R语言中的一致性检验丨数析学院

Python012

R语言中的一致性检验丨数析学院,第1张

在诊断试验中,研究者希望考察不同诊断方法在诊断结果上是否具有一致性,比如:不同医务工作者对同一组病人的诊断结果是否一致、不同的诊断方法对同一个样本或研究对象的化验结果是否一致等。Cohen 等提出用 Kappa 值作为评价一致性的指标,并得到了广泛的应用,本节将向大家介绍不同条件下的一致性检验。

用于一致性检验的方法取决于数据类型(属性数据,顺序数据,连续数据)以及需要检验的结果组数。

以下是 irr 包中的diagnoses 数据集的一部分,包括三个医生对 30 位病人的诊断结果。

两组结果一致性检验: Cohen’s Kappa

多组结果一致性检验: Fleiss’s Kappa, Conger’s Kappa

如果出现多个评分者,将使用Fleiss’s Kappa。

当然也可以使用Conger’s (1980) 的方法计算精确的Kappa。(注意:目前不知道这个方法效果相对于普通的是好是坏。)

R语言下进行分层卡方检验方法和过程如下:t.test t检验wilcox.test wilcox检验prop.test binom.test 贝努力试验检验chisq.test 卡方检验fish.test fisher精确检验ks.test科尔莫哥罗夫-斯米尔诺夫检验shapiro.testshapio-wilk正态分布检验pp.test. phillips-perron检验quada.test quade检验friedman.test friedman秩和检验R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。