R语言可视化常用代码(供自己记录) adj位置调整 ask询问 bg背景 bty图形边框风格,o四边都有边框,l左边和下边,7右边和上边,c上边、左边和下边, cex设置点和字符的大小,axis坐标轴上标签字的大小,lab坐标轴上命名的大小2023-05-01Python690
案例演示 | R语言绘制热图代码本文是个人笔记,请谨慎付费[星球用户可免费看]。 我们在分析了差异表达数据之后,经常要进行热图的可视化展示。热图(Heat map) 是一个以 颜色 变化来显示数据的 矩阵 。虽然“热图”是一个新兴的词汇,但是用明暗的矩阵来标2023-04-30Python290
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R语言可视化常用代码(供自己记录) adj位置调整 ask询问 bg背景 bty图形边框风格,o四边都有边框,l左边和下边,7右边和上边,c上边、左边和下边, cex设置点和字符的大小,axis坐标轴上标签字的大小,lab坐标轴上命名的大小2023-03-15Python140
大神帮忙:R语言for循环写出到Excel为何只有最后一个记录?实例代码如下:首先有个概念,循环中的变量是i,每次循环之后都会更新i的值,直到循环结束。循环中i的取值范围在1:5。循环中,每次循环都打印出i的结果。循环结束后,i不再更新,打印i输出的就是i最后一次的取值,并且一直都是这个值,除非你再次给i赋值。第二个2023-03-06Python170
案例演示 | R语言绘制热图代码本文是个人笔记,请谨慎付费[星球用户可免费看]。 我们在分析了差异表达数据之后,经常要进行热图的可视化展示。热图(Heat map) 是一个以 颜色 变化来显示数据的 矩阵 。虽然“热图”是一个新兴的词汇,但是用明暗的矩阵来标2023-02-28Python160
R语言相关系数图corplot怎样只显示下半边画上三角矩阵 corrplot(M, type = "upper")供参考。corrplot中参数详解corrplot(corr, method = c("circle", "sq2023-02-28Python180
R语言:ggplot主题包ggthemes参考: ggthemes: Extra Themes, Scales and Geoms for 'ggplot2' 输入数据 默认背景画图 常用背景1:theme_bw 常用背景2:t2023-02-28Python110
R语言ggcorrplot包绘制相关性热图热图是科研论文中一种常见的可视化手段,而在转录组研究领域,我们常常需要分析一些基因与基因之间的相关性,来判断生物样本中是否存在共表达情况,以及共表达基因模块。除了基因集之间,其他方向,比如免疫细胞群体之间相关性,样本的相关性,也常常用相关性2023-02-27Python130
【R语言编程】---利用三代测序绘制菌群聚类热图与物种丰度图前言: 仍然是三代测序数据的分析,宏基因组的文章中经常出现聚类热图和物种丰度图,用来直观地识别与某些疾病或者表型相关的菌群构成。 1.读取数据 一共有11个样本,每一个样本的测序reads都经过Nanopore官方的Epi2Me2023-02-27Python150
如何用R绘制地图这里主要介绍下在R语言中绘制地图的个人琢磨的思路。绘制地图步骤有三:你得需要绘制地图;(约等于废话)你得有要绘制地图的地理信息,经纬度啊,边界啊等等;你得利用2的数据在R中画出来。以上步骤中,目前最关键的是2,一旦2的数据有了,在R中不就是2023-02-27Python160
r语言生成html文件怎么演示1、首先根据已有函数自定义函数,并制作表格。定义一个函数,输入数据集的变量并得到该变量的统计结果。2、其次函数定义完成后,建立一个空的列表,以储存每个变量的分析结果,并进行分析,将结果储存在列表中。3、然后将所有结果merge到一个矩阵中,2023-02-27Python140
R语言配色方案: Colors in R调色板有3种类型:连续型调色板、离散型调色板和定性调色板。绘图应用[1]Wes Anderson,电影导演韦斯·安德森,善于运用色彩。 最欣赏的一点是他以色调和对称构图来讲述惟妙惟肖的故事情节,而不是使用过多复杂花哨的2023-02-27Python120
R语言:ggplot主题包ggthemes参考: ggthemes: Extra Themes, Scales and Geoms for 'ggplot2' 输入数据 默认背景画图 常用背景1:theme_bw 常用背景2:t2023-02-26Python140
【R语言编程】---利用三代测序绘制菌群聚类热图与物种丰度图前言: 仍然是三代测序数据的分析,宏基因组的文章中经常出现聚类热图和物种丰度图,用来直观地识别与某些疾病或者表型相关的菌群构成。 1.读取数据 一共有11个样本,每一个样本的测序reads都经过Nanopore官方的Epi2Me2023-02-26Python130
【R画图】环形热图热图(heatmap)在生信领域基本就是常规操作,基本技能,入门操作。能画热图的工具也有很多,我自己常用的R包是pheatmap。 最近经常看见环状的热图,所以就搜了一下资料学习一下,测试一下。环状热图我也经常会在论文中看到,用法和热图2023-02-26Python230
【R画图】环形热图热图(heatmap)在生信领域基本就是常规操作,基本技能,入门操作。能画热图的工具也有很多,我自己常用的R包是pheatmap。 最近经常看见环状的热图,所以就搜了一下资料学习一下,测试一下。环状热图我也经常会在论文中看到,用法和热图2023-02-26Python140
【R画图】环形热图热图(heatmap)在生信领域基本就是常规操作,基本技能,入门操作。能画热图的工具也有很多,我自己常用的R包是pheatmap。 最近经常看见环状的热图,所以就搜了一下资料学习一下,测试一下。环状热图我也经常会在论文中看到,用法和热图2023-02-26Python180
案例演示 | R语言绘制热图代码本文是个人笔记,请谨慎付费[星球用户可免费看]。 我们在分析了差异表达数据之后,经常要进行热图的可视化展示。热图(Heat map) 是一个以 颜色 变化来显示数据的 矩阵 。虽然“热图”是一个新兴的词汇,但是用明暗的矩阵来标2023-02-26Python190