R语言自学笔记-3设置路径、R包操作

Python013

R语言自学笔记-3设置路径、R包操作,第1张

#设置默认路径

#显示当前工作目录（软件默认使用工作目录）

getwd()

#修改默认工作目录

setwd(dir = "e:/Rwork/")

#提示工作目录

getwd()

#查看目录下包含的文件

list.files()

#或者

dir()

#R包安装

install.packages("vcd")

#显示库所在的位置

.libPaths()

#显示库里有哪些安装包

library()

#载入包

library(vcd)

#or

require(vcd)

#直接输入函数看某些函数来自于R的哪个包

#如何使用R包

help(package="vcd")

help(package="ggplot2")

#查看包的信息，列出R包的基础内容，显示内置的数据集的内容，给包中的函数作为案例来使用

library(help="vcd")

#还有一些包中的函数，是包的核心内容，扩展了R的功能

Arthritis

#列出包中所有包含的函数

ls("package:vcd")

#每个函数如何使用查看对应帮助文档

#列出R包中包含的所有数据集

data(package="vcd")

#使用完一个包之后，将包从内存中移除

detach("package:vcd")

#再使用

Arthritis

#会出现报错：需要重新再加载

#删除已安装的包

remove.packages("vcd")

#会将R包从硬盘上彻底删除，无法继续使用了，用得不多

#R包的批量移植（更换新设备）

#列出当前环境中已安装的R包

installed.packages()

#取第一列,,,使用下标来访问数据框的第一列

installed.packages()[,1]

#将所以R包名字保存到一个文件中

Rpack<- installed.packages()[,1]

save(Rpack,file = "Rpack.Rwork")

#将这个文件移到另一个设备上

#在另一个设备上使用load函数打开这个文件

#存到另外一个变量Rpack中

#看到这些R包

#Rpack

#批量安装这些R包

#使用一个for循环

for(i in Rpack)install.packages(i)

#如何获取R的帮助信息

help.start()

#查看某个函数的功能

help(sum)

#or

?plot

?sum

#快速了解函数参数而不想查阅详细文档

args(plot)

#查看函数使用案例

example(mean)

example("hist")

#列出R的一些案例图

demo(graphics)

#查看R安装的某个包的帮助文档

help(package=ggplot2)

#有些R包包含vignette文档，这中文档包含更多内容，也更加规范，里面有简介、教程、开发文档等

vignette()

#不是每个包都包含这种格式的文档

vignette("xts")

#有时安装了某包但使用help命令搜索不到相关函数，是因为没有载入这个包

#需用使用library函数载入这个包

#载入之后才能使用help函数找到相关文档

#或者直接在help命令中加上package选项  等于  要搜索R包的名字，这种方法比较麻烦

#？？接要搜索函数名字，这种情况下不加载包也可以

#有些情况下，不知道具体的函数名，只能模糊搜索

#查找与绘制热图相关的帮助信息(使用这条命令进行本地搜索)

help.search(heatmap)

#提示搜索不到

#因为需要加上引号

help.search("heatmap")

#搜到stats包中的heatmap函数，可以用来绘制热图

#help.search("heatmap")也可以简写成下面一条命令

??heatmap#不需要加引号

#列出所有包含关键字的内容

apropos("sum")

#可以通过mod参数调整查询的内容

apropos("sum",mod="function")#只列出函数

#help.search或？？都是进行本地的文档搜索

#有时搜索不到或者文档太老了可以使用RSiteSearch()函数进行网络搜索

RSiteSearch(matlab)

#运行函数会使用默认浏览器来访问R官网，在官网中进行搜索，列出更多的结果

#可以利用搜索引擎进行问题搜索

可以试下ComplexHeatmap package在这里面可以修改

支持各种heatmap编辑方式，包括字体，标注，分类，多图比较，甚至可以交互选取部分样本进行比较。

YouTube 使用教程：

Plotting in R for Biologists -- Lesson 8: Heatmapswww.youtube.com/watch?v=gu9pTq9U2iU&t=211s

.

打开R语言,输入命令删除其他一切数据:rm(list=ls(all=TRUE)),并且输入命令CTRL和L,删除不必要的显示的信息。

2.

加法运算 加法运算的主体可以是数字,也可以是复杂的向量。 例如,输入2+5,可以马上得到结果!

3.

加法运算: 同加法运算很相似、如:要得到7-2的结果,直接在控制台中输入 7-2 回车可以得到结果5

4.

乘法运算 在R语言中,乘号用"*"代替。如计算2乘以4的结果在控制台中输入 2*4 回车后得到8

for循环结构语法：

其中var表示循环变量，seq为向量，expr为执行的语句。

例1 下面我们通过for循环来计算

因此

例2 Fibonacc数列为： ，求Fibonacc数列前50项的和。

运行结果

因此Fibonacc数列前50项的和为32951280098。