嵌套Venn图的绘制(R语言)如何在差异基因Venn图中同时标识上下调基因数量信息韦恩(Venn)图是常见统计图之一,用于展示各样本(或分组)之间共有(或特有)元素的数量(或比例)。例如做RNA-seq的最直接目的,大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到多2023-02-27Python140
Java 可不可以做图像识别的系统当然可以。一、纯JAVA开发的技术可行性,即JAVA是否能够实现图像识别的各种算法。二、如果第一点没有问题,纯JAVA与C++相比,开发效率上的差异。效率要低很多,和具体问题有关。三、如果第一点没有问题且第二点差异不太大时,纯JAVA与C+2023-02-27Python200
R语言初学笔记:差异表达基因setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ2023-02-27Python200
《R语言实战》自学笔记44-t检验数据准备t检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n <30),总体标准差σ未知的正态分布。t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均2023-02-27Python140
R语言DESeq2基因差异表达分析经过表达定量后,我们已经得到了基因的表达量矩阵,差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通常都是在R中,常用的有DESeq2,edgeR,limma等几种,这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。 需2023-02-27Python160
R语言DESeq2基因差异表达分析经过表达定量后,我们已经得到了基因的表达量矩阵,差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通常都是在R中,常用的有DESeq2,edgeR,limma等几种,这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。 需2023-02-27Python90
r语言怎么将.rda文件传递给服务器JAVA 遍历文件夹下的所有文件(递归调用和非递归调用)1.不使用递归的方法调用。public void traverseFolder1(String path) {int fileNum = 0, folderNum = 0File fi2023-02-27Python140
r语言combn函数在python中是什么itertools.product。r语言combn函数是一种排列组合的函数,python中排列组合的函数是itertools.product(sequence,repeat)。combn只是给出所有可能的组合情况,按原数据的顺序排列的。x2023-02-27Python160
《R语言实战》自学笔记44-t检验数据准备t检验,亦称student t检验(Student's t test),主要用于样本含量较小(例如n <30),总体标准差σ未知的正态分布。t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均2023-02-27Python160
差异表达1|edgeR和DeSeq21. 过滤低表达的基因仅保留在两个样品或更多样本中CPM>1的基因CPM=Reads(total reads in the sample1,000,000)问题:会受到测序深度的影响 2. 选择一2023-02-27Python130
python之哈希算法哈希(Hash)算法:`hash(object)` 哈希算法将一个不定长的输入,通过散列函数变换成一个定长的输出,即散列值。是一种信息摘要算法。对象的hash值比原对象拥有更低的内存复杂度。 它不同于加密。哈希(hash)是将目标文2023-02-27Python160
相似图片检测:感知哈希算法之dHash的Python实现某些情况下,我们需要检测图片之间的相似性,进行我们需要的处理:删除同一张图片、标记盗版等。 如何判断是同一张图片呢?最简单的方法是使用加密哈希(例如MD5, SHA-1)判断。但是局限性非常大。例如一个txt文档,其MD5值是根据这个2023-02-26Python170
R语言:clusterProfiler进行GO富集分析和Gene_ID转换ID转换用到的是 bitr() 函数,bitr()的使用方法: org.Hs.eg.db包含有多种gene_name的类型keytypes() :keytypes(x),查看注释包中可以使用的类型columns() :2023-02-26Python160
R语言初学笔记:差异表达基因setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ2023-02-26Python150
统计方法的选择(4)--事后检验前面几篇通过参数检验和非参数检验对多组数据进行检验后,发现有差异,那么究竟是哪几个之间有差异,这就涉及到本篇所讲的事后检验或者事后两两检验。真如前面几篇中写的,事后检验和compare_means()和stat_compare_means(2023-02-26Python250
python怎么处理二进制流可以的,二进制是计算机内的表示方法,处理二进制数据是最基本的能力。如果是二进制字符串转十进制:>>>x='10101010'>>>int(x,2)12023-02-26Python110
float在python中的用法我们知道数字有很多种类型,比如整数和浮点数。在讨论字符串值时,我们将需要使用浮点值的形式,因此我们需要用于转换的函数。float函数的作用就是这样,它可以转换里面的值。这里我们将详细介绍浮动函数的一系列内容。1、说明。给定一个字符串值(2023-02-26Python130
使用Python 制作对比图片相似度的程序怎么比较?就是给出以下几个function的def 越多越好:1、 red_average(Picture) 算出pic众pixels的平均红值 。2、scale_red(Picture, int) 调整图片红值 并确保其不超过255 。3、e2023-02-26Python130
monocle分析及结果解读近年来,由于细胞的异质性及发育分化等相关的问题越来越被研究者们所关注,单细胞转录组分析为研究异质细胞群的复杂生物学过程提供了方法和工具。每一个细胞进行转录组测序时就是细胞发育过程中的快照,单细胞拟时间分析软件Monocle2是基于R语言的安2023-02-26Python130
【R语言编程】---根据表达量计算mRNA与lncRNA的皮尔森相关系数前言: 在构建ceRNA 网络时,需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene(pc gene) 间的表达相关性,一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢? 2.获得mRNA的表达矩阵 4个基因在100个样本的表达量矩阵: 32023-02-26Python90