ID转换用到的是 bitr() 函数,bitr()的使用方法:
org.Hs.eg.db包含有多种gene_name的类型
keytypes() :keytypes(x),查看注释包中可以使用的类型
columns() :类似于keytypes(),针对org.Hs.eg.db两个函数返回值一致
select() :select(x, keys, columns, keytype, ...) eg.
函数enrichGO()进行GO富集分析,enrichGO()的使用方法:
举例:
这里使用的是Y叔的R包clustProfilter,里面有个函数bitr()
但是使用这种方法总是会有一些基因比对不上,就会有类似的warning
如果有更好的方法,欢迎大家一起探讨!