2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python800
【R>>tSNE】tSNE高效降维

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t-SNE:T-Distribution Stochastic Neighbour Embedding, T分布随机近邻嵌入。与PCA一样是常用的降维方法,其主要优势在于能保持局部结构的能力,即高维数据空间中距离相近的点投影到低维空间中仍然
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R语言msigdbr包提取基因集

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首先查看可供选择的物种信息 使用msigdbr()函数可以得到想要的基因集,其中category参数可以指定基因集的类别,比如“H”或者“C1” 之后可以利用split函数把得到的基因集分组建成一个list 之后就可以利用这个l
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R语言 特征

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R语言特征:1. type.convert()函数主要用在read.table()函数中,返回向量和因子类型,当输入为double型时会丢失精度。&gttype.convert(c('abc','bcd
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2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python530
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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Python200
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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Python190
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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Python180
R语言初学笔记:差异表达基因

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setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ
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R语言数据过拟合怎么办

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这是代码加速的问题。且默认您的数据读入速度没有问题(数据量级在百万以下)。如果只是建立模型的那一行代码跑的很慢,如果建立模型的代码本身没有提供并行计算功能,部分模型可以尝试把公式换成则分别传入x=, y= 参数,多数模型无法加速。再除非有
Python150
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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R语言数据过拟合怎么办

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这是代码加速的问题。且默认您的数据读入速度没有问题(数据量级在百万以下)。如果只是建立模型的那一行代码跑的很慢,如果建立模型的代码本身没有提供并行计算功能,部分模型可以尝试把公式换成则分别传入x=, y= 参数,多数模型无法加速。再除非有
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setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ
Python160
r语言如何生成20个50维的数据

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如果用regress进行拟合的话,输出加上state,分别给出R方,F值和显著性。。 如果用的是其他拟合,R=corrcoef(T,Y),Y是原始数据,T是用你拟合后求得方程,用这个方程得到的数据下游分析 cellranger coun
Python200
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

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r语言中erroringetcellinfo

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r语言中erroringetcellinfo答案如下:r语言中erroringetcellinfo是广义的文科是指以人类社会的政治、经济、文化等为研究对象的学科。又称人文社会科学。狭义的文科是指高中文理分科时选择的科目。下游分析 cel
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