Lecture 7 Affymetrix,R与bioconductor(芯片数据预处理及质量控制)

Python012

Lecture 7 Affymetrix,R与bioconductor(芯片数据预处理及质量控制),第1张

新建方法

1.进入Rsudio界面就选择打开file-New Project-New Directory-New Project-设置名称,保存文件

2..建立一个文件夹,复制之前的.Rproj,修改自己想要的名字,进入Rsudio界面就选择打开file-open Project,选择刚刚新建的.Rproj

最最重点是后面所有文件读取,需要读取的文件放到工作目录,再用需要的函数可以直接读取,默认为工作目录下操作,我要用ReadAffy读取CEL文件,就把CEL文件放入我的工作目录,然后直接读取就可以了,见下图

4.脚本、数据、图片的默认保存位置,也是文件读取的默认位置—工作目录

最后谢谢曾老师和小洁老师耐心指导,菜鸟上线,很容易一学就忘,但是不要紧,办法总比困难多!