1.首先利用r语言的install中的packages方法,输入参数【xlsx】即可。
2.此时利用library(xlsx)语句,打开xlsx这个库。
3.此时通过read的xlsx语法就能读取某个文件夹下的Excel文件。
4.这个时候,我们按下回车,就能看到通过r语言读取excel的一批数据。
ID转换用到的是 bitr() 函数,bitr()的使用方法:
org.Hs.eg.db包含有多种gene_name的类型
keytypes() :keytypes(x),查看注释包中可以使用的类型
columns() :类似于keytypes(),针对org.Hs.eg.db两个函数返回值一致
select() :select(x, keys, columns, keytype, ...) eg.
函数enrichGO()进行GO富集分析,enrichGO()的使用方法:
举例: