R语言常用函数整理(基础篇)R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:2023-02-21Python120
R语言进行相关性分析相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或2023-02-21Python80
R语言计算两组数据变量之间相关系数和P值的简单小例子比如Horticulture Research中的论文 Comparative analysis of long noncoding RNAs in angiosperms and characterization of long2023-02-21Python80
r语言线性回归分析怎么看正负相关看回归方程y=a+bx中的b值的正负,如果b是正数,就是正相关;如果b是负数,就是负相关。b值只能用来判断相关性的正负,但b并不是相关系数,相关系数在线性回归方程中是确定系数R^2的平方根R值,其正负号由b值的正负号决定。cor()函数可以2023-02-20Python120
R语言相关性分析1. R语言自带函数cor(data, method=" ")可以快速计算出相关系数 ,数据类型:data.frame 如data.frame为:zz, 绘图如下:a. single protein:线性2023-02-20Python140
怎么用r语言进行dna菌群多样性分析基因测序分析微生物菌群结构 NA是什么意思微生物群落测序是指对微生物群体进行高通量测序,通过分析测序序列的构成分析特定环境中微生物群体的构成情况或基因的组成以及功能。借助不同环境下微生物群落的构成差异分析我们可以分析微生物与环境因素或宿主之2023-02-20Python150
R语言如何提取p值将t.test()的结果保存下来,然后用$符号提取。如res <- t.test()res$p.value或者t.test()$p.value注意t检验中的参数照写 比如Horticulture Research中的论文2023-02-20Python80
R语言变量的定义R中有许多用于存储数据的结构,包括标量、向量、数组、数据框和列表。多样化的数据结构赋予了R极其灵活的数据处理能力。R可以处理的数据类型包括数值型、字符型、逻辑型(TRUEFALSE)、复数型(虚数)和原生型(字节)。数据框(data fr2023-02-20Python120
R矢量地图栅格化(将shapefile转换成raster)在处理地图数据时候,经常会碰到 shp 与 raster 两种格式。通常r中应用较多的为raster栅格数据。shp文件太大,读取也不方便。逐渐被 GeoJSON 替代,用sf去处理与读取。 R在读取shp时候,处理,或者画图都会碰到,2023-02-20Python90
使用R语言对SSR数据做主成分分析(PCA)的一个简单小例子示例数据来自于R语言包 poppr ,csv文件存储,数据格式如下 使用到的是R语言的 poppr 包中的 read.genalex() 函数poppr 第一次使用需要先安装 读入数据 读入数据直接是 genclone obje2023-02-20Python130
R语言进行相关性分析相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或2023-02-20Python120
使用R语言进行协整关系检验使用R语言进行协整关系检验协整检验是为了检验非平稳序列的因果关系,协整检验是解决伪回归为问题的重要方法。首先回归伪回归例子:伪回归Spurious regression伪回归方程的拟合优度、显著性水平等指标都很好,但是其残差序列是一个非平稳2023-02-20Python100
主成分分析中可以有很多定性变量吗主成分分析法是数据挖掘中常用的一种降维算法,是Pearson在1901年提出的,再后来由hotelling在1933年加以发展提出的一种多变量的统计方法,其最主要的用途在于“降维”,通过析取主成分显出的最大的个别差异,也可以用来削减回归分析2023-02-20Python150
R语言长时间序列栅格数据之逐像素相关性分析假设有两组栅格数据,一组代表2019年中国每月降雨量,一组代表2019年中国每月植被叶面积指数(LAI)。想要得到中国月降水量与LAI的相关性分布,那么需要对两组栅格数据对应的栅格点进行逐栅格的相关性分析。 将降水数据导入栅格栈中,这个2023-02-20Python160
在R语言中,参数prob和scale和df是什么意思prob=probabilitie是概率,df=degrees of freedom 是自由度.scale(x,center = TRUE,scale = TRUE)函数scale执行中心化和标准化.若center为数字或向量,x减去cen2023-02-20Python160
在R语言中,参数prob和scale和df是什么意思prob=probabilitie是概率,df=degrees of freedom 是自由度.scale(x,center = TRUE,scale = TRUE)函数scale执行中心化和标准化.若center为数字或向量,x减去cen2023-02-20Python110
2019-02-23 QTL(转自知乎)链接:https:www.zhihu.comquestion27695566answer40741777 我是来顺便整理一下自己脑子里的东西的。欢迎知友们评论指正。一、QTL定位的基本思想QTL全称是Quan2023-02-20Python300
R语言绘制相关系数图||线面组合是不是看到这种图心里痒痒的,三年了,终于有人把它重现出来了。 从原图我们很容易发现,主要有三部分:右上角是类似于corrplot包中的上三角相关系数图;下三角是一组点之间的连接线(作者用了弧线,直线也能达到同样的效果);剩余部分主要是图2023-02-19Python330
新人求助,R语言中如何做修正的RS,VSx<-c(127.3,130.0,132.7,129.4,135.0,137.1,141.1,142.8,145.5,145.3,148.3,146.4,150.2,153.1,157.3,160.7,164.2,165.6,12023-02-19Python170
Python 中的可视化工具介绍几周前,R语言社区经历了一场关于画图工具的讨论。对于我们这种外人来说,具体的细节并不重要,但是我们可以将一些有用的观点运用到 Python 中。讨论的重点是 R 语言自带的绘图工具 base R 和 Hadley Wickham 开发的绘2023-02-19Python130