时间序列是否平稳,ARMA(p,q)中的p,q的确定,这些方法在王文圣,丁晶等著作《随机水文学》中有详细介绍,中国水利水电出版社,第二版,你所提及的内容都有介绍,相信你会搞定!
有现成的包:matchprobes包 里面有个函数basecontent(seq)计算4中碱基每种的含量;自己做的话:
#List是你的序列
unlist(strsplit(List,""))->sep.letter#把每个字母都单独分开
#遍历所有字母
count_a=0count_g=0count_t=0count_c=0
for(i in 1:length(sep.letter)){
if(sep.letter[i]=="a"){count_a=count_a+1}
if(sep.letter[i]=="g"){count_g=count_g+1}
.........................
}