R语言实战-基本图形

Python077

R语言实战-基本图形,第1张

条形图使用的函数为'barplot(x)',其中x为向量

以关节炎研究包vcd为演示对象

治疗类型和改善情况的列联表

条形图并不一定要基于计数数据或频率数据。你可以使用数据整合函数将结果传递给barplot()函数。

来创建表示均值、中位数、标准差等的条形图。

棘状图对堆砌条形图进行了重缩放,这样每个条形的高度均为1,每段的高度即表示比例。

增加名称、颜色和填充颜色

可比较的密度图

线图(又称盒须图)通过绘制连续型变量的五数总括,即最小值、下四分位数(第25百分位数)、中位数(第50百分位数)、上四分位数(第75百分位数)以及最大值,描述了连续型变量的分布。箱线图能够显示出可能为离群点(范围±1.5*IQR以外的值,IQR表示四分位距,即上四分位数与下四分位数的差值)的观测。

并列箱线图

对box图的参数进行修改

双因素交叉的箱式图

小提琴图(violin plot)是箱线图与核密度图的结合。需要安装vioplot包

点图提供了一种在简单水平刻度上绘制大量有标签值的方法。

分组、排序、着色后的点图

饼图或者说扇形图在统计分析结果展示中非常常用,R语言自带做饼图的函数pie,做起来非常简单,只需提供比例,样品名称即可。

默认的颜色只有6中,循环使用的,不过这个颜色可以自定义。

用pie作图其实就够了,但奈何很“卷”,有其他好看的饼图,所以接下来还是结合ggplot2与ggforce做可以变换的饼图,例如空心饼图。单独用ggplot2作图比较繁琐,不建议去尝试了,太费时间没必要。

先做一个基本的饼图。

要想得到空心饼图,只需要将geom_arc_bar参数中r0改为1即可。

想要分割饼图,geom_arc_bar中添加explode参数。

可以发现,以上作图有一个bug就是添加比例标记很麻烦,要想实现自动化需要编写函数很麻烦。参考: https://stackoverflow.com/questions/52960015/how-to-avoid-label-overlap-in-pie-chart 。可以先将每个标签角度计算好,再添加,结果还好。

好了以上就是饼图的内容了,其本质是为了统计比例,结果解读比较直观,我们也是跟风做了一些变换的图形,其实最简单的饼图就可以了,各取所需。此外,还有很多其他方法制作饼图,感兴趣的自行百度了解。

R语言绘图系列:

标度控制着数据到图形属性的映射,标度将我们的数据转化为视觉上可以感知的东西,比如大小、位置、颜色、形状等。标度也为我们提供了读图时所使用的工具,比如说坐标轴和图例。总的来说,可以称为引导元素。标度函数控制元素的属性,可以理解为图形的遥控器,可以用它来调整画布大小、颜色等等。此前学的shape,color,size等参数和标度函数相比显得不够灵活。

scale_fill_brewer 调色板函数

geom_errorbar()

geom_crossbar()

geom_linerange() 绘制线段

geom_pointrange() 绘制点

pointrange:点画线

首先绘制一张盒形图

在图上显示出观测值

值得注意的是,图上点的多少并不能完全反应原始数据的多少,因为有的点可能因为点过于密集就会被覆盖,看起来是一个点,其实可能是多个点。

因此可以使用geom_jitter函数将不同的点区分开(jitter是震荡散点),width设置如果遇到相同的点,点向左右方平移的距离。alpha设置透明度。

黑色点是离群点

还可以绘制卡槽图

varwidth参数会根据该水平下观测值的个数(n值)改变盒形图的宽度。(这里宽度去的不是观测个数的绝对值,而是平方根,以缩小差距。)

给盒子上色

分组盒形图,用不同颜色区分

画水平的盒形图

使用coord_flip函数(坐标轴翻转函数)

绘制一张直方图

bins可以设置直方图条柱的数目,默认为30。当bins和binwidth(设置条柱宽度)同时设置时,默认以binwidth为准。

新加入变量cut,根据新变量在price水平上进行一个计数

y轴由count变为density,绘制概率密度

注意下面density的写法,前后都要加..

绘制概率密度曲线:geom_density函数

堆栈密度概率曲线

geom_line/geom_path/geom_step

绘制一个简单的线图

绘制点线图,点和线需要分别添加。

如上图,线在点之上,是因为先投射了点,又投射了线。

先投射线,点就出现在了线之上。

线的颜色出现了渐变

geom_smooth函数:绘制拟合曲线

methods还有其他的方法,如glm:广义线性模型;losses:纯粹平滑;gam:广义加性模型等等(lm和glm最常用)

geom_hline绘制水平线,geom_vline绘制垂直线。xintercept和yintercept是截距,slope是斜率。