构建遗传图谱---作图群体如何选择?

构建遗传图谱---作图群体如何选择?

基因定位最有效且最常用的方法就是先构建遗传连锁图谱再进行基因定位,该方法对于数量性状和质量性状的基因定位都适用。 构建连锁图谱的前提是建立作图群体,建立作图群体需要考虑几个因素:亲本(父母本的选择)、分离群体类型以及群体大小等。
Python230
连锁不平衡以及连锁不平衡衰减

连锁不平衡以及连锁不平衡衰减

[连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的增大,两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。] LD衰减 图,在重测序类的文章中会经常出现群体遗传、GWAS等的
Python180
LD衰减图

LD衰减图

LD衰减距离指的是,当平均LD系数衰减到一定大小(最大值的一半0.5以下)的时候,对应的物理距离。通常用LD衰减距离来描述LD衰减速度。LD衰减速度越快,即衰减距离越小,说明该群体遗传多样性越高;LD衰减速度越慢,通常驯化程度越高,选择强
Python190
连锁不平衡以及连锁不平衡衰减

连锁不平衡以及连锁不平衡衰减

[连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的增大,两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。] LD衰减 图,在重测序类的文章中会经常出现群体遗传、GWAS等的
Python240
R语言 -- if 不能识别含有NA的数据

R语言 -- if 不能识别含有NA的数据

由于数据中含有NA,if不能讲if()内的计算结果的NA识别为TRUE和FALSE中的任一个,因此会这样报错。 解决办法: 只需要使用na.omit去掉含有NA的行或列,就可以愉快地进行if循环了~ 啊啊啊,这个坑了我好一会~百
Python170
Structure图的构建与理解

Structure图的构建与理解

什么是structure图?如果你有看过群体遗传相关的文章,你对它肯定不会陌生。对那些还没有接触过的同学,那就直接上图吧: 上图是选取于一个大麦群体遗传的研究。不同的颜色种类分别代表了种群的数目,橙色代表了驯化的大麦,绿色是野生的大
Python320
R数据可视化12:曼哈顿图

R数据可视化12:曼哈顿图

曼哈顿图是一种散点图,通常用于显示具有大量数据点,许多非零振幅和更高振幅值分布的数据。该图通常用于全基因组关联研究(GWAS)以显示重要的SNP(来源wiki)。 在图中每个点代表一个SNP,纵轴为每个SNP计算出来的Pvalue取-
Python190
Verbal Abuse(202195)

Verbal Abuse(202195)

Good afternoon, everyone.What I want to say today is not an easy topic, and maybe a little boring, so if you could give
Python130
r开头的单词(昆虫)?

r开头的单词(昆虫)?

ant蚂蚁queen ant蚁后male ant雄蚁termite蚁white ant白蚁worker ant工蚁bee, honeybees蜜蜂bumble bee大黄蜂drone雄蜂queen bee蜂王wasp黄蜂, 胡蜂beetle
Python100
文山市明升电脑销售有限公司怎么样?

文山市明升电脑销售有限公司怎么样?

简介:文山市明升电脑销售有限公司成立于2014年04月18日,主要经营范围为电脑及配件、数码相机、照相器材、办公用品、文化用品、劳保用品、服装、电子产品的销售及售后服务等。法定代表人:王永香成立时间:2014-04-18注册资本:30万人民
电脑教程410
php文件中基础问题

php文件中基础问题

推荐使用相对路径。。譬如说1011111.txt 和 你的 102001.php是同一目录下的。。那么请使用这样的语法.$filetye=fopen(".1011111.txt","r")当然还可以
Python130
LD衰减图

LD衰减图

LD衰减距离指的是,当平均LD系数衰减到一定大小(最大值的一半0.5以下)的时候,对应的物理距离。通常用LD衰减距离来描述LD衰减速度。LD衰减速度越快,即衰减距离越小,说明该群体遗传多样性越高;LD衰减速度越慢,通常驯化程度越高,选择强
Python80
进化算法的基本步骤

进化算法的基本步骤

进化计算是基于自然选择和自然遗传等生物进化机制的一种搜索算法。与普通的搜索方法一样,进化计算也是一种迭代算法,不同的是进化计算在最优解的搜索过程中,一般是从原问题的一组解出发改进到另一组较好的解,再从这组改进的解出发进一步改进。而且在进化问
Python70
[R语言] Heatmap绘图经验总结

[R语言] Heatmap绘图经验总结

这里随机生成了25个0,1之间的均匀分布的随机数,其中,行是样本,列是特征,如图: 第一种方案绘制的Heatmap需要借助于Corrplot包,我们求出dat特征的相关系数矩阵,进一步利用corrplot函数来画图,在该包的官方文档中,
Python180