R语言之创建数据集

R语言之创建数据集

R语言之创建数据集数据集通常是由数据构成的一个矩形数组,行表示观测,列表示变量。R中有许多用于存储数据的结构,包括标量、向量、数组、数据框和列表。在R中,对象(object)是指可以赋值给变量的任何事物,包括常量、数据结构、函数、甚至是图形
Python80
单细胞数据处理小细节汇总

单细胞数据处理小细节汇总

1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不加设置,后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。 修改DefaultAssay: 2. Seurat使用FindV
Python120
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python130
R语言数据过拟合怎么办

R语言数据过拟合怎么办

这是代码加速的问题。且默认您的数据读入速度没有问题(数据量级在百万以下)。如果只是建立模型的那一行代码跑的很慢,如果建立模型的代码本身没有提供并行计算功能,部分模型可以尝试把公式换成则分别传入x=, y= 参数,多数模型无法加速。再除非有
Python120
生命围棋——古老围棋与生命游戏的结合

生命围棋——古老围棋与生命游戏的结合

在狂拽酷炫的大神烧脑的阿法尔狗原理解析之后,我更多的从游戏设计和现象角度谈谈围棋和生命游戏以及生命围棋一些设计思路和开发体验。线上Demo地址:gooflife“All of life is an act of lettin
Python90
R语言初学笔记:差异表达基因

R语言初学笔记:差异表达基因

setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ
Python160
r语言如何生成20个50维的数据

r语言如何生成20个50维的数据

如果用regress进行拟合的话,输出加上state,分别给出R方,F值和显著性。。 如果用的是其他拟合,R=corrcoef(T,Y),Y是原始数据,T是用你拟合后求得方程,用这个方程得到的数据下游分析 cellranger coun
Python200
教你在线绘制circos图-简单!

教你在线绘制circos图-简单!

相信大家都听说过circos图,但是亲自画过的人可能就很少,这主要因为软件的安装和使用稍微有一点麻烦。其实,circos图也是可以在线绘制的,这样就简单多了!一起来了解一下吧! 在circos官网(http:circos.ca)的
Python180
pvalue要不要四舍五入

pvalue要不要四舍五入

在R语言在生物信息学的实际应用中,常常需要添加p-value和显著性标记。很多同学对于添加P-value这个问题一直一知半解,殊不知,不同的类型添加P-value选择的方法也是不同的。本文将详细介绍如何通过ggpubr包为ggplot图添加
Python140
柔美的细胞君演员表

柔美的细胞君演员表

《柔美的细胞君》是由金高银主演的一部韩剧,该剧主演员表如下:1、柔美    金高银饰演身份:无法摆脱“无趣”束缚的普通上班族2、具雄   安普贤饰演身份:游戏开发者,性格直率3、刘巴比   朴珍荣饰演身份:柔美的第二个男朋友,公司
Python140
R语言常用函数

R语言常用函数

1.判断存在:一个元素是不是在向量中用a%in%b &gta="TT" &gtb=c("AA","AT","TT") &
Python140
柔美的细胞君演员表

柔美的细胞君演员表

《柔美的细胞君》是由金高银主演的一部韩剧,该剧主演员表如下:1、柔美    金高银饰演身份:无法摆脱“无趣”束缚的普通上班族2、具雄   安普贤饰演身份:游戏开发者,性格直率3、刘巴比   朴珍荣饰演身份:柔美的第二个男朋友,公司
Python190
人工智能需要学习哪些数学知识

人工智能需要学习哪些数学知识

分布,KL距离等再往后面延伸还有信息论等内容它是更实用理论的基础。5.最优化在简单基础的应用场景下,我们希望机器学习能很好的对于事物有个归纳总结的能力,所以训练学习的过程有点像一个拟合过程,不用的应用场景对不同的目标进行优化所以肯定是基础再
Python150
柔美的细胞君演员表

柔美的细胞君演员表

《柔美的细胞君》是由金高银主演的一部韩剧,该剧主演员表如下:1、柔美    金高银饰演身份:无法摆脱“无趣”束缚的普通上班族2、具雄   安普贤饰演身份:游戏开发者,性格直率3、刘巴比   朴珍荣饰演身份:柔美的第二个男朋友,公司
Python170
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python120
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python130
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python160
2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

2019-10-22 R语言Seurat包下游分析-1

下游分析 cellranger count 计算的结果只能作为错略观测的结果,如果需要进一步分析聚类细胞,还需要进行下游分析,这里使用官方推荐 R 包(Seurat 3.0) 流程参考官方外周血分析标准流程( https:sat
Python130
r语言中erroringetcellinfo

r语言中erroringetcellinfo

r语言中erroringetcellinfo答案如下:r语言中erroringetcellinfo是广义的文科是指以人类社会的政治、经济、文化等为研究对象的学科。又称人文社会科学。狭义的文科是指高中文理分科时选择的科目。下游分析 cel
Python100