求问R语言怎么用ecdf的结果

Python011

求问R语言怎么用ecdf的结果,第1张

相当于一个函数,你可以看下:

x <- rnorm(1000)

y <- ecdf(x)

y(x)

plot(x,y(x), ylab = "ECDF(x)")

ks.test()实现了KS检验,可以检验任意样本是不是来自给定的连续分布。

你这里的用法就是:

ks.test(data,pt,df=df) #data是样本的数据,df是要检验的t分布的自由度

我们可以用很多方法分析一个单变量数据集的分布。最简单的办法就是直接看数

字。利用函数summary 和fivenum 会得到两个稍稍有点差异的汇总信息。此外,stem

(\茎叶"图)也会反映整个数据集的数字信息。

>attach(faithful)

>summary(eruptions)

Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.

1.600 2.163 4.000 3.488 4.454 5.100

>fivenum(eruptions)

[1] 1.6000 2.1585 4.0000 4.4585 5.1000

>stem(eruptions)

The decimal point is 1 digit(s) to the left of the |

16 | 070355555588

18 | 000022233333335577777777888822335777888

20 | 00002223378800035778

22 | 0002335578023578

24 | 00228

26 | 23

28 | 080

30 | 7

32 | 2337

34 | 250077

36 | 0000823577

38 | 2333335582225577

40 | 0000003357788888002233555577778

42 | 03335555778800233333555577778

44 | 02222335557780000000023333357778888

46 | 0000233357700000023578

48 | 00000022335800333

50 | 0370

茎叶图和柱状图相似,R 用函数hist 绘制柱状图。

>hist(eruptions)

>## 让箱距缩小,绘制密度图

>hist(eruptions, seq(1.6, 5.2, 0.2), prob=TRUE)

>lines(density(eruptions, bw=0.1))

>rug(eruptions) # 显示实际的数据点

更为精致的密度图是用函数density 绘制的。在这个例子中,我们加了一条

由density 产生的曲线。你可以用试错法(trial-and-error)选择带宽bw(bandwidth)

因为默认的带宽值让密度曲线过于平滑(这样做常常会让你得到非常有\意思"的密度

分布)。(现在已经有一些自动的带宽挑选方法2,在这个例子中bw = "SJ"给出的结

果不错。)

我们可以用函数ecdf 绘制一个数据集的经验累积分布(empirical cumulative

distribution)函数。

>plot(ecdf(eruptions), do.points=FALSE, verticals=TRUE)

显然,这个分布和其他标准分布差异很大。那么右边的情况怎么样呢,就是火山

爆发3分钟后的状况?我们可以拟合一个正态分布,并且重叠前面得到的经验累积密

度分布。

>long <- eruptions[eruptions >3]

>plot(ecdf(long), do.points=FALSE, verticals=TRUE)

>x <- seq(3, 5.4, 0.01)

>lines(x, pnorm(x, mean=mean(long), sd=sqrt(var(long))), lty=3)

分位比较图(Quantile-quantile (Q-Q) plot)便于我们更细致地研究二者的吻合

程度。

par(pty="s") # 设置一个方形的图形区域

qqnorm(long)qqline(long)

上述命令得到的QQ图表明二者还是比较吻合的,但右侧尾部偏离期望的正态分布。

我们可以用t 分布获得一些模拟数据以重复上面的过程

x <- rt(250, df = 5)

qqnorm(x)qqline(x)

这里得到的QQ图常常会出现偏离正态期望的长尾区域(如果是随机样本)。我们可以用

下面的命令针对特定的分布绘制Q-Q图

qqplot(qt(ppoints(250), df = 5), x, xlab = "Q-Q plot for t dsn")

qqline(x)

最后,我们可能需要一个比较正规的正态性检验方法。R提供了Shapiro-Wilk 检

>shapiro.test(long)

Shapiro-Wilk normality test

data: long

W = 0.9793, p-value = 0.01052

和Kolmogorov-Smirnov 检验

>ks.test(long, "pnorm", mean = mean(long), sd = sqrt(var(long)))

One-sample Kolmogorov-Smirnov test

data: long

D = 0.0661, p-value = 0.4284

alternative hypothesis: two.sided

(注意一般的统计分布理论(distribution theory)在这里可能无效,因为我们用同样

的样本对正态分布的参数进行估计的。)

转载于:

http://www.biostatistic.net/thread-2413-1-1.html

1、以R中的基础数据包iris。#数据集data<-irishead(data)x<-iris$Specieshead(x)y<-iris$Sepal.Lengthhead(y)。

2、R中的经验分布函数ecdf即可实现经验分布函数的计算。但是ecdf表示的是一个函数,对其应用后才出现函数值。

3、对于联系变量可以看到计算出的四分位数。对于分类变量,可以类别数及累计概率。

4、经验分布图可以用函数plot.ecdf,y也可以直接用plot函数。

5、最后设置图形参数,将经验分布函数图画的更美观。