R基础(2):Rstudio的基本介绍

Python020

R基础(2):Rstudio的基本介绍,第1张

相比于RGui,Rstudio作为R语言的编辑器使用方便太多,从我开始学习R语言,我就用起来Rstudio。虽然R的界面都是英文的,但其实用起来并不那么复杂,常用的功能就那么几个。这次,我来给R语言学习的新手们做一个Rstudio的基本介绍。

Rstudio界面如下所示,简单地分为四个窗口,从左至右分别是程序编辑窗口,工作空间与历史信息,程序运行与输出窗口(控制台),画图和函数包帮助窗口。

同时,在行号右边出现下三角符,说明part1注释下的所有程序均可以折叠起来。因此,可以依次建立part2,part3, 可以根据需要折叠展开各部分内容。上面这个操作也可以通过输入来建立,不过必须输入一个#号和至少四个-号或者=号。建立不同的程序区域后,可以点击Code->Jump To(或Alt+ Shift+J)在不同的区域跳转。

1、R语言可以导出csv格式的文件供Excel使用,具体的使用方法首先打开RStudio软件:

2、先定义一个随机生成一个包含10个正态分布数据的向量,然后输出它,使用csv函数导出csv文件,函数中第一个参数为导出的变量名nx,第二个参数为导出的文件名称和路径:

3、接着按下windows+E键打开资源管理器,双击打开生成的csv文件即在Excel中看到数据了:

有点复杂啊。。。这么短讲不清楚。。。我写的仅供参考,以R官网的说法为准。

一般先点右上角新建一个project(一般是new directory),类型是package,其他设置看自己喜好啦。然后要填写DESCRIPTION,比如作者、概述、包的版本、license、依赖哪些包、建议同时装哪些包……函数如果都是用R语言写的话(没有用C/C++/Fortran/……来实现部分功能),就把.R文件都放到R目录底下。帮助文档(就是可以用help(function)调出来的文档)我比较建议用roxygen2包来做,直接在.R文件里按照特定的格式写文档(去这个包的网站看一下格式),然后在包的目录底下在R里运行roxygen2::roxygenize(),就直接把文档写到man目录下了,顺便NAMESPACE也一块儿自动写了,之后要改文档的话重新运行就行了。

其他方面:vignnettes之类的文档去网上找吧(考虑一下用好一点的搜索引擎o(╯□╰)o),这方面有一大堆东西可以写,当然也可以不写。还可以在包里自带数据集:把数据放在data目录下,关于数据的文档也可以在.R文件里写然后roxygenize。如果要用其他语言实现部分功能的话,去R的官网看怎么弄吧,我没用过这么高级的功能o(╯□╰)o。我还看到网上说有个叫packrat的东西可以用,好像是把依赖的包一起打包进新的包里。我没用过。

全部写好之后最好测试一下,比如在自己电脑里装上这个包试试,还可以在cmd/shell里运行R CMD check path/to/package/directory自动测试这个包(貌似windows系统下要装Rtools还要调一下系统的路径才能这么用,自己找一下吧)。

总之不是一篇回答就能说清楚的o(╯□╰)o,我自己也是花了好长时间在网上搜才把之前的包搞定的。

另外,作为一个project,可以考虑用一些版本控制的软件来帮忙,比如git、svn。用git的话可以直接放到github上面,别人就可以直接用devtools包里的函数装啦~如果想传到CRAN或者Bioconductor的话,对包的功能、稳定性、文档等的要求会比较高,我从没想过弄这些。