R语言-方差检验对实验数据检验方差相等的正态分布总体均值是否相等。判断各因素对试验指标影响是否显著。根据影响实验指标条件的个数可以区分为:单因素方差分析,双因素方差分析,多因素方差分析 boxplot(目标变量~变量,data=数据框) 箱子中的黑2023-03-05Python160
R语言与统计-2:方差分析R语言与统计-1:t检验与秩和检验 方差分析适用于多组均数的比较 (在完全随机设计的实验中,两组均数的t检验和方差分析是完全等价的。但t检验只能用于两组的均数比较,对于三组和三组以上的均数比较,就需要用到方差分析。) 可以看2023-03-05Python120
R语言对应分析@[toc] Q型分析:样本之间的关系(聚类算法等) R型分析:变量之间的关系(主成分分析、因子分析等)。 有时候我们不仅要弄清样本之间和变量之间的关系,还要弄清 样本与变量之间的关系 ,而对应分析就是这样一种分析方法。(变量2023-03-05Python130
R语言绘制生存曲线图下图显示内置数据集colon,病人rx处理分为三组(下图第三列),对照组: Obs ,处理组一:Levamisole (Lev) ,处理组二: Levamisole + 5-fluorouracil (Lev+5FU) # loads2023-03-03Python140
R语言-方差检验对实验数据检验方差相等的正态分布总体均值是否相等。判断各因素对试验指标影响是否显著。根据影响实验指标条件的个数可以区分为:单因素方差分析,双因素方差分析,多因素方差分析 boxplot(目标变量~变量,data=数据框) 箱子中的黑2023-03-02Python110
R语言与统计-2:方差分析R语言与统计-1:t检验与秩和检验 方差分析适用于多组均数的比较 (在完全随机设计的实验中,两组均数的t检验和方差分析是完全等价的。但t检验只能用于两组的均数比较,对于三组和三组以上的均数比较,就需要用到方差分析。) 可以看2023-03-01Python110
两因素同时存在OR怎么算OR值的全称是oddratio,又称比值比,对于发病率很低的疾病来说,它是OR值即是相对危险度的精确估计值。计算公式如下:Odd ratio, 95%CI假定我们要鉴别一个基因(或者标记位点SNP)有两个等位基因(等位):记为Allele12023-02-28Python130
如何用R语言模拟logistic分布logit=glm(y~x1+x2,data=data,family=binomial(link='logit')) glm表示广义线性回归,data表示y,x1,x2所在的数据集,family中的link用来选择回归类2023-02-27Python140
如何用R语言中的robustrao用R语言中的robustrao,需要使用到robust包和qcc包,先要下载好。我们使用的是robust包知道的stack.dat数据集进行分析,用R语言中的robustrao导入数据通过断点回归(RD),还可以用R语言的robustrao2023-02-27Python120
r语言 做完aov之后为什么要summary一下summary是一个查看函数,你可以理解为他是对对象的一个详细的概括。一般情况下,summary接受一个模型(比如你aov的结果或者lmglm的结果),然后返回这个模型中包含有哪些内容,当然,它也是可以接受变量或函数的,也会返回其所含信息2023-02-26Python100
r语言fit.cox是什么意思r语言fit.cox的意思是比例风险回归模型。根据查询相关公开信息显示,COX回归模型,又称比例风险回归模型。该模型以最终结局和生存时间为因变量,同时分析众多因素对生存时间的影响,目前在医疗,金融和市场研究等专业领域中广泛使用。如医学研究中2023-02-26Python110
【R语言】--- 森林图森林图(forest plot),一般是指在平面直角坐标系中,以一条垂直于X轴的无效线(通常坐标X=1或0)为中心,用若干条平行于X轴的线段,来表示每个研究的效应量大小及其95%可信区间,并用一个棱形来表示多个研究合并的效应量及可信区间,它2023-02-26Python150
R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)原文: R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)====================================== 在前一章(TCGA生存分析)中,我们描述了生存分析的基本概念以及分析和总结生存数据的方法,包括:1.2023-02-26Python130
R语言与统计-2:方差分析R语言与统计-1:t检验与秩和检验 方差分析适用于多组均数的比较 (在完全随机设计的实验中,两组均数的t检验和方差分析是完全等价的。但t检验只能用于两组的均数比较,对于三组和三组以上的均数比较,就需要用到方差分析。) 可以看2023-02-26Python90
r语言孟德尔随机化分析,怎么把ivw改成随机效应模型孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)是以孟德尔独立分配定律为基础进行流行病学研究设计和数据分析,论证病因假说的一种方法。由基因型决定中间表型(暴露)的差异, 因果方向明确。通过引入一个称之为工具变量的中间变量2023-02-25Python300
R绘图应用实例:单因素方差分析ANOVA及绘图ANOVA原理参考: 单因素方差分析(One-way Anova) 实验数据:在随机划分的试验田中,施加三种复合肥(B,C,D),饲料填充物做空白对照(A),一段时间后,测定试验田内植株高度,比较数据有无不同,差异性是否具2023-02-25Python180
R语言 初学者您好,这几本我觉得都不错,适合初学者《R语言实战》Robert Kabacoff著,高涛等译《R语言与统计分析》汤银才著《多元统计分析及R语言建模》王斌会编著《统计建模与R软件》薛毅等编著尤其是前两本我觉得较适合初学者,R语言这个软件属于上2023-02-25Python160
R语言与统计-2:方差分析R语言与统计-1:t检验与秩和检验 方差分析适用于多组均数的比较 (在完全随机设计的实验中,两组均数的t检验和方差分析是完全等价的。但t检验只能用于两组的均数比较,对于三组和三组以上的均数比较,就需要用到方差分析。) 可以看2023-02-25Python150
如何用r语言进行双因素方差分析如果你用的是英文版的 那么流程为Analyze---general linear model---univarite 打开一个对话框将两因素选入自变量框(fixed factors)将因变量选入因变量框(dependent varieble2023-02-25Python210
R语言与统计-2:方差分析R语言与统计-1:t检验与秩和检验 方差分析适用于多组均数的比较 (在完全随机设计的实验中,两组均数的t检验和方差分析是完全等价的。但t检验只能用于两组的均数比较,对于三组和三组以上的均数比较,就需要用到方差分析。) 可以看2023-02-25Python300