如何用R语言对一组样本数据进行拟合求出密度函数?

Python012

如何用R语言对一组样本数据进行拟合求出密度函数?,第1张

曲线拟合:(线性回归方法:lm)1、x排序2、求线性回归方程并赋予一个新变量z=lm(y~x+I(x^2)+...)3、plot(x,y)#做y对x的散点图4、lines(x,fitted(z))#添加拟合值对x的散点图并连线曲线拟合:(nls)lm是将曲线直线化再做回归,nls是直接拟合曲线。需要三个条件:曲线方程、数据位置、系数的估计值。如果曲线方程比较复杂,可以先命名一个自定义函数。例:f=function(x1, x2, a, b) {a+x1+x2^b} result=nls(x$y~f(x$x1, x$x2, a, b), data=x, start=list(a=1, b=2)) #x可以是数据框或列表,但不能是矩阵#对系数的估计要尽量接近真实值,如果相差太远会报错:“奇异梯度”summary(result) #结果包含对系数的估计和p值根据估计的系数直接在散点图上使用lines加曲线即可。曲线拟合:(局部回归)lowess(x, y=NULL, f = 2/3, iter = 3)#可以只包含x,也可使用x、y两个变量#f为窗宽参数,越大越平滑#iter为迭代次数,越大计算越慢loess(y~x, data, span=0.75, degree=2)#data为包含x、y的数据集;span为窗宽参数#degree默认为二次回归#该方法计算1000个数据点约占10M内存举例:x=seq(0, 10, 0.1)y=sin(x)+rnorm(101)#x的值必须排序plot(x,y) #做散点图lines(lowess(x,y)) #利用lowess做回归曲线lines(x,predict(loess(y~x))) #利用loess做回归曲线,predict是取回归预测值z=loess(y~x)lines(x, z$fit) #利用loess做回归曲线的另一种做法

你好!如果你努力工作,你可以使用 r 语言来收集和可视化遗传本体和路径,r 包可以是 gosim (去分析) ,或者集群剖析器(gokegg)2细胞景观的插件式联盟可以愚蠢地显示路径的图像,可以用来直接张贴(至少对于低分)。3关于访问和 kegg 数据,大卫只是一个意见。谢谢你。