解读此表
但是上面的用法做不到随心所欲的指定任意两组进行比较，所有还有下一种方法
处理好了分组信息，再自定义比较元素
自定义函数进行比较
热土和火山图都是傻瓜式的，只要的前面得出的deg数据(也就是基因差异表达数据）是正确的
有现成的包：matchprobes包 里面有个函数basecontent(seq)计算4中碱基每种的含量；自己做的话：
#List是你的序列
unlist(strsplit(List,""))->sep.letter#把每个字母都单独分开
#遍历所有字母
count_a=0count_g=0count_t=0count_c=0
for(i in 1:length(sep.letter)){
if(sep.letter[i]=="a"){count_a=count_a+1}
if(sep.letter[i]=="g"){count_g=count_g+1}
.........................
}
更多的美化处理工作可以参考博文《在R中绘制进化树：ggtree学习笔记》。链接为 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=255662&do=blog&id=969228
