R语言下如何进行分层卡方检验?

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R语言下如何进行分层卡方检验?,第1张

R语言下进行分层卡方检验方法和过程如下:t.test t检验wilcox.test wilcox检验prop.test binom.test 贝努力试验检验chisq.test 卡方检验fish.test fisher精确检验ks.test科尔莫哥罗夫-斯米尔诺夫检验shapiro.testshapio-wilk正态分布检验pp.test. phillips-perron检验quada.test quade检验friedman.test friedman秩和检验R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。

首先,原始数据是由name(名字),class(班级),course(课程)和score(分数)组成的,将其导入R语言并存储在Mydata对象里接下来,我们利用sqldf包来处理分组汇总的问题。由于sqldf包不是R语言自带的,所以先用以下代码安装sqldf包:install.packages("sqldf")然后选择“China(Beijing)”镜像站点进行安装,R语言会同时自动安装“sqldf”包的依赖包。安装好sqldf包及其依赖包后,输入以下代码加载sqldf包:library(sqldf)一切准备就绪,接下来用sqldf统计每个同学的总成绩和平均分:sqldf("select name,sum(score) as score_sum,avg(score) as score_avg from Mydata group by name")统计每个班级的总成绩:sqldf("select class,sum(score) as score_sum from Mydata group by class")统计每个班级的每门课程的总成绩和平均分:sqldf("select class,course,sum(score) as score_sum,avg(score) as score_avg from Mydata group by class,course")

R语言中实现层次聚类模型

大家好!在这篇文章中,我将向你展示如何在R中进行层次聚类。

什么是分层聚类?

分层聚类是一种可供选择的方法,它可以自下而上地构建层次结构,并且不需要我们事先指定聚类的数量。

算法的工作原理如下:

将每个数据点放入其自己的群集中。

确定最近的两个群集并将它们组合成一个群集。

重复上述步骤,直到所有数据点位于一个群集中。

一旦完成,它通常由树状结构表示。

让我们看看分层聚类算法可以做得多好。我们可以使用hclust这个。hclust要求我们以距离矩阵的形式提供数据。我们可以通过使用dist。默认情况下,使用完整的链接方法。

这会生成以下树形图:

从图中我们可以看出,群集总数的最佳选择是3或4:

要做到这一点,我们可以使用所需数量的群集来切断树cutree。

现在,让我们将它与原始物种进行比较。

它看起来像算法成功地将物种setosa的所有花分为簇1,并将virginica分为簇2,但是与花斑杂交有困难。如果你看看显示不同物种的原始图,你可以理解为什么:

让我们看看我们是否可以通过使用不同的连接方法更好。这一次,我们将使用平均连接方法:

这给了我们以下树状图:

我们可以看到,群集数量的两个最佳选择是3或5.让我们用cutree它来将它降到3个群集。

我们可以看到,这一次,该算法在聚类数据方面做得更好,只有6个数据点出错。

我们可以如下绘制它与原始数据进行比较:

这给了我们下面的图表:

内部颜色与外部颜色不匹配的所有点都是不正确聚类的点。