R语言绘制好看的饼图、空心饼图

Python017

R语言绘制好看的饼图、空心饼图,第1张

饼图或者说扇形图在统计分析结果展示中非常常用，R语言自带做饼图的函数pie，做起来非常简单，只需提供比例，样品名称即可。

默认的颜色只有6中，循环使用的，不过这个颜色可以自定义。

用pie作图其实就够了，但奈何很“卷”，有其他好看的饼图，所以接下来还是结合ggplot2与ggforce做可以变换的饼图，例如空心饼图。单独用ggplot2作图比较繁琐，不建议去尝试了，太费时间没必要。

先做一个基本的饼图。

要想得到空心饼图，只需要将geom_arc_bar参数中r0改为1即可。

想要分割饼图，geom_arc_bar中添加explode参数。

可以发现，以上作图有一个bug就是添加比例标记很麻烦，要想实现自动化需要编写函数很麻烦。参考： https://stackoverflow.com/questions/52960015/how-to-avoid-label-overlap-in-pie-chart 。可以先将每个标签角度计算好，再添加，结果还好。

好了以上就是饼图的内容了，其本质是为了统计比例，结果解读比较直观，我们也是跟风做了一些变换的图形，其实最简单的饼图就可以了，各取所需。此外，还有很多其他方法制作饼图，感兴趣的自行百度了解。

森林图（forest plot），一般是指在平面直角坐标系中，以一条垂直于X轴的无效线（通常坐标X=1或0）为中心，用若干条平行于X轴的线段，来表示每个研究的效应量大小及其95%可信区间，并用一个棱形来表示多个研究合并的效应量及可信区间，它是Meta分析中最常用的结果综合表达形式。实际上，除了Meta分析，森林图还有很多用处。森林图可以直观的反映出效应量（例如RR、OR、HR或者WMD）大小及其95% CI等。

本篇文章利用ggplot2包进行绘制森林图（严格意义上应该叫meta分析效应量图），关于ggplot2的基本用法这里不在叙述。

这里想用发表在SBB上的一篇meta分析文章（ https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.108118 ）中的图作为模板，进行绘制。

[1] https://zhuanlan.zhihu.com/p/340207465

[2] Feng, J. G., Zhu, B., 2021. Global patterns and associated drivers of priming effect in response to nutrient addition. Soil Biology and Biochemistry 153, 108118. https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.108118 .