R语言安装了mvstats程序包但是为什么显示不存在?

Python022

R语言安装了mvstats程序包但是为什么显示不存在?,第1张

提示压缩板卡不存在或驱动安装不正确有几种情况:

1、驱动未被正确安装,导致软件无法正确识别采集卡。

2、采集卡或PCI插槽损坏,导致系统根本未找到采集卡。

先进入“设备管理器”,看是否采集卡被系统错误地识别为了其他设备并自动加载了驱动。如果设备管理器里一切正常,也没多出什么设备,那就试着换PCI插槽确认卡或插槽是否正常。

如果采集卡被自动加载了错误的驱动,你首先得找到正确的驱动。进入WINDOWS\INF下,删掉OEM开头的所有文件,再到“设备管理器”里删掉错误的设备,“刷新”后再为卡指定正确的驱动。

加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度 协同变化 的基因集, 并根据基因集的内连性和基因集与表型之间的关联鉴定候补生物标记基因或治疗靶点。

相比于只关注差异表达的基因,WGCNA利用数千或近万个变化最大的基因或全部基因的信息识别感兴趣的基因集,并与表型进行显著性关联分析。一是充分利用了信息,二是把数千个基因与表型的关联转换为数个基因集与表型的关联,免去了多重假设检验校正的问题。

以上内容引用的网页:http://blog.genesino.com/2018/04/wgcna/#wgcna%E5%9F%BA%E6%9C%AC%E6%A6%82%E5%BF%B5

感觉WGCNA挺合自己脾气的,想安装一下。注定安装不会那么顺利。

安装了WGCNA是在Rstuio上安装的。用命令 install.packages("WGCNA")

执行完命令后,提示信息显示有三个依赖包(‘impute’, ‘preprocessCore’, ‘GO.db’)无法安装。

然后再安装那三个依赖包。

 BiocManager::install("impute"),安装impute时,也会安装GO.db包。遇到是否更新其他R包时,选择不更新 n.

>library("WGCNA")

Error: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):

 不存在叫‘preprocessCore’这个名字的程辑包

然后再安装一下‘preprocessCore’包

BiocManager::install("preprocessCore")

做完以上工作,再执行一下 >library("WGCNA").

其中提示信息:载入需要的程辑包:dynamicTreeCut  ;载入需要的程辑包:fastcluster ;载入程辑包:‘fastcluster’    意思是在使用WGCNA时,需要先载入这三个包,并且已经被直接载入了,不是错误信息。

两个办法:

1. 安装‘minqa’包,在R的命令行界面打入“install.packages(‘minqa’)”.

2. 如果上面方法不行,卸载‘car’,并且重新安装。有可能早先安装这个包的方法不对。

或者可以选择重新下载R语言软件包下载,下载地址直接搜索  rpackage就可以,或者,进去cran r,_面有packages的下载,