R语言实战package总结

Python06

R语言实战package总结,第1张

Hmisc 包的 minor.tick( )   _______包的_______函数可以添加次要刻度线

Hmisc 包中的 describe()函数 ______包的_______函数可返回变量和观测的数量、info 值、缺失值和唯一值的数目、平均值、分位数,以及五个最大的值和五个最小的值

reshape 包/reshape2 包  ________包是一套重构和整合数据集的万能工具 

vcd 包   Arthritis 数据集;

sm 包  sm.density.compare(x, factor)  _______包中的_______函数可向图形叠加两组或更多的核密度图

pastecs 包中有一个名为 stat.desc()的函数

Hmisc 包中的 describe()函数 ______包的_______函数可返回变量和观测的数量、info 值、缺失值和唯一值的数目、平均值、分位数,以及五个最大的值和五个最小的值

psych 包的 describe()的函数   ______包的_______函数可以计算非缺失值的数量、平均数、标准差、中位数、截尾均值、绝对中位差、最小值、最大值、值域、偏度、峰度和平均值的标准误。

doBy 包 的summaryBy  doBy 包中的_______函数可以分组计算概述统计量

psych 包 describe.by

vcd 包的 assocstats()函数  _______包中的_______函数可以用来计算二维列联表的 phi 系数、列联系数和 Cramer’s V 系数

ggm 包的 pcor()函数    _______包的________函数可以计算偏相关系数

psych 包的 corr.test()   _______包的________函数可以为 Pearson、Spearman 或 Kendall 相关计算相关矩阵,同时报告显著性水平

1. 列出包所在库的路径

.libPaths()

[1] "C:/Program Files/R/R-3.0.2/library"

2. 安装包,括号里面包的名称要加英文引号,在列出的CRAN镜像站点列表中选择一个进行下载,我一般选的是China(Hefei)

install.packages()

例如,install.packages("ggplot2")

3. 包的载入library()或require(),安装完包后,需要加载才能使用其中的函数,此时括号中不使用引号。两者的不同之处在于library()载入之后不返回任何信息,而require()载入后则会返回TRUE,因此require()适合用于程序的书写。

例如

library(ggplto2)

>require(foreign)

Loading required package: foreign

>is.logical(require(foreign))

[1] TRUE

4. 包的更新

update.packages()

5. 包的帮助信息 格式如下,可以查看包中的函数以及说明

help(package="ggplot2")

6. 查看本地的包

6.1 查看默认加载的包,忽略基本的包

getOption("defaultPackages")

>getOption("defaultPackages")

[1] "datasets" "utils" "grDevices" "graphics" "stats" "methods"

[7] "ggplot2"

6.2 查看当前已经加载过的包

(.packages())

[1] "ggplot2" "stats" "graphics" "grDevices" "utils" "datasets" "methods" "base"

6.3 要显示所有可用的包

(.packages(all.available=TRUE))

>(.packages(all.available=TRUE))

[1] "abind" "agricolae" "aplpack" "base" "bitops"

[6] "boot" "car" "caTools" "class" "cluster"

[11] "codetools" "colorRamps" "colorspace" "compiler" "datasets"

[16] "Defaults" "devtools" "dichromat" "digest" "doBy"

[21] "e1071" "effects" "ellipse" "evaluate" "foreign"

[26] "formatR" "Formula" "gdata" "ggplot2" "ggthemes"

[31] "gmodels" "gplots" "graphics" "grDevices" "grid"

[36] "gtable" "gtools" "highr" "Hmisc" "httr"

[41] "KernSmooth" "knitr" "labeling" "lattice" "latticeExtra"

[46] "leaps" "lme4" "lmtest" "LSD" "manipulate"

[51] "markdown" "MASS" "Matrix" "matrixcalc" "memoise"

[56] "methods" "mgcv" "minqa" "multcomp" "munsell"

[61] "mvtnorm" "nlme" "nnet" "nortest" "parallel"

[66] "pixmap" "plyr" "proto" "psych" "quantmod"

[71] "Rcmdr" "RColorBrewer" "Rcpp" "RcppEigen" "RCurl"

[76] "relimp" "reshape2" "rgl" "rJava" "RODBC"

[81] "rpart" "rstudio" "samplesize" "sandwich" "scales"

[86] "schoolmath" "sciplot" "sem" "spatial" "splines"

[91] "stats" "stats4" "stringr" "survival" "tcltk"

[96] "tcltk2" "TH.data" "tools" "TTR" "utils"

[101] "VennDiagram" "whisker" "XLConnect" "xts" "zoo"

7. 卸载包detach(),这是library()的反向操作,此操作主要是为了避免某些包中的函数名称相同,造成冲突,注意与library()的参数不同,detach()参数为detach(package:包的名称),library(包的名称)。

例如

>library(ggplot2) #加载包

>(.packages()) #列出当前已经加载的包

[1] "ggplot2" "stats" "graphics" "grDevices" "utils" "datasets"

[7] "methods" "base"

>detach(package:ggplot2) # 卸载ggplot2包

>(.packages()) #列出当前已经加载的包

[1] "stats" "graphics" "grDevices" "utils" "datasets" "methods"

[7] "base"

8. 自定义启动时候的加载包

如果需要长期使用某个包的话,每次开启都需要输入library(),比较麻烦,因此可以让R启动时自动加载某些包。在R的安装目录/etc/Rprofile.site加入下载语句:

例如让R启动时自动加载ggplot2包

local({old <- getOption("defaultPackages")

options(defaultPackages = c(old, "ggplot2"))})

9. 在文章中引用R软件包,例如引用ggplot2包:

citation(package="ggplot2")

To cite ggplot2 in publications, please use:

H. Wickham. ggplot2: elegant graphics for data analysis. Springer New

York, 2009.

A BibTeX entry for LaTeX users is

@Book{,

author = {Hadley Wickham},

title = {ggplot2: elegant graphics for data analysis},

publisher = {Springer New York},

year = {2009},

isbn = {978-0-387-98140-6},

url = {http://had.co.nz/ggplot2/book},

}

第一步:安装合适版本的R软件,安装对应版本的Rtools,安装Rstudio,安装Miketex软件(这些软件均可从官网下载)。 第二步:打开R软件,选择镜像,安装“devtools”,具体可从R——程序包——安装程序包上进行,也可以使用install.packages("devtools"...