R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是基于S语言的一个GNU项目，所以也可以当作S语言的一种实现，通常用S语言编写的代码都可以不作修改的在R环境下运行。
R 是统计领域广泛使用的诞生于 1980年左右的 S 语言的一个分支。 S的主要设计者John M. Chambers 因为S语言方面的工作获得了1998年 ACM 软件系统奖（ACM Sofare Systems Award）。
R可以在多种平台下编译和运行，包括UNIX (也包括FreeBSD和Linux)、Windows和MacOS。
该语言的语法表面上类似 C，但在语义上是函数设计语言的（functional programming language）的变种并且和Lisp 以及 APL有很强的兼容性。特别的是，它允许在“语言上计算”（puting on the language）。这使得它可以把表达式作为函数的输入参数，而这种做法对统计模拟和绘图非常有用。
官方网站：:r-project./
R语言为什么叫R语言您好，R语言的命名是根据该软件的开发者来的，R本来是由来自新西兰奥克兰大学的Ross Ihaka和Robert Gentleman 开发，所以取二人名字的首字母作为软件名
r语言中什么是向量什么是标量同样是一个数
x<-c(1) 这个x是向量
x<-1 这个x是标量
R语言代码问题，什么是jitter，什么是runif（）fourspd2012.jittered 是变量名。
runif (random samples from uniform distribution), runif(242,min=-0.3,max=0.3) 从-0.3 到0.3 随机产生242个值
R语言是什么?R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。
R语言是什么鬼
R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。
R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具
R作为一种统计分析软件，是集统计分析与图形显示于一体的。它可以运行于UNIX,Windows和Macintosh的操作系统上，而且嵌入了一个非常方便实用的帮助系统，相比于其他统计分析软件，R还有以下特点：
1.R是自由软件。这意味着它是完全免费,开放源代码的。可以在它的网站及其镜像中下载任何有关的安装程序、源代码、程序包及其源代码、文档资料。标准的安装文件身自身就带有许多模块和内嵌统计函数,安装好后可以直接实现许多常用的统计功能。[2]
2.R是一种可编程的语言。作为一个开放的统计编程环境,语法通俗易懂,很容易学会和掌握语言的语法。而且学会之后,我们可以编制自己的函数来扩展现有的语言。这也就是为什么它的更新速度比一般统计软件,如,SPSS,SAS等快得多。大多数最新的统计方法和技术都可以在R中直接得到。[2]
3. 所有R的函数和数据集是保存在程序包里面的。只有当一个包被载入时,它的内容才可以被访问。一些常用、基本的程序包已经被收入了标准安装文件中,随着新的统计分析方法的出现,标准安装文件中所包含的程序包也随着版本的更新而不断变化。在另外版安装文件中,已经包含的程序包有：base一R的基础模块、mle一极大似然估计模块、ts一时间序列分析模块、mva一多元统计分析模块、survival一生存分析模块等等.[2]
4.R具有很强的互动性。除了图形输出是在另外的窗口处，它的输入输出窗口都是在同一个窗口进行的，输入语法中如果出现错误会马上在窗口口中得到提示,对以前输入过的命令有记忆功能,可以随时再现、编辑修改以满足用户的需要。输出的图形可以直接保存为JPG,BMP,PNG等图片格式,还可以直接保存为PDF文件。另外,和其他编程语言和数据库之间有很好的接口。[2]
5.如果加入R的帮助邮件列表一,每天都可能会收到几十份关于R的邮件资讯。可以和全球一流的统计计算方面的专家讨论各种问题,可以说是全世界最大、最前沿的统计学家思维的聚集地.[2]
R是基于S语言的一个GNU项目，所以也可以当作S语言的一种实现，通常用S语言编写的代码都可以不作修改的在R环境下运行。 R的语法是来自Scheme。R的使用与S-PLUS有很多类似之处，这两种语言有一定的兼容性。S-PLUS的使用手册，只要稍加修改就可作为R的使用手册。所以有人说：R，是S-PLUS的一个“克隆”。
但是请不要忘了：R是免费的(R is free)。
R语言报错，什么是下标出界下标出界就是比如说你有一个100长度的数组，但你却用了101的小标去引用数组，这样就会出现出界
R语言大神们学习R语言初期用的什么书《 R语言实战》《R语言初学者指南》《R语言编程艺术》。你也可以去亚马逊上搜索，看看别人的评价来决定你买哪一本。关键看你学习R语言有没有统计和数据挖掘的基础吧。
R语言“seq函数”是什么？在一个文档中定位到第一个空行，读取其后的所有文本 get.msg <- function(path) { con <- file(path, open = "rt", encoding = "latin1") text <- readLines(con) # The message always begins after the first full line break msg <-... 文档定位第空行读取其所文本
get.msg <- function(path)
{
con <- file(path, open = "rt", encoding = "latin1")
text <- readLines(con)
# The message always begins after the first full line break
msg <- text[seq(which(text == "")[1]+1, length(text), 1)]
close(con)
return(paste(msg, collapse = "\n"))
}
报错：
Error in seq.default(which(text == "")[1]+1, length(text), 1) :
'from' cannot be NA, NaN or infinite 展开 示例文档：
From [email protected] Thu Aug 22 13:17:22 2002
Return-Path: [email protected]>
Delivered-To: [email protected].
Received: from localhost (localhost [127.0.0.1])
by phobos.labs.spamassassin.taint. (Postfix) with ESMTP id 136B943C32
for <zzzz@localhost>Thu, 22 Aug 2002 08:17:21 -0400 (EDT)
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-W3CDTD HTML 4.0 TransitionalEN">
<HTML><HEAD>
<META content=3D"text/charset=3Dwindows-1252" -equiv=3DContent-T=
ype>
没有具体的建模数值，因为根据不同形态的建模，需要设置的数值都是不同的，最基础的是可选择的缩放参数。
例如：
w = torch.Tensor(3, 5)
nn.init.xavier_uniform(w, gain=nn.init.calculate_gain('relu'))
非线性回归的初始值设置方法：
1.查阅他人已有文献，采用其参数作为初始值；
2.将可线性化的方程进行变换（如对数变换），将其线性化后采用线性回归的计算参数，得到的参数进行相应的变换后代入原方程作为初始值；
3.更改算法，R语言可以尝试minpack包的nls.LM()函数，quantreg包的 dynrq()函数进行分位数回归
4.瞎蒙
1.Linux与R的学习先后问题：
师姐说后面作生信分析要用Linux环境进行数据集群分析，所以目前首要任务是熟悉R语言和Python的操作，后面转到Linux环境运行操作大同小异。
2.R及Rstudio的安装问题：
装了Rstudio之后显示没有装R，解决方案是R和Rstudio安装时选择默认路径，是这两个软件装在同一个目录下。
3.输入demo()后显示
>demo()
Warning message:
In file.show(outFile, delete.file = TRUE, title = paste("R", tolower(x$title))) :
file.show():不存在'C:\Users\灏忔湪浜榎AppData\Local\Temp\RtmpENM66s\RpackageIQR28b82f592cbb'这个文件
（1）找出问题：R存在一个中文目录底下，会出现错误，所以首先第一步要将文件名（即user底下的名字）改为英文的（注：以后文件名尽量设置为英文的，才方便识别）
（2）解决问题：因为win为家庭版，所以没有在计算机管理中没有找到本地用户和组，借鉴了CSDN论坛中一位大神经验贴的后半部分【 【设置】Win10如何更改C:\Users\下的用户名_胡振涛-CSDN博客_如何更改users下的用户名 】，从win+R输入regedit(打开注册表）那块开始，后面将自己中文的文件名改成英文就好了，然后注销再打开，运行R后，输入demo()，显示界面如下图。
4.options()是个啥，没整明白？
options：指定系统参数
5. runif()函数
runif (random samples from uniform distribution) 均匀分布中的随机变量
例如：runif(242, min =-0.3,max=0.3) 从-0.3 到0.3 随机产生242个值
6.包及库
1——已经安装的包
2——用来放R安装时自带的包（如base，state等）
7.函数括号内加“”的规律：外部的东西要加引号。安装以后内部的东西不用加引号。
8.批处理命令打出来很奇怪？
9.返回值？——一个运算函数被赋予具体数据后得到值return到这个函数变量上（操作型函数没有返回值）
10.help(package="vcd"/"ggplot2")，命令后help界面无显示
未找到问题原因，解决方案为在CRAN上直接看好了。
11.安装ggplot2包后，输入library(ggplot2)，没有反应——说明你装上了。。(有些包library成功是没有输出的）
相反的是可以看到如果安装的是tidyverse，输入library(tidyverse)，是有输出的
12.Rstudio工作路径&库安装路径修改（我用#CSDN#这个app发现了有技术含量的博客，小伙伴们求同去《Rstudio更改工作路径&安装包路径》, 一起来围观吧 https://blog.csdn.net/princessyang/article/details/105731349?utm_source=app&app_version=4.7.1&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen）
工作路径修改
getwd（）——得到目前的工作路径
setwd（“目标工作路径”）
getwd（）——就可以看到路径更改了
库安装路径修改
打开
13.忘了在操作台输入啥可以显示那一长条的包了？
14.数据集和数据结构
1）数据集就是多个数据组成的集合
2）数据结构就是数据集的结构
15.rep函数
rep(1:4, each = 2)——1到4，每个element循环2次
[1] 1 1 2 2 3 3 4 4
rep(1:4, c(2,2,2,2))——1到4，对应位置上的element循环2次
[1] 1 1 2 2 3 3 4 4
rep(1:4, c(2,1,2,1))——1到4，对应位置上的element有的循环1次，有的循环2次
[1] 1 1 2 3 3 4
16.rep(1,40*(1-.8))什么意思？
就是说1这个数字，重复40*（1-0.8）=8遍，但其实只重复7遍，因为计算机返回的结果比8稍小一点。
如果想要得到循环8次，可以使用这个函数：rep(1,round(40*(1-.8)))
17.矩阵
（1）只有在数据长度不是矩阵行数或者列数整数倍的时候才会报错，在矩阵列数X行数所需数据大于数据长度时，会再次重复排列数据，但不会报错。
（2）矩阵默认按照 列 的顺序来排列数据，
matrix(x,5,byrow = T) 按照 行 的顺序排列
matrix(x,5,byrow = F) 按照 列 的顺序排列
（3）以字符型向量添加行名和列名
>rnames <- c("R1","R2","R3","R4")
>cnames <- c("C1","C2","C3","C4","C5")
>dimnames(m) <- list(rnames,cnames)
（4）矩阵汇总
（5）矩阵索引
y[1,2]——y矩阵中第1行，第2列
18.数组
