R语言选项参数2021.3.7

Python013

R语言选项参数2021.3.7,第1张

file:接一个文件

data:一般指要输入一个数据框

x:表示单独的一个对象,一般都是向量,也可以是矩阵或者列表

x和y:函数需要两个输入变量

x,y,z:函数需要三个输入变量

formula:公式

...:,在help文档中的三个点表示参数可传递,或者表示参数没有数量限制

na.rm:删除缺失值

color选项和明显用来控制颜色

select 与选择有关

font与字体有关

font.axis 就是坐标轴的字体

lty 是line type,线条类型

lwd是line width,线条宽度

method 软件算法

main:字符串,不能是向量

na.rm : TRUE或者FALSE

axis : side参数只能是1到4,调节坐标轴方向。1,2,3,4分别代表左下右上

fig:包含四个元素的向量

row:排,行

col:列

ggsurvplot(

fit, #生存分析结果

data = NULL, #a dataset used to fit survival curves

fun = NULL, # 定义生存曲线转换的任意函数。 经常使用的转换可以用字符参数指定:“event”绘制累积事件(f(y) = 1-y),“cumhaz”绘制累积风险函数(f(y) = -log(y)),“pct”以百分比表示生存概率。

color = NULL, #曲线颜色

palette = NULL, #颜色调色板,可选调色板有 "grey","npg","aaas","lancet","jco", "ucscgb","uchicago","simpsons"和"rickandmorty".

linetype = 1, #线条形状,可以用数值型向量1,2表示,也可以用字符串向量c("solid", "dashed").

conf.int = FALSE, #是否画出置信区间

pval = FALSE, #是否显示P值

pval.method = FALSE, #是否添加计算P值得方法得文本,前提是pval = TRUE

test.for.trend = FALSE, #默认是F,如果TURE,返回trend Pvalues检验。 趋势检验旨在检测生存曲线的有序差异。 也就是说,至少对一个群体来说。 只有组数为>2时,才能进行趋势测试。

surv.median.line = "none", #画一条水平或者垂直得生存中位值线,允许的值有c("none", "hv", "h", "v"). v: 垂直vertical, h:水平horizontal.

risk.table = FALSE, #是否显示风险table。其他值有absolute" or "percentage",显示绝对数值/百分比;参数"abs_pct" ,百分比以及绝对数值都显示

cumevents = FALSE, # logical value specifying whether to show or not the table of the cumulative number of events.

cumcensor = FALSE, #logical value specifying whether to show or not the table of the cumulative number of censoring.

tables.height = 0.25, #设置table得高度,取值范围0-1

group.by = NULL, #包含分组变量名称得字符串向量。长度<=2

facet.by = NULL, #一个字符向量,包含将生存曲线分成多个面板的分组变量的名称。

add.all = FALSE, #一个逻辑值。 如果为TRUE,则在主图中添加合并患者(null model)的生存曲线。

combine = FALSE, # a logical value. If TRUE, combine a list survfit objects on the same plot.

ggtheme = theme_survminer(), #主题名称

tables.theme = ggtheme, #主题名称,默认是theme_survminer.

... #后面描述的参数和其他参数将被传递给ggplot2 geom_*()函数,如linetype, size, ii)或ggpar()函数来定制图形。 看到的细节部分

)