R语言-05表的追加、连接、合并、求差集

Python015

R语言-05表的追加、连接、合并、求差集,第1张

merge函数，还有dplyr包中的inner_join（）、full_join（）、left_join（）、right_join（）、可以实现，分别对应内连接、外连接、左连接、右连接

目标：A是一个表，B是另一个表，求A-B，也就是A有B没有的数据

这里的A表为data,B表为all，根据uid字段求差集，输出的差集为c表

1、集合

了解更多： 百度百科

2、集合的基本运算

3、集合的性质

基本性质和德摩根定律：

注：符合转换，+ 表示并集， 乘号或省略表示交集，-表示差集

了解更多： 知乎

以下R语言中有关集合运算的主要函数：

开始一个新的R语言数据分析新项目，管理脚本、图片、文件的推荐方式：打开Rstudio，新建Rproject，新建脚本（脚本存放在生成的Rproject文件夹中）。

若要逆着优先顺序操作，将返回NA

x %in%y是判断x中的每一个元素是否在y中存在。

若x和y长度不一致，返回x个TRUE或者FALSE。

⚠️练习：按如下方式生成test数据框，提取test中，最后一列值为a或c的行，组成一个新的数据框，赋值给test2。

这里如果使用==来判断，就相当于拿test$n的15个值与c('a','c')的2个值来一一对应着比对，因为两者长度不同，会发生循环补齐，其效果如下图，明显不是我们想要的结果。

x%in%y：选出x是y中一个值时的所有行

另：取交集、差集、并集的函数为：intersect(x,y)、union(x,y)、setdiff(x,y)、setdiff(y,x)

match函数的用法参考： https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/84927296

使用match函数修改矩阵的信息

方法1--设置CRAN镜像：打开R studio，点击tools--global option--packages，选择Package CRAN reposotory。

方法2--设置CRAN和bioconductor镜像

用于读取/导出文件的R包

rio可以不用区分读入文件类型，大部分文件可直接用import()读取。

@ 是R中，S4类的一个操作符， 用于提取S4对象中的内容（slot） ，比如：

这个时候$是不起作用的，因为被S4类重写了。可以自己定义$的行为。

⚠️： matrix不能直接用$取列

⚠️因此如果想取数据框中的部分行，在方括号中直接输入行数即可，返回的仍然是数据框。但如果加了逗号，会丧失数据框的格式，也就是会使数据框的行名（往往是基因名）丢失。

后面存图时可以用paste0连接GSE编号和图片类型及后缀，这样不同数据的分析得到的图片名就跟数据相一致。

通过将变量因子化来设置柱条的顺序