【R>>tSNE】tSNE高效降维

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t-SNE:T-Distribution Stochastic Neighbour Embedding, T分布随机近邻嵌入。与PCA一样是常用的降维方法,其主要优势在于能保持局部结构的能力,即高维数据空间中距离相近的点投影到低维空间中仍然
Python180
R语言细节汇总

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开始一个新的R语言数据分析新项目,管理脚本、图片、文件的推荐方式:打开Rstudio,新建Rproject,新建脚本(脚本存放在生成的Rproject文件夹中)。 若要逆着优先顺序操作,将返回NA x %in%y是判断x中的每一个
Python130
R语言安装问题

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安装的时候不要那么快的点“下一步”,仔细看看,会有提示让你选择语言的地方;应该就在最开始,点第三个‘下一步’之内;所有版本的安装过程都一样的,包含了各种语言,不要纠结于不同版本的exe了;下游分析 cellranger count 计算
Python110
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python100
R代表些什么?

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1、数学中的R数论的 R 表示集合理论中的实数集,而复数中的实数部分也以此符号为代表。几何学的R 或 r 表示一个圆的半径。几何学中,∠R则表示直角。几何学中,直角三角形可表示成Rt△,“Rt”出自英文right-angle(直角)
Python260
R语言初学笔记:差异表达基因

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setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ
Python200
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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Python120
如何用r语言实现布丰投针问题?

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原文链接:http:tecdat.cn?p=13033介绍布丰投针是几何概率领域中最古老的问题之一。它最早是在1777年提出的。它将针头掷到有平行线的纸上,并确定针和其中一条平行线相交的可能性。令人惊讶的结果是概率与pi的值直接相
Python120
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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Python130
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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如何读取25q16cvsig的数据

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如何读取25q16cvsig的数据在R语言里面,有很多读取数据的方法。R能读文本文件,csv格式文件,通过RODBC包读取数据库数据等等。下面我介绍几种最基本的读取数据的方法!工具原料RStudio方法不管是读取数据还是写入,R都是在工作
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2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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R语言安装问题

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2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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r语言如何返回上一步

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Ctrl+Shift+Z返回上一步操作(撤销)Ctrl+Shift+Z,反撤销Ctrl+Shift+C,注释或取消注释当前行代码Ctrl+2,移动光标到控制台Ctrl+LR。R语言是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,是一个用
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R语言初学笔记:差异表达基因

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setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ
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2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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RNA-seq分析(三)DESeq2

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R语言数据类型 :向量(vector);列表(list);矩阵(matrix);数组(array);因子(factor);数据框(data.frame) 详细介绍可参考R 数据类型 | 菜鸟教程 (runoob.com)
Python420
r语言randomforest包下载不了

r语言randomforest包下载不了

原因:1.可能因为lib没有制定文件夹,导致R不知道下载哪里;2.可能因为源用不了(一个是没有在global option里面选择,一个是因为开了vpn)解决:#.libPaths("C:UsersyeziguniangDo
Python100