R语言数据结构-向量

Python014

R语言数据结构-向量,第1张

R语言数据结构主要有以下四种:

向量:一串相同类型的数据,不限于数字,字符,逻辑都可以,单独拿出来的一列。什么是看做一个整体,一个向量里有若干个数据,它们组成一个整体之后,可以拥有一个共同的名字。

以下主要讲向量:

向量就是一串数据,串联在一起,组成一个整体,向量由元素组成。

很长的向量要么从数据框提取一列,或是有规律地生成,如连续的数据:

paste0函数连接两个向量,逗号 , 前后各有一个向量,如字符型和数值型向量。

paste0和paste的区别是:

paste0函数 把两个向量的元素一一对应进行 无缝 连接,而 paste函数 把两个向量的元素一一对应进行 空格 连接。paste函数有默认值为空格,在空格处把空格去掉sep=""引号里把默认的空格去掉,即什么没有,就变成无缝连接,也可以用其它的符号连接sep="/",sep="_"等。

数值型、字符型、逻辑型:只要有字符型在,用c()生成向量为字符型。只有逻辑型和数值型,用c()生成向量为数值型。

c()函数生成向量时,要求为生成同一种数据类型

注意的地方:

变量名 :c()为生成向量函数,一般除字母c外,取单个字母或是单词及缩写,组成变量名的字母之间不要有空格,不能以数字为变量名或是以数字开头,变量名不能是中文名,特殊符号等。

<- 与c()函数之间没有空格。

<- 的快捷键输入:

mac电脑: option 和 - ;

windows电脑: Alt 和 -

= 在任何情况下可替代 <- ,但是 = 除了赋值,还有其它用法,比如函数里参数用法。 <- 不能在任意情况下代替 = 。

强大的计算是体现在批量计算上,先把一些数据组成一个整体,

还是以向量x为单位进行

其中五个重要函数,一定要掌握。

能用函数代替的东西,坚决不用手和眼睛去数,比如length()统计向量元素个数。

结论:unique(x)与x[!duplicated(x)]函数相同

用identical()可以判断两个函数是否相同(数据结构与数据类型是否完全相同)

重点和难点:

x==y :x和对应位置的y相等吗?(x和y里的元素,按顺序一一对应比较,讲究位置对应,两者里第一个元素相同就返TRUE,比较完两个向量的第一位置上的元素,接着比较两个向量第二个位置元素...到两个向量最后)。

x和y不一样长:理解“循环补齐”

结论: 如果x与y的向量元素长度不相等,以长度向量说了算,不是由在==前的向量决定。

x%in%y :x的每个元素在y中存在吗?(x的元素挨个到y里和所有元素比较,在y里有的相同的返回TRUE,不讲究位置,有就是TRUE,没有为FALSE)。比如y向量加了一个元素2,返回还是9个逻辑值,返回的逻辑值是与x一一对应,和y没有关系。

加减乘除,两个向量直接可以进行,等位运算。前提是两个向量必须等长,即元素个数一样。

用paste0或是paste连接两个向量,两个向量的长度(元素个数)不一致,循环补齐。

intersect(x,y),union(x,y),setdiff(x,y),setdiff(y,x),x与y顺序颠倒(setdiff()与%in%有点儿相似)。

[] :取子集符号,将TRUE对应的值挑选出来,FALSE丢弃.

例:在13个数中,取出大于7的数,首先把13个数值组成一个向量x,x>7返回是逻辑值。

取值子集的对象放在中括号的外面,取子集的逻辑值向量放在中括号里面。

单独运行中括号里的向量,中括号里各种条件的返回结果有共同的规律,是一个与x等长的逻辑值向量。

下标:代表在哪个位置上。

符号 : []

按照逻辑值: 中括号里是与x等长的逻辑值向量

按照位置: 中括号里是由x的下标组成的向量(支持反选)

思考:从13个彩色(绿,蓝,黄)球中,选出属于蓝色和绿色的:

使用x %in% y还是x ==y,用x %in% y,不是等位循环补齐运算,%in%比较灵活,可以在很多场景中使用,如3选2,50选2,50选20等。

13个球的颜色赋值给向量x,蓝色和绿色赋值给y。

x %in% y

x[x %in% y]

修改向量的元素,修改x里的第四个元素

注意:R于语言里所有的修改,都要赋值,没有赋值就是没有发生过

把随机函数生成的数永远为一组数据:用随机函数生成向量,后运行set.seed(10086)

x[match(y,x)] 和 x[order(x)]

排序,如何调整元素顺序

结论:sort(x)等于x[order(x)],背诵下来

两个向量没有做关联的操作,可以用order函数排序对应信息

向量匹配排序-match,match函数是连线用的

x[match(y,x)] 的以后用法:以y作为模版,给x调顺序。

match:谁在中括号外面,谁就在后面, x[match(y,x)] ,以y作为模板,用x作为原料去取子集,按照一个顺序取子集,取出来的子集和y一样。

需要背诵的两个用法: x[match(y,x)] 和 x[order(x)]

练习题:在以下x和y表格里如何将y的列名一对一替换为ID

切换Rproj的时候出现弹窗:是否将工作空间保存到 .Rdata ?

答案是:不保存,之前单独保存好脚本和图片,这里出现的提示是否临时保存,不需要保存。

.Rdata ?是什么:

以 . 开头的文件,通常用作配置,系统默认隐藏这类文件

.Rdata 是保存工作空间的默认文件

.History 是保存历史命令的默认文件

如果打开Rstudio特别慢,可能是因为 .Rdata 保存了很大的变量,可以找到 .Rdata 文件将其删除。

在Rproj右下角打开脚本时,编辑器脚本的中文注释出现乱码,解决如下:

以上内容是听 生信技能树 小洁老师的 R语言线上课 ,根据自己的理解记录下来,小洁老师授课非常细心,对不同水平的同学都照顾到,并且补充很多技巧以及注意事项。

之前学习过R语言,那时对向量认识不够深,也没有重视,数据框的列单独拿出来就是一个向量。认真听小洁老师的讲解以及最近跑几个GEO数据集发现学会对向量的熟练操作以及熟练一些重要的函数,在实战过程中会顺利些。

数据框DataFrame提出一列(假设名为OneColumn)之后,用DataFrame$OneColumn或者DataFrame[, "OneColumn"]或DataFrame[["OneColumn"]],在默认值drop=True情况下会自动退化为向量。如果用DataFrame["OneColumn"]则提取的为仅有OneColumn列的数据框,其实质仍为列表。

R语言的对象(Objects)主要包括向量、矩阵、数组、数据框和列表。

向量(vector)是R语言中最基本的数据类型,执行组合功能的函数c()可用来创建向量。

数据框(Data Frames)是一种特殊的列表,其中所用元素长度都相等,列表中的每个元素都可以看作一列,每个元素的长度可以看作行数。

创建向量时,先给向量命名,如letters,名字后加“<-符号,接着写函数c(元素)”,如“letters <- c(a,b,c,2,5)”。输入"<-"的方法:同时按“alt和-”或先按"<"再按"-"。 向量只有一行,向量里元素的数据类型操作:class(向量名称[第几列]),如下: 给数据框的各列及各行命名,输入函数c(元素为数字直接输入,每个元素之间用逗号隔开,英文单词要加引号,再用逗号分开),按要求输入数据框的函数后,记得要输入数据框如resualtdata,才能在结果中把数据框的各行各列内容显示出来。 对数据框的各行和各列进的名称修改时,方法:rownames(数据框名字)<-(各列名之间要用引号,列名之间用逗号隔开),colnames(数据框名字)<-(各行名之间要用引号,行名之间用逗号隔开),最后再把数据框名字写上后运行。 第一种方法,class(数据框名称[,第几列]),第几行的数字是空白的;同理,确定数据框中各行的数据类型,class(数据框名称[第几行,]),第几列的数字是空白的。第二种方法,class(数据框名称$第几列的名称),如下。 or 方法1:数据框名称 [第几行,第几列]; 方法2:数据框名称["第几行对应的名称","第几列对应的名称"],此方法相应的行名和列名一定要加双引号,否者运行是错误的。 4行6列:矩阵名称<-matrix(1:24,nrow=4,ncol=6) 5行4列:矩阵名称<-matrix(1:20,nrow=5,ncol=4) 参考在数据框中更改各行各列命名的方法,注意的是,输入命名的函数后,运行不要从原始矩阵函数开始,不然会一直默认,应从矩阵名称开始,或者输入更改各行和各列的函数后,再输入矩阵名称,之后运行即可。 参考数据框的方法,同样也要注意在使用X["D3","E2"]方法时,一定要给具体的行和列的名称加引号。 在使用R语言时,输入的字母,符号一定是用英文版,当命令发生错误时,要仔细核对,是不是格式出现错误,显示不出结果时,输入相应的函数后,是不是没有输入数据框或矩阵。 将作业写至邮件 [email protected] ,抄送 [email protected]