R语言安装DESeq2包

Python07

R语言安装DESeq2包,第1张

DESeq2用来处理转录组数据。那么先来完成第一步:安装。

1、传统方式安装

麻蛋,报错了!!!!为什么受伤的总是我。

2、开启查阅资料模式,然后得到的结论是这个包的安装需要利用BiocConductor或者BiocManager。

但是根据网上大神们的分享,尝试了各种方法。报错越来越多,并且越来越看不懂。

最后决定直接进入DESeq2的package官网上看吧。 https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DESeq2.html

3、最后按照Bioconductor指示安装,成功。

点击进入:Windows (95 and later),再点击:base,下载SetupR.exe,约18兆,此便是R FOR WINDOWS的安装程序。双击SetupR.exe,按照提示一步步安装即可。 安装完成后,程序会创建R程序组并在桌面上创建R主程序的快捷方式(也可以在安装过程中选择不要创建)。通过快捷方式运行R,便可调出R的主窗口。 类似于许多以编程方式为主要工作方式的软件,R的界面简单而朴素,只有不多的几个菜单和快捷按钮。快捷按钮下面的窗口便是命令输入窗口,它也是部分运算结果的输出窗口,有些运算结果则会输出在新建的窗口中。 主窗口上方的一些文字是刚运行R时出现的一些说明和指引。文字下的: 符号便是R的命令提示符,在其后可输出命令后的矩形是光标。R一般是采用交互方式工作的,在命令提示符后输入命令,回车后便会输出结果。

1.R Studio- Tools -Global Options,General Basic中有R的基本信息,可以从这里看到(记不清了的)R的安装路径

2.在路径里找到 etc文件夹,其中Rprofile.site文件

在这个文件中加入语句:.libPaths(c("需要的路径",.libPaths()))

保存,关闭,重启Rstudio,包的默认路径就已经得到更改了。

3.library(包),都是正常的,之前安装过的包也加载进来了。

大大减轻了C盘的负担,再也不害怕安装包了哈哈哈