R语言包 dendextend 这个包可以实现,利用 help(package="dendextend") 查看帮助文档,能够看到其中的一个小例子
但是这个后期美化起来好像不太方便。
还找到了一个参考链接是
http://talgalili.github.io/dendextend/articles/dendextend.html
介绍的也是 dendextend 这个包的用法。
这个时候再运行上面提到的例子就可以直接得到结果
把树的形状改为圆形,添加样本的名称
鸢尾花数据集是150个样本,用圆形的图看下效果
最终的结果是
这里关于最外圈文本位置的调整,我还的再仔细看看,这里出图后位置不太合适,我是手动调整的!
文章较长,点击直达我的 博客 ,浏览效果更好。
本文内容基本是来源于 STHDA ,这是一份十分详细的 ggplot2 使用指南,因此我将其翻译成中文,一是有助于我自己学习理解,另外其他R语言爱好者或者可视化爱好者可以用来学习。翻译过程肯定不能十全十美,各位读者有建议或改进的话,十分欢迎发 Email ( [email protected] )给我。
ggplot2 是由 Hadley Wickham 创建的一个十分强大的可视化R包。按照 ggplot2 的绘图理念,Plot(图)= data(数据集)+ Aesthetics(美学映射)+ Geometry(几何对象):
在 ggplot2 中有两个主要绘图函数:qplot()以及ggplot()。
由 ggplot2 绘制出来的ggplot图可以作为一个变量,然后由print()显示出来。
根据数据集, ggplot2 提供不同的方法绘制图形,主要是为下面几类数据类型提供绘图方法:
安装 ggplot2 提供三种方式:
加载
本文将使用数据集 mtcars 。
qplot()类似于R基本绘图函数plot(),可以快速绘制常见的几种图形:散点图、箱线图、小提琴图、直方图以及密度曲线图。其绘图格式为:
其中:
也可以添加平滑曲线
还有其他参数可以修改,比如点的形状、大小、颜色等
箱线图
小提琴图
点图
直方图
密度图
上文中的qplot()绘制散点图:
在ggplot()中完全可以如下实现:
改变点形状、大小、颜色等属性
绘图过程中常常要用到转换(transformation),这时添加图层的另一个方法是用stat_*()函数。
下例中的geom_density()与stat_density()是等价的
等价于
使用数据集wdata,先计算出不同性别的体重平均值
先绘制一个图层a,后面逐步添加图层
可能添加的图层有:
改变颜色
可以通过修改不同属性如透明度、填充颜色、大小、线型等自定义图形:
使用以下函数:
根据sex修改颜色,将sex映射给line颜色
修改填充颜色以及透明度
添加均值线以及手动修改颜色
将sex映射给颜色
手动修改颜色
y轴显示为密度
修改颜色以及线型
将sex映射给线颜色
修改填充颜色
使用数据集mtcars, 先创建一个ggplot图层
可能添加的图层有:
将变量cyl映射给点的颜色和形状
自定义颜色
可以添加回归曲线
散点图+回归线
使用loess方法
将变量映射给颜色和形状
使用数据集 faithful
实际上 geom_jitter() 是 geom_point(position="jitter") 的简称,下面使用数据集 mpg
增加抖动防止重叠
其中两个参数:
参数label用来指定注释标签
使用数据集 diamonds
创建ggplot图层,后面再逐步添加图层
可添加的图层有:
geom_bin2d() 将点的数量用矩形封装起来,通过颜色深浅来反映点密度
设置bin的数量
geom_hex()依赖于另一个R包 hexbin ,所以没安装的先安装:
修改bin的数目
主要是如何通过线来连接两个变量,使用数据集 economics 。
先创建一个ggplot图层,后面逐步添加图层
可添加的图层有:
使用数据集 ToothGrowth ,其中的变量len(Tooth length)是连续变量,dose是离散变量。
创建图层
可添加的图层有:
添加有缺口的箱线图
按dose分组映射给颜色
将dose映射给填充颜色
按supp进行分类并映射给填充颜色
添加中值点
与箱线图结合
将dose映射给颜色进行分组
添加中值点
直接谷歌一下,“时间序列分析
R语言”,就能得到你想要的结果
以下结果来自,
作者:詹鹏 2012-9-20
22:46:46
【包】
library(zoo)
#时间格式预处理
library(xts)
#同上
library(timeSeires)
#同上
library(urca)
#进行单位根检验
library(tseries)
#arma模型
library(fUnitRoots)
#进行单位根检验
library(FinTS)
#调用其中的自回归检验函数
library(fGarch)
#GARCH模型
library(nlme)
#调用其中的gls函数
library(fArma)
#进行拟合和检验
【基本函数】
数学函数
abs,sqrt:绝对值,平方根
log,
log10,
log2
,
exp:对数与指数函数
sin,cos,tan,asin,acos,atan,atan2:三角函数
sinh,cosh,tanh,asinh,acosh,atanh:双曲函数
简单统计量
sum,
mean,
var,
sd,
min,
max,
range,
median,
IQR(四分位间距)等为统计量,sort,order,rank与排序有关,其它还有ave,fivenum,mad,quantile,stem等