如何用r语言写协方差矩阵的迭代

Python09

如何用r语言写协方差矩阵的迭代,第1张

协方差矩阵计算用公式cov(x,y)=EXY-EX*EY。

在数学中,矩阵是一个按照长方阵列排列的复数或实数集合,最早来自于方程组的系数及常数所构成的方阵。这一概念由19世纪英国数学家凯利首先提出。

最新版的r语言没有方差分析表格的解决方法如下:

ANOVA对各疗法的F检验表明,4种药品用于缓解术后疼痛的疗效不同,但是并不能得出哪种药品疗法与其他不同。

多重比较可以解决这个问题.e.g. TukeyHSD()函数提供了对各组均值差异的成对检验;multcomp包中的glht()函数提供了多重均值比较更为全面的方法,既适用于线性模型,也适用于广义线性模型;多重t检验方法针对每组数据进行t检验。代码如下: TukeyHSD(medicine.aov) #par()函数旋转轴标签,增大左边界面积,使标签摆放更美观。 par(las = 2) par(mar = c(5, 8, 4, 2)) plot(TukeyHSD(medicine.aov))

图形中置信区间包含0的药品对比,说明差异不显著。 library(multcomp) #为适合字母阵列摆放,par语句用来增大顶部边界面积 par(mar = c(5, 4, 6, 2)) tuk <- glht(medicine.aov, linfct = mcp(Treatment = "Tukey")) #cld()函数中level选项为设置的显著性水平(这里的0.05对应95%置信区间) plot(cld(tuk, level = 0.05), col = "lightgrey")

有相同字母的组(用箱线图表示)说明均值差异不显著。

多次重复使用t检验会增大犯第一类错误的概率,为了克服这一缺点,需要调整p-值。R软件调整p-值用的是p.adjust()函数,函数使用的不同参数代表不同的调整方法。 attach(medicine) #求数据在各水平下的均值 mu<-c(mean(Response[Treatment==1]), mean(Response[Treatment==2]), mean(Response[Treatment==3]),mean(Response[Treatment==4]))mu #作多重t检验。这里用到的pairwise.t.test()函数用来得到多重比较的p值 pairwise.t.test(Response, Treatment, p.adjust.method = "none")

#观察两个作调整后的p值的情况。p.adjust.method()函数的参数也可换为"hochberg","hommel","bonferroni","BH","BY","fdr"等。 pairwise.t.test(Response, Treatment, p.adjust.method = "holm") #绘制箱线图 plot(medicine$Response~medicine$Treatment)

Vectors 向量【当你想用多个元素创建向量时,你应该使用 c() 函数,这意味着将元素组合成一个向量。】

# c函数用来将元素组成为一个向量

v <- c('a', 'b','c')

print(v)

# 输出结果即为元素的值,可以看出,vector类型里面只能有一种元素

print(class(v))

1

2

3

4

5

1

2

3

4

5

1] “a” “b” “c”

[1] “character”

那么问题来了,假如我就是想什么东西都往向量里面塞呢,这种做法并不会引发报错,但是R会暗中把那些乱七八糟的东西全部转换为一种类型。比如在下面这个例子,R就取了vector的第一个元素,将其转换为了character类型。

在这里插入图片描述

Lists 列表【列表是一个 R 对象,它可以在其中包含许多不同类型的元素,如向量,函数甚至其中的另一个列表。】

# 列表里面就什么都可以塞

l <- list(1,"666",c(2,3,4))

print(l)

print(class(l))

1

2

3

4

1

2

3

4

[[1]]

[1] 1

[[2]]

[1] “666”

[[3]]

[1] 2 3 4

[1] “list”

Matrices 矩阵【矩阵是二维矩形数据集。 它可以使用矩阵函数的向量输入创建。】

# 第一个参数指的是矩阵中的元素内容,第二三个参数指的是矩阵的行和列,最后一个参数指的是按行排列还是按列排列

M = matrix( c('a','a','b','c','b','a'), nrow = 2, ncol = 3, byrow = TRUE)

print(M)

M = matrix( c('a','a','b','c','b','a'), nrow = 2, ncol = 3, byrow = FALSE)

print(M)

print(class(M))

1

2

3

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5

6

1

2

3

4

5

6

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Arrays 数组【虽然矩阵被限制为二维,但阵列可以具有任何数量的维度。 数组函数使用一个 dim 属性创建所需的维数。】

a <- array(c(1,2,3,4),dim = c(3,3,2))

print(a)

print(class(a))

print(a[2,2,1])

1

2

3

4

1

2

3

4

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Factors 因子【因子是使用向量创建的 r 对象。 它将向量与向量中元素的不同值一起存储为标签。 标签总是字符,不管它在输入向量中是数字还是字符或布尔等。 它们在统计建模中非常有用。】

color <- c('green','green','yellow','red','red','red','green')

f <- factor(color)

print(color)

print(f)

print(nlevels(f))

print(class(s))

1

2

3

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6

1

2

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5

6

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Data Frames 数据帧【数据帧是表格数据对象。 与数据帧中的矩阵不同,每列可以包含不同的数据模式。 第一列可以是数字,而第二列可以是字符,第三列可以是逻辑的。 它是等长度的向量的列表。】

BMI <- data.frame(

gender = c("Male", "Male","Female"),

height = c(152, 171.5, 165),

weight = c(81,93, 78),

Age = c(42,38,26)

)

print(BMI)

print(class(BMI))

1

2

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4

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7

8

1

2

3

4

5

6

7

8

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参考网址:w3c

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