2021-07-06R语言报错:表格传入时报错

Python0150

2021-07-06R语言报错:表格传入时报错,第1张

表格传入时报错(读取指定行的某一列的数据)

Error in [.data.frame (b, , c("plate_id", "Well", "TISSUE", "Patient_ID")) :

undefined columns selected

改写表头的大小写及顺序解决了。

注:1.遇到undefined columns selected 的问题一定是获取列的文本与数据列不对应

2.眼见也不一定为实特殊符号需要敏感,尽量不要使用特殊符号命名样品;

因为Frontiers In Immunology要求提供图片的时候选择“对色盲友好”的配色,因此尝试了一下这个包。

但是非常困惑的是经常报错。今天终于解决了问题。记录一下。

首先加载相关的包并作一个简单的图

用的是ggplot2默认的调色板

之后用Viridis调色,主要是加了这么一条函数

然后就花式报错

大概意思用一个连续型的色带给离散型变量上色。就很费解,不知道去哪找离散型的色带。

一开始尝试把fill的变量替换成连续型的,但是感觉并不好看。所以还是想怎么能把这个颜色替换掉。

直到最后终于发现有一个叫做scale_fill_viridis_d的函数。可以提供离散型的色带。

于是重新作图

这下好了。好吧虽然还是很丑。

于是顺便整理了一下各种相关的函数

scale_fill_viridis_d:

如前所述我们已经知道这个函数可以提供Viridis包的离散型的色带了。

magma(3, alpha = 1, begin = 0, end = 1, direction = 1):

可以输出指定色带指定数量的颜色。