Perl,R,Python在生物信息学中是怎样的角色?

Perl,R,Python在生物信息学中是怎样的角色?

应该说PythonPerl是相互替代的脚本语言,但个人推荐用Python, 虽然很多老的生物信息软件是用Perl,Python学习曲线好,功能也更强大,是发展趋势。这两个语言主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析
Python110
R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

原文: R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)====================================== 在前一章(TCGA生存分析)中,我们描述了生存分析的基本概念以及分析和总结生存数据的方法,包括:1.
Python130
R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

原文: R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)====================================== 在前一章(TCGA生存分析)中,我们描述了生存分析的基本概念以及分析和总结生存数据的方法,包括:1.
Python180
r语言如何数据分析

r语言如何数据分析

r语言数据分析是查看数据的结构、类型,数据处理。根据查询相关资料信息显示:R语言是一个开源、跨平台的科学计算和统计分析软件包,具有丰富多样、强大的的统计功能和数据分析功能,数据可视化可以绘制直方图、箱型图、小提琴图等展示分数的分布情况可以通
Python470
R语言数据分析实例一:离职率分析与建模预测

R语言数据分析实例一:离职率分析与建模预测

本文分析利用IBM离职员工数据进行分析。在对离职率的影响因素进行观察的基础至上,建立模型并预测哪些员工更易离职。 一般而言,数据分析分为三个步骤:数据收集与清洗、探索性分析和建模预测。本文的数据集是IBM用于研究员工预测的 模拟数据
Python180
R语言如何实现随机分组

R语言如何实现随机分组

先选取一个随机数发生器。随机数组合的方法:选取一个随机数发生器,生成1000个随机数,令这100个随机数生成数组并命名为t。同时令n=1,命名最终需要的随机数数组为x,选取第二个发生器,生成一个随机数j,且满足1而随机数组合的难点在于,步骤
Python140
R语言-方差检验

R语言-方差检验

对实验数据检验方差相等的正态分布总体均值是否相等。判断各因素对试验指标影响是否显著。根据影响实验指标条件的个数可以区分为:单因素方差分析,双因素方差分析,多因素方差分析 boxplot(目标变量~变量,data=数据框) 箱子中的黑
Python140
R语言SVM如何修改最大迭代上限

R语言SVM如何修改最大迭代上限

我也遇到过很多次这个问题,尤其是再用到tune.svm的时候,这是由这个函数内部决定的。我的建议有两点:减少tuning parameter的数量或者说范围用Python sklearn去tune 如果非得需要用R 就python tun
Python400
R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

原文: R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)====================================== 在前一章(TCGA生存分析)中,我们描述了生存分析的基本概念以及分析和总结生存数据的方法,包括:1.
Python190
如何用r语言进行双因素方差分析

如何用r语言进行双因素方差分析

如果你用的是英文版的 那么流程为Analyze---general linear model---univarite 打开一个对话框将两因素选入自变量框(fixed factors)将因变量选入因变量框(dependent varieble
Python130
R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

原文: R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)====================================== 在前一章(TCGA生存分析)中,我们描述了生存分析的基本概念以及分析和总结生存数据的方法,包括:1.
Python160
帮忙纠错,初学c语言,希望今天得到答案,谢谢

帮忙纠错,初学c语言,希望今天得到答案,谢谢

你的这个程序是求亲和数的,整体上的思路是对的,只是忘了一点,sum1和sum2,在每次循环前都要重新赋值为1。否则是得不到任何的亲和数。我改了一下,用的是1200,6000时间运行长了。#include "iostream.h&q
Python190
R语言数据分析实例一:离职率分析与建模预测

R语言数据分析实例一:离职率分析与建模预测

本文分析利用IBM离职员工数据进行分析。在对离职率的影响因素进行观察的基础至上,建立模型并预测哪些员工更易离职。 一般而言,数据分析分为三个步骤:数据收集与清洗、探索性分析和建模预测。本文的数据集是IBM用于研究员工预测的 模拟数据
Python160
R语言可以实现层次分析法内容吗

R语言可以实现层次分析法内容吗

在深入分析实际问题的基础上,将有关的各个因素按照不同属性自上而下地分解成若干层次,同一层的诸因素从属于上一层的因素或对上层因素有影响,同时又支配下一层的因素或受到下层因素的作用。最上层为目标层,通常只有1个因素,最下层通常为方案或对象层,中
Python130
r语言fit.cox是什么意思

r语言fit.cox是什么意思

r语言fit.cox的意思是比例风险回归模型。根据查询相关公开信息显示,COX回归模型,又称比例风险回归模型。该模型以最终结局和生存时间为因变量,同时分析众多因素对生存时间的影响,目前在医疗,金融和市场研究等专业领域中广泛使用。如医学研究中
Python150
r语言fit.cox是什么意思

r语言fit.cox是什么意思

r语言fit.cox的意思是比例风险回归模型。根据查询相关公开信息显示,COX回归模型,又称比例风险回归模型。该模型以最终结局和生存时间为因变量,同时分析众多因素对生存时间的影响,目前在医疗,金融和市场研究等专业领域中广泛使用。如医学研究中
Python170
《R语言实战》自学笔记57-ANOVA模型拟合

《R语言实战》自学笔记57-ANOVA模型拟合

虽然ANOVA和回归方法都是独立发展而来,但是从函数形式上看,它们都是广义线性模型 的特例。 aov(formula, data = dataframe) 表中y是因变量,字母A、B、C代表因子。 表中小写字母表示定量变量,
Python140
r语言 做完aov之后为什么要summary一下

r语言 做完aov之后为什么要summary一下

summary是一个查看函数,你可以理解为他是对对象的一个详细的概括。一般情况下,summary接受一个模型(比如你aov的结果或者lmglm的结果),然后返回这个模型中包含有哪些内容,当然,它也是可以接受变量或函数的,也会返回其所含信息
Python270