R语言 RDA分析(去冗余物种)也做了挺多次RDA分析,自己现在小结一下RDA分析流程: 就我个人而言,虚线前面都是不太经历的步骤,我一般不会主动删去样品的环境信息,因为我接触的菌群这块本来就没有什么多余的环境信息-_-||,所以我的重点放在怎么去除多余OTU或菌群上2023-02-26Python160
r语言 plot设置刻度解决这个问题的方法如下:1、首先在R中,plot函数作图时会自动给出xy轴的刻度标度。2、然后有时需要自己定义xy轴的刻度,这时可以用axis中的at和labels参数来更改,先令plot不要画出xy轴的标度。3、最后,用axis函数设置2023-02-26Python1540
mat数据导入r语言中变成了什么数据结构R中的数组使用array进行创建,与向量或者矩阵不同的是,array可以是多维的。array中的数据同样是相同mode的,array函数的像是如下:array(vector, dimensions, dimnames),其中vector包含2023-02-26Python90
R语言之基础向量是 R 语言中最基本的数据类型,在 R 中没有单独的标量(例如 1 本质上是 c(1)) 。 R 中可以用 = 或者 <- 来进行赋值 , <-的快捷键是 alt + - 。 R的下标是从1开始的,和py2023-02-26Python310
句关法r求于解 这 词de个的r用o一etdoo事penrth原rso同rvut意e。ruhirtihtagnipah(,还tphsh序s意thI区词1wreot动It某hb原为ota。c②syaw还cu.u,如词rsol词a上g定ec现pgotthr,en。strd.o班e:2023-02-26Python120
R语言常用函数整理(基础篇)R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:2023-02-26Python130
python如何记录矩阵某一行序号可以使用numpy的index方法来记录矩阵某一行的序号: ```import numpy as np # 创建一个矩阵matrix = np.array([[1,2,3], [4,5,6], [7,8,9]]) # 获取第二行的序号row2023-02-26Python170
在r语言中,哪一项命令用来执行wilcoxon秩和检验wilcox.test()其中paired参数需要是FALSE(默认值)比如x<-rnorm(10)y<-rnorm(10)wilcox.test(x,y)参看帮助文档vector:向量 numeric:数值2023-02-26Python120
R语言初学笔记:差异表达基因setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ2023-02-26Python130
R软件如何做二维图像?R可以画轮廓图,例如:require(grDevices) # for coloursx <- -6:16op <- par(mfrow = c(2, 2))contour(outer(x, x), method =2023-02-26Python110
R语言可以处理大的数据吗“参考网址1”中提到如果只是对整数运算(运算过程和结果都只使用整数),没有必要使用“double”(8 byte),而应该用更小的“integer”(4 byte)。使用storage.mode(x)查看对象存数的模式,storage.mo2023-02-26Python150
R语言里面的因子R语言中的因子确实不好理解,很多人都这么觉得。在R语言中,因子(factor)表示的是一个符号、一个编号或者一个等级,即,一个点。例如,人的个数可以是1,2,3,4......那么因子就包括,1,2,3,4.....还有统计量的水平的时候用2023-02-26Python130
基于R语言实现Lasso回归分析基于R语言实现Lasso回归分析主要步骤:将数据存成csv格式,逗号分隔在R中,读取数据,然后将数据转成矩阵形式加载lars包,先安装调用lars函数确定Cp值最小的步数确定筛选出的变量,并计算回归系数具体代码如下: 需要注意的地方: 1、2023-02-26Python130
R语言中的多元方差分析R语言中的多元方差分析1、当因变量(结果变量)不止一个时,可用多元方差分析(MANOVA)对它们同时进行分析。library(MASS)attach(UScereal)y <- cbind(calories, fat, suga2023-02-26Python160
求助 用R语言做PLS分析的代码或方法princomp(x, cor = FALSE, scores = TRUE, covmat = NULL, subset = rep_len(TRUE, nrow(as.matrix(x))), )当cor = TRUE是使用相关系数矩阵2023-02-26Python160
R语言相关性分析1. R语言自带函数cor(data, method=" ")可以快速计算出相关系数 ,数据类型:data.frame 如data.frame为:zz, 绘图如下:a. single protein:线性2023-02-26Python90
如何用r语言求哈达马乘积r语言中计算哈达马乘积(Hadamard product),和计算一般矩阵与矩阵的乘积一样,直接用m×n即可。如matrix(c(1:8),2)*matrix(c(8:1),2)> matrix(c(1:8),2) [,1] [2023-02-26Python130
R语言初级教程(15): 矩阵(下篇)这是最后一篇讲解有关矩阵操作的博客,介绍有关矩阵的函数,主要有 rowSums() ,colSums() ,rowMeans() ,colMeans() ,apply() ,rbind() ,cbind() ,r2023-02-26Python150
请问怎样用python提取矩阵目标所在列 比如 01234 12340 23401 中每行的0所在的列#很简单,你只需要把那个矩阵的每行看成一个列表就好了。def print_row(n):print list1[n]print list2[n]print list3[n]printdef operate():for i in 2023-02-26Python130
R语言中有哪些取整运算?R语言中取整运算主要包括以下五种:floor():向下取整;ceiling(): 向上取整;round(): 四舍五入取整;turnc(): 向0取整;signif(): 保留给定位数的精度。floor返回对应数字的'地板2023-02-26Python170