, also called Ordinary Least-Squares (OLS) Regression)。它的数学模型是这样的:

y = a+ b* x+e

其中,a 被称为常数项或截距;b 被称为模型的回归系数或斜率;e 为误差项。a 和 b 是模型的参数。

当然,模型的参数只能从样本数据中估计出来:

y'= a' + b'* x

我们的目标是选择合适的参数,让这一线性模型最好地拟合观测值。拟合程度越高,模型越好。

那么,接下来的问题就是,我们如何判断拟合的质量呢?

这一线性模型可以用二维平面上的一条直线来表示,被称为回归线。

模型的拟合程度越高,也即意味着样本点围绕回归线越紧密。

如何计算样本点与回归线之间的紧密程度呢?

高斯和勒让德找到的方法是:被选择的参数,应该使算出来的回归线与观测值之差的平房和最小。用函数表示为:

这被称为最小二乘法。最小二乘法的原理是这样的:当预测值和实际值距离的平方和最小时,就选定模型中的两个参数(a 和 b)。这一模型并不一定反映解释变量和反应变量真实的关系。但它的计算成本低;相比复杂模型更容易解释。

模型估计出来后,我们要回答的问题是:

我们的模型拟合程度如何?或者说,这个模型对因变量的解释力如何?(R2)

整个模型是否能显著预测因变量的变化?(F 检验)

每个自变量是否能显著预测因变量的变化?(t 检验)

首先回答第一个问题。为了评估模型的拟合程度如何,我们必须有一个可以比较的基线模型。

如果让你预测一个人的体重是多少?在没有任何额外信息的情况下,你可能会用平均值来预测,尽管会存在一定误差,但总比瞎猜好。

现在,如果你知道他的身高信息,你的预测值肯定与平均值不一样。额外信息相比平均值更能准确地预测被预测的变量的能力,就代表模型的解释力大小。

上图中,SSA 代表由自变量 x 引起的 y 的离差平方和,即回归平方和,代表回归模型的解释力;SSE 代表由随机因素引起的 y 的离差平方和,即剩余平方和,代表回归模型未能解释的部分;SST 为总的离差平方和,即我们仅凭 y 的平均值去估计 y 时所产生的误差。

用模型能够解释的变异除以总的变异就是模型的拟合程度:

R2=SSA/SST=1-SSE

R2(R 的平方)也被称为决定系数或判定系数。

第二个问题,我们的模型是否显著预测了 y 的变化?

假设 y 与 x 的线性关系不明显,那么 SSA 相对 SSE 占有较大的比例的概率则越小。换句话说,在 y 与 x 无线性关系的前提下,SSA 相对 SSE 的占比越高的概率是越小的,这会呈现一定的概率分布。统计学家告诉我们它满足 F 分布,就像这样:

如果 SSA 相对 SSE 占比较大的情况出现了,比如根据 F 分布,这个值出现的概率小于 5%。那么,我们最好是拒绝 y 与 x 线性关系不显著的原始假设,认为二者存在显著的线性关系较为合适。

第三个问题,每个自变量是否能显著预测因变量的变化?换句话说,回归系数是否显著?

回归系数的显著性检验是围绕回归系数的抽样分布(t 分布)来进行的,推断过程类似于整个模型的检验过程,不赘言。

实际上,对于只有一个自变量的一元线性模型,模型的显著性检验和回归系数的检验是一致的,但对于多元线性模型来说,二者就不能等价了。

利用 statsmodels 进行最小二乘回归

#导入相应模块

In [1]: import numpy as np

In [2]: import pandas as pd

In [3]: import statsmodels.api as sm

#将数据导入 pandas 的 dataframe 对象,第一列(年份)作为行标签

In [4]: df=pd.read_csv('/Users/xiangzhendong/Downloads/vincentarelbundock-Rdatasets-1218370/csv/datasets/longley.csv', index_col=0)

#查看头部数据

In [5]: df.head()

Out[5]:

GNP.deflator      GNP  Unemployed  Armed.Forces  Population  Year  \

1947          83.0  234.289       235.6         159.0     107.608  1947

1948          88.5  259.426       232.5         145.6     108.632  1948

1949          88.2  258.054       368.2         161.6     109.773  1949

1950          89.5  284.599       335.1         165.0     110.929  1950

1951          96.2  328.975       209.9         309.9     112.075  1951

Employed

1947    60.323

1948    61.122

1949    60.171

1950    61.187

1951    63.221

#设置预测变量和结果变量,用 GNP 预测 Employed

In [6]: y=df.Employed #结果变量

In [7]: X=df.GNP #预测变量

#为模型增加常数项,即回归线在 y 轴上的截距

In [8]: X=sm.add_constant(X)

#执行最小二乘回归,X 可以是 numpy array 或 pandas dataframe(行数等于数据点个数,列数为预测变量个数),y 可以是一维数组(numpy array)或 pandas series

In [10]: est=sm.OLS(y,X)

使用 OLS 对象的 fit() 方法来进行模型拟合

In [11]: est=est.fit()

#查看模型拟合的结果

In [12]: est.summary()

Out[12]:

#查看最终模型的参数

In [13]: est.params

Out[13]:

const    51.843590

GNP       0.034752

dtype: float64

#选择 100 个从最小值到最大值平均分布(equally spaced)的数据点

In [14]: X_prime=np.linspace(X.GNP.min(), X.GNP.max(),100)[:,np.newaxis]

In [15]: X_prime=sm.add_constant(X_prime)

#计算预测值

In [16]: y_hat=est.predict(X_prime)

In [17]: plt.scatter(X.GNP, y, alpha=0.3) #画出原始数据

#分别给 x 轴和 y 轴命名

In [18]: plt.xlabel("Gross National Product")

In [19]: plt.ylabel("Total Employment")

In [20]: plt.plot(X_prime[:,1], y_hat, 'r', alpha=0.9) #添加回归线,红色

多元线性回归(预测变量不止一个)

我们用一条直线来描述一元线性模型中预测变量和结果变量的关系,而在多元回归中,我们将用一个多维(p)空间来拟合多个预测变量。下面表现了两个预测变量的三维图形:商品的销量以及在电视和广播两种不同媒介的广告预算。

数学模型是:

Sales = beta_0 + beta_1*TV + beta_2*Radio

图中,白色的数据点是平面上的点,黑色的数据点事平面下的点。平面的颜色是由对应的商品销量的高低决定的,高是红色,低是蓝色。

利用 statsmodels 进行多元线性回归

In [1]: import pandas as pd

In [2]: import numpy as np

In [3]: import statsmodels.api as sm

In [4]: df_adv=pd.read_csv('g.csv',index_col=0)

In [6]: X=df_adv[['TV','Radio']]

In [7]: y=df_adv['Sales']

In [8]: df_adv.head()

Out[8]:

TV  Radio  Newspaper  Sales

1  230.1   37.8       69.2   22.1

2   44.5   39.3       45.1   10.4

3   17.2   45.9       69.3    9.3

4  151.5   41.3       58.5   18.5

5  180.8   10.8       58.4   12.9

In [9]: X=sm.add_constant(X)

In [10]: est=sm.OLS(y,X).fit()

In [11]: est.summary()

Out[11]:

你也可以使用 statsmodels 的 formula 模块来建立多元回归模型

In [12]: import statsmodels.formula.api as smf

In [13]: est=smf.ols(formula='Sales ~ TV + Radio',data=df_adv).fit()

处理分类变量

性别或地域都属于分类变量。

In [15]: df= pd.read_csv('httd.edu/~tibs/ElemStatLearn/datasets/SAheart.data', index_col=0)

In [16]: X=df.copy()

利用 dataframe 的 pop 方法将 chd 列单独提取出来

In [17]: y=X.pop('chd')

In [18]: df.head()

Out[18]:

sbp  tobacco   ldl  adiposity  famhist  typea  obesity  alcohol  \

row.names

1          160    12.00  5.73      23.11  Present     49    25.30    97.20

2          144     0.01  4.41      28.61   Absent     55    28.87     2.06

3          118     0.08  3.48      32.28  Present     52    29.14     3.81

4          170     7.50  6.41      38.03  Present     51    31.99    24.26

5          134    13.60  3.50      27.78  Present     60    25.99    57.34

age  chd

row.names

1           52    1

2           63    1

3           46    0

4           58    1

5           49    1

In [19]: y.groupby(X.famhist).mean()

Out[19]:

famhist

Absent     0.237037

Present    0.500000

Name: chd, dtype: float64

In [20]: import statsmodels.formula.api as smf

In [21]: df['famhist_ord']=pd.Categorical(df.famhist).labels

In [22]: est=smf.ols(formula="chd ~ famhist_ord", data=df).fit()

分类变量的编码方式有许多,其中一种编码方式是虚拟变量编码(dummy-encoding),就是把一个 k 个水平的分类变量编码成 k-1 个二分变量。在 statsmodels 中使用 C 函数实现。

In [24]: est=smf.ols(formula="chd ~ C(famhist)", data=df).fit()

In [26]: est.summary()

Out[26]:

处理交互作用

随着教育年限(education)的增长,薪酬 (wage) 会增加吗?这种影响对男性和女性而言是一样的吗?

这里的问题就涉及性别与教育年限的交互作用。

换言之,教育年限对薪酬的影响是男女有别的。

#导入相关模块

In [1]: import pandas as pd

In [2]: import numpy as np

In [4]: import statsmodels.api as sm

#导入数据,存入 dataframe 对象

In [5]: df=pd.read_csv('/Users/xiangzhendong/Downloads/pydatafromweb/wages.csv')

In [6]: df[['Wage','Education','Sex']].tail()

Out[6]:

Wage  Education  Sex

529  11.36         18    0

530   6.10         12    1

531  23.25         17    1

532  19.88         12    0

533  15.38         16    0

由于性别是一个二分变量,我们可以绘制两条回归线,一条是 sex=0(男性),一条是 sex=1(女性)

#绘制散点图

In [7]: plt.scatter(df.Education,df.Wage, alpha=0.3)

In [9]: plt.xlabel('education')

In [10]: plt.ylabel('wage')

#linspace 的作用是生成从最小到最大的均匀分布的 n 个数

In [17]: education_linspace=np.linspace(df.Education.min(), df.Education.max(),100)

In [12]: import statsmodels.formula.api as smf

In [13]: est=smf.ols(formula='Wage ~ Education + Sex', data=df).fit()

In [18]: plt.plot(education_linspace, est.params[0]+est.params[1]education_linspace+est.params[2]0, 'r')

In [19]: plt.plot(education_linspace, est.params[0]+est.params[1]education_linspace+est.params[2]1, 'g')

以上两条线是平行的。这是因为分类变量只影响回归线的截距,不影响斜率。

接下来我们可以为回归模型增加交互项来探索交互效应。也就是说,对于两个类别,回归线的斜率是不一样的。

In [32]: plt.scatter(df.Education,df.Wage, alpha=0.3)

In [33]: plt.xlabel('education')

In [34]: plt.ylabel('wage')

#使用*代表我们的回归模型中除了交互效应,也包括两个变量的主效应;如果只想看交互效应,可以用:代替,但通常不会只看交互效应

In [35]: est=smf.ols(formula='Wage ~ Sex*Education', data=df).fit()

In [36]: plt.plot(education_linspace, est.params[0]+est.params[1]0+est.params[2]education_linspace+est.params[3]0education_linspace, 'r')

In [37]: plt.plot(education_linspace, est.params[0]+est.params[1]1+est.params[2]education_linspace+est.params[3]1education_linspace, 'g')

参考资料:

DataRobot | Ordinary Least Squares in Python

DataRoboe | Multiple Regression using Statsmodels

AnalyticsVidhya | 7 Types of Regression Techniques you should know!