R语言基础知识笔记

Python014

R语言基础知识笔记,第1张

1、向量是用于存储数值型,字符型或者逻辑型数据的一维数组。执行组合功能的函数为c(),可以用来创建向量。向量可根据位置进行索引,需要用[]。 2、矩阵是一个二维数组,每个元素都拥有相同的模式,可通过函数matrix()创建矩阵。 3、数组是一个可以在两个以上维度存储数据的数据对象。例如,如果创建尺寸(2,3,4)的数组,那么就是创建4个矩形矩阵每个2行3列。数组只能存储数据类型。 4、矩阵和数组一样都只能包含一种数据类型,当有多种模式的数据时,使用数据框就更为方便。数据框可以用函数data.frame () 创建。 5、$  被用来选取一个给定数据框中的某个特定变量。 6、attach()绑定数据集,detach()解除数据集。 7、with:attach,detach最好在单独的数据框内使用,在多个同名对象最好不要使用,函数with(),可以再具有多个同名对象的数据框内使用,但是必须加入花括号{},这样就无须担心名称冲突了,但是它也有局限性,赋值仅在此函数的括号内生效。 8、列表是一些对象的有序集合。 9,、数据导入 read.table(),其中header = T,代表第一行为变量名称,不作为数据,header = F相反。sep代表数据分隔符,txt为"\t",csv为","。 10、table函数,用 table() 函数统计因子各水平的出现次数(称为频数或频率)。 >sex = c("女","女","女","男","男") >table(sex) >sex   男 女   2 3 求众数 >aim = table(sex)[table(sex)==max(table(sex))] >aim   女    3 > max(table(sex)) [1] 3 > table(sex)==max(table(sex))   sex   男    女   FALSE TRUE 11、 无尺度网络: 是指在某一复杂的 系统 中,大部分节点只有少数几个连结,而某些节点却拥有与其他节点的大量连结。这些具有大量连结的节点称为“集散节点”,所拥有的连结可能高达数百、数千甚至数百万。这一特性说明该网络是无尺度的,因此,凡具有这一特性的网络都是无尺度网络。 12、options(stringsAsFactors = F) #在调用as.data.frame的时,将stringsAsFactors设置为FALSE可以避免character类型自动转化为factor类型。 13、class():查看数据结构:vector、matrix、array、dataframe、list。 14、str():作用用英语来表示是:check classification of viriables,一般用于检查数据框当中有哪些数据。 15、mode() :查看数据元素类型。 16、typeof() :查看数据元素类型,基本等同于mode(),比mode()更为详细。 17、example():假设有一个函数foo,example("foo"),函数foo的使用示例。 18、apropos():列出名称中含有foo的所有可用函数。apropos("foo",mode="function")。 19、data():列出当前已加载包中所含的所有可用示例数据集。 20、ls():列出当前工作空间中的对象。 21、rm():移除(删除)一个或多个对象。 22、history(#):显示最近使用过的#个命令(默认值为25)。 23、options():显示或设置当前选项。有一个收藏文件有介绍options的功能。 24、boxplot():生成盒型图。 25、sum():计算和。sum(x,na.rm = TRUE)。 26、median():计算中位数。 27、cbind():以列结合变量。cbind(x,y,z)。 28、rbind():以行结合变量。 29、vector():以向量形式结合数据。vector(length = 10)。 30、rep():以矩阵形式结合数据。rep(c(1,,2,3),each = 10) 31、seq():生成一个有序的数列。seq(1,10)。 32、dim():矩阵或者cbind输出的维数。dim(Mydata)。 33、scan():从ascii文件中读取数据。scan(file = "test.txt")。 34、write.table():把一个变量写入到ascii文件。write.table(Z,file = "test.txt")。 35、order():确定数据的顺序。order(x)。 36、merge():合并两个数据框。merge(x,y,by = "ID")。 37、str():显示一个对象的内部结构。str(Mydata)。 38、factor():定义变量作为因子。factor(x)。 39、tapply():tapply(X = Veg$R,INDEX = Veg$Transect,FUN = mean).tapply函数根据第二个变量(Transect)的不同水平对第一变量(R)进行了求平均值运算。还可以求sd,var,length等操作。R语言初学者指南P75详细介绍了这个函数。 40、下一页介绍了sapply和lapply。 41、summary():计算基本信息。 42、table():计算列联表,统计因子各水平的出现次数(频数或频率)。table(x,y)。 43、plot():y对x的图形。pch形状,col颜色。 44、par():par(mfrow = c(2,2),mar = c(3,3,2,1)) mfrow生成一个具有4个面板的图形窗口。mar选项指定每个图形周围空白的大小,底部、左侧、顶部、右侧。 45、paste():将变量连接成字符串。paste("a","b",sep = "")。 46、log(): log = "x",log = "y",log = "xy",生成对数轴。 47、%in%: a<-c(1,3,13,1443,43,43,4,34,3,4,3) b<-c(1,13,11,1313,434,1) a%in%b # 返回内容#  [1] TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE # 取反操作 !(a%in%b) 48、sort()函数是对向量进行从小到大的排序 rank()函数返回的是对向量中每个数值对应的秩 order()函数返回的值表示位置,依次对应的是向量的最小值、次小值、第三小值……最大值等(位置索引) arrange()函数(需加载dplyr包)针对数据框,返回基于某列排序后的数据框,方便多重依据排序。 49、subset(): df <- data.frame( a = 1:10, b = 2:11, c = 3:12 )df <- subset(df, select = c(a,c)) #选取列a和c df <- subset(df, select = -c(a,c) ) #去除列a和c

R语言中的因子确实不好理解,很多人都这么觉得。在R语言中,因子(factor)表示的是一个符号、一个编号或者一个等级,即,一个点。例如,人的个数可以是1,2,3,4......那么因子就包括,1,2,3,4.....还有统计量的水平的时候用到的高、中、低,也是因子,因为他是一个点。与之区别的向量,是一个连续性的值,例如,数值中有1,1.1,1.2......可以作为数值来计算,而因子则不可以。如果用我自己的理解,简单通俗来讲:因子是一个点,向量是一个有方向的范围。在R中,如果把数字作为因子,那么在导入数据之后,需要将向量转换为因子(factor),而因子在整个计算过程中不再作为数值,而是一个"符号"而已。因子的水平就是因子的所有不相同的符号的集合。

创建因子的函数介绍如下:

factor(x, levels = sort(unique(x), na.last = TRUE),

labels = levels, exclude = NA, ordered = is.ordered(x))

levels 用来指定因子可能的水平(缺省值是向量x中互异的值);labels

用来指定水平的名字;exclude表示从向量x中剔除的水平值;ordered是

一个逻辑型选项用来指定因子的水平是否有次序。回想数值型或字符型

的x。

>factor(1:3)

[1] 1 2 3

Levels: 1 2 3

>factor(1:3, levels=1:5)

[1] 1 2 3

Levels: 1 2 3 4 5

>factor(1:3, labels=c("A", "B", "C"))

[1] A B C

Levels: A B C

>factor(1:5, exclude=4)

[1] 1 2 3 NA 5

Levels: 1 2 3 5

函数levels用来提取一个因子中可能的水平值:

>f <- factor(c(2, 4), levels=2:5)

>f

[1] 2 4

Levels: 2 3 4 5

>levels(f)

[1] "2" "3" "4" "5"

因子用来存储类别变量(categorical variables)和有序变量,这类变量不能用来计算而只能用来分类或者计数。因子表示分类变量,有序因子表示有序变量。生成因子数据对象的函数是factor(),语法是factor(data, levels, labels, ...),其中data是数据,levels是因子水平向量,labels是因子的标签向量。

1、创建一个因子。

例1:

>colour <- c('G', 'G', 'R', 'Y', 'G', 'Y', 'Y', 'R', 'Y')

>col <- factor(colour)

>col1 <- factor(colour, levels = c('G', 'R', 'Y'), labels = c('Green', 'Red', 'Yellow')) #labels的内容替换colour相应位置对应levels的内容

>col2 <- factor(colour, levels = c('G', 'R', 'Y'), labels = c('1', '2', '3'))

>col_vec <- as.vector(col2) #转换成字符向量

>col_num <- as.numeric(col2) #转换成数字向量

>col3 <- factor(colour, levels = c('G', 'R'))

2、创建一个有序因子。

例1:

>score <- c('A', 'B', 'A', 'C', 'B')

>score1 <- ordered(score, levels = c('C', 'B', 'A'))

>score1

[1] A B A C B

Levels: C <B <A

3、用cut()函数将一般的数据转换成因子或有序因子。

例1:

>exam <- c(98, 97, 52, 88, 85, 75, 97, 92, 77, 74, 70, 63, 97, 71, 98, 

65, 79, 74, 58, 59, 60, 63, 87, 82, 95, 75, 79, 96, 50, 88)

>exam1 <- cut(exam, breaks = 3) #切分成3组

>exam1

[1] (82,98] (82,98] (50,66] (82,98] (82,98] (66,82] (82,98] (82,98] (66,82]

[10] (66,82] (66,82] (50,66] (82,98] (66,82] (82,98] (50,66] (66,82] (66,82]

[19] (50,66] (50,66] (50,66] (50,66] (82,98] (66,82] (82,98] (66,82] (66,82]

[28] (82,98] (50,66] (82,98]

Levels: (50,66] (66,82] (82,98]

>exam2 <- cut(exam, breaks = c(0, 59, 69, 79, 89, 100)) #切分成自己设置的组

>exam2

[1] (89,100] (89,100] (0,59]   (79,89]  (79,89]  (69,79]  (89,100] (89,100]

[9] (69,79]  (69,79]  (69,79]  (59,69]  (89,100] (69,79]  (89,100] (59,69]

[17] (69,79]  (69,79]  (0,59]   (0,59]   (59,69]  (59,69]  (79,89]  (79,89]

[25] (89,100] (69,79]  (69,79]  (89,100] (0,59]   (79,89]

Levels: (0,59] (59,69] (69,79] (79,89] (89,100]

>attr(exam1, 'levels')

[1] "(50,66]" "(66,82]" "(82,98]"

>attr(exam2, 'levels')

[1] "(0,59]"   "(59,69]"  "(69,79]"  "(79,89]"  "(89,100]"

>attr(exam2, 'class')

[1] "factor"

#一个有序因子

>x <- factor(rep(1:5,3))

>ordered(x,labels = c('a1','a2','a3','a4','a5'))

[1] a1 a2 a3 a4 a5 a1 a2 a3 a4 a5 a1 a2 a3 a4 a5

Levels: a1 <a2 <a3 <a4 <a5