js实现文件另存为的我还没见到过。java的确实是可以，java的实现方式也不止一种。下面以Swing的方式来讲解一种：
通过创建一个文件对话框
//parent表示对话框的所有者 Frame//title表示对话框的标题 String
//mode表示对话框的类型，这里指定为保存类型 int（ FileDialog.SAVE）
FileDialog saveAsFileDialog = new FileDialog(parent, "对话框标题", FileDialog.SAVE)
然后指定这个文件对话框为文件保存类型。调用
saveAsFileDialog.setVisible(true)的方式来显示对话框。显示对话框以后该对话框就处于阻塞状态等待用户通过UI界面去选择文件保存路径。点击保存以后。
saveAsFileDialog.getDirectory()//文件对话框的保存目录+ saveAsFileDialog.getFile()// 获取此文件对话框的保存文件名
拿到保存路径就能够实现文件的保存逻辑操作了。
单击文件菜单下的另存为就会弹出一个另存为对话框，这时再在保存类型下选择．txt类型，这样就可以把整个网页保存下来，至于你说的内容不乱，这个我不太清楚．不过只要你再在．txt文件里修改一下就行了，或者你将你要的内容复制到word里面就行了．
