如果R没有自带pROC程序包,现在要实现pROC程序包中roc函数的调用,如何用代码实?

Python014

如果R没有自带pROC程序包,现在要实现pROC程序包中roc函数的调用,如何用代码实?,第1张

如果 R 编程语言未安装 pROC 包,则可以通过运行以下代码来安装它:

安装 pROC 软件包后,可以通过首先使用以下代码加载 pROC 软件包来使用 roc 函数

然后,您可以调用 roc 函数并向其传递必要的参数,以计算数据的接收器工作特征 (ROC) 曲线。例如,如果调用了真标签向量,并调用了预测概率向量,则可以使用以下代码计算 ROC 曲线:true_labelspred_probs

这将创建一个名为包含 ROC 曲线数据的对象。然后,您可以使用该函数绘制 ROC 曲线,如下所示:roc_curveplot

或者,您可以使用 pROC 包中的函数为 ROC 曲线创建 ggplot 对象,如果需要,可以进一步自定义该对象。下面是如何使用该函数的示例:ggrocggroc

这将创建一个名为 ggplot 的对象,然后您可以使用该函数显示该对象,如下所示:roc_plotprint

我希望这有帮助!如果您有任何其他问题,请告诉我。

回答不易望请采纳

cal_metrics <- function(label, pred){

  roc.p=pROC::roc(label, pred,ci =T)

  if (roc.p$auc>0.5){

    cutoff=roc.p$thresholds[which.max(roc.p$sensitivities+roc.p$specificities)]

    sensitivity=roc.p$sensitivities[which.max(roc.p$sensitivities+roc.p$specificities)]

    specificity=roc.p$specificities[which.max(roc.p$sensitivities+roc.p$specificities)]

    ci = roc.p$ci

    df=data.frame(type='positive classification',

                  auc=round(roc.p$auc,3),cutoff=cutoff,

                  sensitivity=sensitivity,specificity=specificity,ci_lower = ci[1],ci_upper=ci[3])

    return(df)

  }

  else{

    cutoff=roc.p$thresholds[which.min(roc.p$sensitivities+roc.p$specificities)]

    sensitivity=roc.p$sensitivities[which.min(roc.p$sensitivities+roc.p$specificities)]

    specificity=roc.p$specificities[which.min(roc.p$sensitivities+roc.p$specificities)]

    ci = roc.p$ci

    df=data.frame(type='negative classification',

                  auc=1-round(roc.p$auc,3),cutoff=cutoff,

                  sensitivity=1-sensitivity,specificity=1-specificity,ci_lower = ci[1],ci_upper=ci[3])

    return(df)

  }

}