一般在对数据取交集的时候，通常使用 韦恩图 。但韦恩图的可视范围有限，对于超过五个以上的数据集取交集会显得很凌乱。这时候就可以使用UpSetR包。
我们还能在图中描述出1970-1980年恐怖片和动作片的情况
通过 attribute.plots 参数添加属性图
参考： https://www.jianshu.com/p/324aae3d5ea4
https://mp.weixin.qq.com/s/DSyaje-nFb8o--kuzmTvaA
对于集合的可视化，第一时间想到的都是韦恩图（venn diagram），一般集合不超过5个的时候，可视化效果还是不错的
但是一旦数据集增加，比如说五个的时候，你就很难从图中解读出想要的信息了。
即便你把它画的很美观，如下图那样，还是还是很难直观找到自己需要的信息。可视化的目的不是炫技，而是快速理解数据。
还好R语言里新增了一个集合可视化 神包 --UpSetR。它可视化的结果的基础版本长下面这个样子：
上述是分析了不同电影的所属类型得到的结果。在我不告诉你任何图示信息的情况下，请思考下那种电影类型拍的最多，然后哪两种电影电影类型拍的最少。
基本上我不用过多和你解释图示，你也能很快的找到答案。图中黑色表示该位置有数据，灰色的点表示没有。不同点连线表示存在交集。具体数据可以看上面的条形图。不同类型的数据的总量看左边的条形图。
UpSetR是一个R包，这意味着你可以简单通过一行命令就能安装
UpsetR接受三种类型的数据输入：
光看文字肯定是不懂的，所以直接实战把
我们用UpSetR提供的测试数据作为演示
看下数据长什么样子
Name是不同的电影，然后不同发布时间，后面接着电影跟随的类型。
绘图用的 upset 函数：
稍微解释一下参数
更有意思的是，我们还能在图中描述出1970-1980年恐怖片和剧情片的情况
这里必须介绍一个神奇的参数 queries ：
此外还有一个参数叫做 attribute.plots 能够添加在upset的结果图中加入属性图。
这个 attribute.plots 接受各个plot函数组成的作图函数，可以用自带的，也可以自己写，只要保证里面的参数设置正确了。
其他参数就不继续演示了，因为我懒。
集合交集向量长下面这个样子
输入格式一目了然，然后数据可以用 fromExpression 进行转换
转换后的数据就可以拿去用upset作图了
我们可以对ChIP-Seq分析得到的peak进行注释
然后就可以用upsetplot画画了，太简单了。
下一期写一篇Y叔的 upsetplot 是如何写的。
韦恩图（Venn plot），又称文氏图，是英国的哲学家和数学家约翰·维恩（John Venn）在1881年发明的，主要是用于展示在不同的事物群组（集合）之间的数学或逻辑联系，尤其适合用来表示集合（或）类之间的“大致关系”，它也常常被用来帮助推导（或理解推导过程）关于集合运算（或类运算）的一些规律。在我们常用的领域，简单来说就是多个集合之间取交集。
绘制韦恩图有很多方式，R,Python,Perl等，这里主要是用R来展示；在R语言中，绘制venn图有很多包可以实现：Venn, Vennplot, VennDiagram, VennDetail, ggvenn,gplots等。
此文主要展示一下用VennDiagram包绘制高纬度的韦恩图。
这样一个简单的GUOFUYASEWANG（国服亚瑟王）的韦恩图就画出来，通过参数给他加点颜色，美观一下。
增加配色之后好看了不少。
除了用R绘制韦恩图，还可以用网站实现。 http://www.interactivenn.net/ 可以绘制2-6维的韦恩图，不需要学会R也能绘制韦恩图。同学们可以自行探索。
有时候自己需要取交集的数据集太多，韦恩图满足不了，可以采用UpSetplot，它可以将交集数目通过柱状图的方式呈现。以UpSetR包里的movies文件做示例：
这是一个3883行，21列的数据集，包含了1995上映的电影具体情况（如Action是否是运动电影，0表示不是运动电影，1表示是运动电影，以此类推）
该图中 黑色 表示该位置有数据， 灰色 的点表示没有， 不同点连线 表示存在 交集 ， 不同 柱状图 表示不同的 数目
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