R语言可视化之ggplot2——KEGG通路富集分析

Python09

R语言可视化之ggplot2——KEGG通路富集分析,第1张

之前分享了如何用ggplot2可视化GO分析的结果。既然做了GO,当然少不了KEGG了。

同样的,我们从 DAVID 获取KEGG pathway的结果。

对于KEGG,我比较喜欢做气泡图,这样用两种形式的图结合在一起,效果更丰富更好看一点。

运行后一直出现这个Reading KEGG annotation online: fail to download KEGG data... Error in download.KEGG.Path

按照Jimmy老师的办法,还是解决不了,为啥呢?