用R语言对vcf文件进行数据挖掘.3 从vcf文件里提取有用信息目录 一般的VCF文件都很大,用手动提取里面的信息肯定不大现实。用 vcfR 就可以轻松实现。vcfR 自带测试文件 vcfR_test 。就用这个文件来操作一下吧。 在分区 Genotype 里,通过观察 FORMAT 列可以看到2023-03-10Python160
R语言学习笔记之聚类分析R语言学习笔记之聚类分析使用k-means聚类所需的包:factoextracluster #加载包library(factoextra)library(cluster)l#数据准备使用内置的R数据集USArrests#load t2023-02-26Python120
C语言中,n%r与nr结果又什么不一样的?若n与r都是整型变量,C语言中,n%r的结果是n除以r的余数;nr是n除以r的商的整数部分例如:26÷16=1......10int n=26,r=16printf("%d%d=%d%d%%%d=%dn",n,2023-02-26Python130
主题:请教R语言怎样添加趋势线在excel图表中添加趋势线”的操作步骤是:1、以Excel 2016为例,打开Excel工作表;2、根据数据生成的散点图,图表没有返回数据之间的关系,需要在图表中根据数据点生成趋势线;二重积分∫∫f(x,y)dxdy的几何意义是以积分区域2023-02-24Python660
python 弹出式对话框不知道你用的什么版本,我修改了一下,测试通过(python2.7):# coding=utf-8import Tkinterimport tkMessageBoxdef show(): tkMessageBox.showinfo(t2023-02-24Python660
用R语言对vcf文件进行数据挖掘.3 从vcf文件里提取有用信息目录 一般的VCF文件都很大,用手动提取里面的信息肯定不大现实。用 vcfR 就可以轻松实现。vcfR 自带测试文件 vcfR_test 。就用这个文件来操作一下吧。 在分区 Genotype 里,通过观察 FORMAT 列可以看到2023-02-23Python80
用R语言对vcf文件进行数据挖掘.5 vcf可视化1目录 本文介绍的案例和方法简介里一样,但是会有更加详细的说明。 和之前一样使用 pinfsc50 包里的数据。vcf数据,参考序列的fasta数据,还有gff格式的注释数据。 然后蹦出来一段警告文create.chrom2023-02-23Python100
如何用R语言在数据中提取指定列数据,并且形成一个新的数据表1、分析数据表:通过浏览“入库明细”表,我们可能看到入库明细表中,作为提取记录的条件零件号在A列。需要提取的记录,入库日期在H列、入库单号在O列、最后生产批号在L列、入库前库存数在Q列。为DC000496ZL的记录有5条(截图中的4条是指上2023-02-23Python160
用R语言对vcf文件进行数据挖掘.7 测序深度覆盖度目录 vcf数据里除了位点的ATGC的对比,进行纯合杂合判断的以外。还有一个重要的项目就是 DP ,测序深度。测序深度不仅是看测序质量的重要参考,也是对染色体倍数体以及基因拷贝数进行评估的重要指标。 一般的VCF文件都很大,用手动2023-02-22Python110
用R语言对vcf文件进行数据挖掘.3 从vcf文件里提取有用信息目录 一般的VCF文件都很大,用手动提取里面的信息肯定不大现实。用 vcfR 就可以轻松实现。vcfR 自带测试文件 vcfR_test 。就用这个文件来操作一下吧。 在分区 Genotype 里,通过观察 FORMAT 列可以看到2023-02-21Python130