如何用Python在10分钟内建立一个预测模型

Python023

如何用Python在10分钟内建立一个预测模型,第1张

预测模型的分解过程

我总是集中于投入有质量的时间在建模的初始阶段,比如,假设生成、头脑风暴、讨论或理解可能的结果范围。所有这些活动都有助于我解决问题,并最终让我设计出更强大的商业解决方案。为什么你要在前面花费这段时间,这有充分的理由:

你有足够的时间投入并且你是无经验的(这是有影响的)

你不带有其它数据观点或想法的偏见(我总是建议,在深入研究数据之前做假设生成)

在后面的阶段,你会急于完成该项目而没有能力投入有质量的时间了。

这个阶段需要投入高质量时间,因此我没有提及时间表,不过我建议你把它作为标准的做法。这有助于你建立建立更好地预测模型,在后面的阶段的只需较少的迭代工作。让我们来看看建立第一个模型的剩余阶段的时间表:

数据描述性分析——50%的时间

数据预处理(缺失值和异常值修复)——40%的时间

数据建模——4%的时间

性能预测——6%的时间

让我们一步一步完成每个过程(每一步投入预测的时间):

阶段1:描述性分析/数据探索

在我刚开始成为数据科学家的时候,数据探索占据了我大量的时间。不过,随着时间的推移,我已经把大量的数据操作自动化了。由于数据准备占据建立第一个模型工作量的50%,自动化的好处是显而易见的。

这是我们的第一个基准模型,我们去掉任何特征设计。因此,描述分析所需的时间仅限于了解缺失值和直接可见的大的特征。在我的方法体系中,你将需要2分钟来完成这一步(假设,100000个观测数据集)。

我的第一个模型执行的操作:

确定ID,输入特征和目标特征

确定分类和数值特征

识别缺失值所在列

阶段2:数据预处理(缺失值处理)

有许多方法可以解决这个问题。对于我们的第一个模型,我们将专注于智能和快速技术来建立第一个有效模型。

为缺失值创建假标志:有用,有时缺失值本身就携带了大量的信息。

用均值、中位数或其它简单方法填补缺失值:均值和中位数填补都表现良好,大多数人喜欢用均值填补但是在有偏分布的情况下我建议使用中位数。其它智能的方法与均值和中位数填补类似,使用其它相关特征填补或建立模型。比如,在Titanic生存挑战中,你可以使用乘客名字的称呼,比如:“Mr.”, “Miss.”,”Mrs.”,”Master”,来填补年龄的缺失值,这对模型性能有很好的影响。

填补缺失的分类变量:创建一个新的等级来填补分类变量,让所有的缺失值编码为一个单一值比如,“New_Cat”,或者,你可以看看频率组合,使用高频率的分类变量来填补缺失值。

由于数据处理方法如此简单,你可以只需要3到4分钟来处理数据。

阶段3:数据建模

根据不同的业务问题,我推荐使用GBM或RandomForest技术的任意一种。这两个技术可以极其有效地创建基准解决方案。我已经看到数据科学家通常把这两个方法作为他们的第一个模型同时也作为最后一个模型。这最多用去4到5分钟。

阶段4:性能预测

有各种各样的方法可以验证你的模型性能,我建议你将训练数据集划分为训练集和验证集(理想的比例是70:30)并且在70%的训练数据集上建模。现在,使用30%的验证数据集进行交叉验证并使用评价指标进行性能评估。最后需要1到2分钟执行和记录结果。

本文的目的不是赢得比赛,而是建立我们自己的基准。让我们用python代码来执行上面的步骤,建立你的第一个有较高影响的模型。

让我们开始付诸行动

首先我假设你已经做了所有的假设生成并且你擅长使用python的基本数据科学操作。我用一个数据科学挑战的例子来说明。让我们看一下结构:

步骤1:导入所需的库,读取测试和训练数据集。

#导入pandas、numpy包,导入LabelEncoder、random、RandomForestClassifier、GradientBoostingClassifier函数

import pandas as pd

import numpy as np

fromsklearn.preprocessing import LabelEncoder

import random

fromsklearn.ensemble import RandomForestClassifier

from sklearn.ensembleimport GradientBoostingClassifier

#读取训练、测试数据集

train=pd.read_csv('C:/Users/AnalyticsVidhya/Desktop/challenge/Train.csv')

test=pd.read_csv('C:/Users/AnalyticsVidhya/Desktop/challenge/Test.csv')

#创建训练、测试数据集标志

train='Train'

test='Test'

fullData =pd.concat(,axis=0) #联合训练、测试数据集

步骤2:该框架的第二步并不需要用到python,继续下一步。

步骤3:查看数据集的列名或概要

fullData.columns # 显示所有的列名称

fullData.head(10) #显示数据框的前10条记录

fullData.describe() #你可以使用describe()函数查看数值域的概要

步骤4:确定a)ID变量 b)目标变量 c)分类变量 d)数值变量 e)其他变量。

ID_col =

target_col =

cat_cols =

num_cols= list(set(list(fullData.columns))-set(cat_cols)-set(ID_col)-set(target_col)-set(data_col))

other_col= #为训练、测试数据集设置标识符

步骤5:识别缺失值变量并创建标志

fullData.isnull().any()#返回True或False,True意味着有缺失值而False相反

num_cat_cols = num_cols+cat_cols # 组合数值变量和分类变量

#为有缺失值的变量创建一个新的变量

# 对缺失值标志为1,否则为0

for var in num_cat_cols:

if fullData.isnull().any()=True:

fullData=fullData.isnull()*1

步骤6:填补缺失值

#用均值填补数值缺失值

fullData = fullData.fillna(fullData.mean(),inplace=True)

#用-9999填补分类变量缺失值

fullData = fullData.fillna(value = -9999)

步骤7:创建分类变量的标签编码器,将数据集分割成训练和测试集,进一步,将训练数据集分割成训练集和测试集。

#创建分类特征的标签编码器

for var in cat_cols:

number = LabelEncoder()

fullData = number.fit_transform(fullData.astype('str'))

#目标变量也是分类变量,所以也用标签编码器转换

fullData = number.fit_transform(fullData.astype('str'))

train=fullData='Train']

test=fullData='Test']

train = np.random.uniform(0, 1, len(train)) <= .75

Train, Validate = train=True], train=False]

步骤8:将填补和虚假(缺失值标志)变量传递到模型中,我使用随机森林来预测类。

features=list(set(list(fullData.columns))-set(ID_col)-set(target_col)-set(other_col))

x_train = Train.values

y_train = Train.values

x_validate = Validate.values

y_validate = Validate.values

x_test=test.values

random.seed(100)

rf = RandomForestClassifier(n_estimators=1000)

rf.fit(x_train, y_train)

步骤9:检查性能做出预测

status = rf.predict_proba(x_validate)

fpr, tpr, _ = roc_curve(y_validate, status)

roc_auc = auc(fpr, tpr)

print roc_auc

final_status = rf.predict_proba(x_test)

test=final_status

test.to_csv('C:/Users/Analytics Vidhya/Desktop/model_output.csv',columns=)

现在可以提交了!

支持向量机SVM(Support Vector Machine)是有监督的分类预测模型,本篇文章使用机器学习库scikit-learn中的手写数字数据集介绍使用Python对SVM模型进行训练并对手写数字进行识别的过程。

准备工作

手写数字识别的原理是将数字的图片分割为8X8的灰度值矩阵,将这64个灰度值作为每个数字的训练集对模型进行训练。手写数字所对应的真实数字作为分类结果。在机器学习sklearn库中已经包含了不同数字的8X8灰度值矩阵,因此我们首先导入sklearn库自带的datasets数据集。然后是交叉验证库,SVM分类算法库,绘制图表库等。

12345678910#导入自带数据集from sklearn import datasets#导入交叉验证库from sklearn import cross_validation#导入SVM分类算法库from sklearn import svm#导入图表库import matplotlib.pyplot as plt#生成预测结果准确率的混淆矩阵from sklearn import metrics

读取并查看数字矩阵

从sklearn库自带的datasets数据集中读取数字的8X8矩阵信息并赋值给digits。

12#读取自带数据集并赋值给digitsdigits = datasets.load_digits()

查看其中的数字9可以发现,手写的数字9以64个灰度值保存。从下面的8×8矩阵中很难看出这是数字9。

12#查看数据集中数字9的矩阵digits.data[9]

以灰度值的方式输出手写数字9的图像,可以看出个大概轮廓。这就是经过切割并以灰度保存的手写数字9。它所对应的64个灰度值就是模型的训练集,而真实的数字9是目标分类。我们的模型所要做的就是在已知64个灰度值与每个数字对应关系的情况下,通过对模型进行训练来对新的手写数字对应的真实数字进行分类。

1234#绘制图表查看数据集中数字9的图像plt.imshow(digits.images[9], cmap=plt.cm.gray_r, interpolation='nearest')plt.title('digits.target[9]')plt.show()

设置模型的特征X和预测目标Y

查看数据集中的分类目标,可以看到一共有10个分类,分布为0-9。我们将这个分类目标赋值给Y,作为模型的预测目标。

12#数据集中的目标分类digits.target 12#将数据集中的目标赋给YY=digits.target

手写数字的64个灰度值作为特征赋值给X,这里需要说明的是64个灰度值是以8×8矩阵的形式保持的,因此我们需要使用reshape函数重新调整矩阵的行列数。这里也就是将8×8的两维数据转换为64×1的一维数据。

123#使用reshape函数对矩阵进行转换,并赋值给Xn_samples = len(digits.images)X = digits.images.reshape((n_samples, 64))

查看特征值X和预测目标Y的行数,共有1797行,也就是说数据集中共有1797个手写数字的图像,64列是经过我们转化后的灰度值。

12#查看X和Y的行数X.shape,Y.shape

将数据分割为训练集和测试集

将1797个手写数字的灰度值采用随机抽样的方法分割为训练集和测试集,其中训练集为60%,测试集为40%。

12#随机抽取生成训练集和测试集,其中训练集的比例为60%,测试集40%X_train, X_test, y_train, y_test = cross_validation.train_test_split(X, Y, test_size=0.4, random_state=0)

查看分割后的测试集数据,共有1078条数据。这些数据将用来训练SVM模型。

12#查看训练集的行数X_train.shape,y_train.shape

对SVM模型进行训练

将训练集数据X_train和y_train代入到SVM模型中,对模型进行训练。下面是具体的代码和结果。

12#生成SVM分类模型clf = svm.SVC(gamma=0.001) 12#使用训练集对svm分类模型进行训练clf.fit(X_train, y_train)

使用测试集测对模型进行测试

使用测试集数据X_test和y_test对训练后的SVM模型进行检验,模型对手写数字分类的准确率为99.3%。这是非常高的准确率。那么是否真的这么靠谱吗?下面我们来单独测试下。

12#使用测试集衡量分类模型准确率clf.score(X_test, y_test)

我们使用测试集的特征X,也就是每个手写数字的64个灰度值代入到模型中,让SVM模型进行分类。

12#对测试集数据进行预测predicted=clf.predict(X_test)

然后查看前20个手写数字的分类结果,也就是手写数字所对应的真实数字。下面是具体的分类结果。

12#查看前20个测试集的预测结果predicted[:20]

再查看训练集中前20个分类结果,也就是真实数字的情况,并将之前的分类结果与测试集的真实结果进行对比。

12#查看测试集中的真实结果expected=y_test

以下是测试集中前20个真实数字的结果,与前面SVM模型的分类结果对比,前20个结果是一致的。

12#查看测试集中前20个真实结果expected[:20]

使用混淆矩阵来看下SVM模型对所有测试集数据的预测与真实结果的准确率情况,下面是一个10X10的矩阵,左上角第一行第一个数字60表示实际为0,SVM模型也预测为0的个数,第一行第二个数字表示实际为0,SVM模型预测为1的数字。第二行第二个数字73表示实际为1,SVM模型也预测为1的个数。

12#生成准确率的混淆矩阵(Confusion matrix)metrics.confusion_matrix(expected, predicted)

从混淆矩阵中可以看到,大部分的数字SVM的分类和预测都是正确的,但也有个别的数字分类错误,例如真实的数字2,SVM模型有一次错误的分类为1,还有一次错误分类为7。

本文翻译自 https://jakevdp.github.io/PythonDataScienceHandbook/05.12-gaussian-mixtures.html

上一节中探讨的k-means聚类模型简单易懂,但其简单性导致其应用中存在实际挑战。具体而言,k-means的非概率特性及简单地计算点与类蔟中心的欧式距离来判定归属,会导致其在许多真实的场景中性能较差。本节,我们将探讨高斯混合模型(GMMs),其可以看成k-means的延伸,更可以看成一个强有力的估计工具,而不仅仅是聚类。

我们将以一个标准的import开始

我们看下k-means的缺陷,思考下如何提高聚类模型。正如上一节所示,给定简单,易于分类的数据,k-means能找到合适的聚类结果。

举例而言,假设我们有些简单的数据点,k-means算法能以某种方式很快地将它们聚类,跟我们肉眼分辨的结果很接近:

从直观的角度来看,我可能期望聚类分配时,某些点比其他的更确定:举例而言,中间两个聚类之间似乎存在非常轻微的重叠,这样我们可能对这些数据点的分配没有完全的信心。不幸的是,k-means模型没有聚类分配的概率或不确定性的内在度量(尽管可能使用bootstrap 的方式来估计这种不确定性)。为此,我们必须考虑泛化这种模型。

k-means模型的一种理解思路是,它在每个类蔟的中心放置了一个圈(或者,更高维度超球面),其半径由聚类中最远的点确定。该半径充当训练集中聚类分配的一个硬截断:任何圈外的数据点不被视为该类的成员。我们可以使用以下函数可视化这个聚类模型:

观察k-means的一个重要发现,这些聚类模式必须是圆形的。k-means没有内置的方法来计算椭圆形或椭圆形的簇。因此,举例而言,假设我们将相同的数据点作变换,这种聚类分配方式最终变得混乱:

高斯混合模型(GMM)试图找到一个多维高斯概率分布的混合,以模拟任何输入数据集。在最简单的情况下,GMM可用于以与k-means相同的方式聚类。

但因为GMM包含概率模型,因此可以找到聚类分配的概率方式 - 在Scikit-Learn中,通过调用predict_proba方法实现。它将返回一个大小为[n_samples, n_clusters]的矩阵,用于衡量每个点属于给定类别的概率:

我们可以可视化这种不确定性,比如每个点的大小与预测的确定性成比例;如下图,我们可以看到正是群集之间边界处的点反映了群集分配的不确定性:

本质上说,高斯混合模型与k-means非常相似:它使用期望-最大化的方式,定性地执行以下操作:

有了这个,我们可以看看四成分的GMM为我们的初始数据提供了什么:

同样,我们可以使用GMM方法来拟合我们的拉伸数据集;允许full的协方差,该模型甚至可以适应非常椭圆形,伸展的聚类模式:

这清楚地表明GMM解决了以前遇到的k-means的两个主要实际问题。

如果看了之前拟合的细节,你将看到covariance_type选项在每个中都设置不同。该超参数控制每个类簇的形状的自由度;对于任意给定的问题,必须仔细设置。默认值为covariance_type =“diag”,这意味着可以独立设置沿每个维度的类蔟大小,并将得到的椭圆约束为与轴对齐。一个稍微简单和快速的模型是covariance_type =“spherical”,它约束了类簇的形状,使得所有维度都相等。尽管它并不完全等效,其产生的聚类将具有与k均值相似的特征。更复杂且计算量更大的模型(特别是随着维数的增长)是使用covariance_type =“full”,这允许将每个簇建模为具有任意方向的椭圆。

对于一个类蔟,下图我们可以看到这三个选项的可视化表示:

尽管GMM通常被归类为聚类算法,但从根本上说它是一种密度估算算法。也就是说,GMM适合某些数据的结果在技术上不是聚类模型,而是描述数据分布的生成概率模型。

例如,考虑一下Scikit-Learn的make_moons函数生成的一些数据:

如果我们尝试用视为聚类模型的双成分的GMM模拟数据,则结果不是特别有用:

但是如果我们使用更多成分的GMM模型,并忽视聚类的类别,我们会发现更接近输入数据的拟合:

这里,16个高斯分布的混合不是为了找到分离的数据簇,而是为了对输入数据的整体分布进行建模。这是分布的一个生成模型,这意味着GMM为我们提供了生成与我们的输入类似分布的新随机数据的方法。例如,以下是从这个16分量GMM拟合到我们原始数据的400个新点:

GMM非常方便,可以灵活地建模任意多维数据分布。

GMM是一种生成模型这一事实为我们提供了一种确定给定数据集的最佳组件数的自然方法。生成模型本质上是数据集的概率分布,因此我们可以简单地评估模型下数据的可能性,使用交叉验证来避免过度拟合。校正过度拟合的另一种方法是使用一些分析标准来调整模型可能性,例如 Akaike information criterion (AIC) 或 Bayesian information criterion (BIC) 。Scikit-Learn的GMM估计器实际上包含计算这两者的内置方法,因此在这种方法上操作非常容易。

让我们看看在moon数据集中,使用AIC和BIC函数确定GMM组件数量:

最佳的聚类数目是使得AIC或BIC最小化的值,具体取决于我们希望使用的近似值。 AIC告诉我们,我们上面选择的16个组件可能太多了:大约8-12个组件可能是更好的选择。与此类问题一样,BIC建议使用更简单的模型。

注意重点:这个组件数量的选择衡量GMM作为密度估算器的效果,而不是它作为聚类算法的效果。我鼓励您将GMM主要视为密度估算器,并且只有在简单数据集中保证时才将其用于聚类。

我们刚刚看到了一个使用GMM作为数据生成模型的简单示例,以便根据输入数据定义的分布创建新样本。在这里,我们将运行这个想法,并从我们以前使用过的标准数字语料库中生成新的手写数字。

首先,让我们使用Scikit-Learn的数据工具加载数字数据:

接下来让我们绘制前100个,以准确回忆我们正在看的内容:

我们有64个维度的近1,800位数字,我们可以在这些位置上构建GMM以产生更多。 GMM可能难以在如此高维空间中收敛,因此我们将从数据上的可逆维数减少算法开始。在这里,我们将使用一个简单的PCA,要求它保留99%的预测数据方差:

结果是41个维度,减少了近1/3,几乎没有信息丢失。根据这些预测数据,让我们使用AIC来计算我们应该使用的GMM组件的数量:

似乎大约110个components最小化了AIC;我们将使用这个模型。我们迅速将其与数据拟合并确保它已收敛合:

现在我们可以使用GMM作为生成模型在这个41维投影空间内绘制100个新点的样本:

最后,我们可以使用PCA对象的逆变换来构造新的数字:

大部分结果看起来像数据集中合理的数字!

考虑一下我们在这里做了什么:给定一个手写数字的样本,我们已经模拟了数据的分布,这样我们就可以从数据中生成全新的数字样本:这些是“手写数字”,不是单独的出现在原始数据集中,而是捕获混合模型建模的输入数据的一般特征。这种数字生成模型可以证明作为贝叶斯生成分类器的一个组成部分非常有用,我们将在下一节中看到。