rstudio森林图显示不全

Python017

rstudio森林图显示不全,第1张

作图指令错误。

每次创建图片前使用dev.new方法,使用函数dev.new、dev.next、dev.prev、dev.set、dev.off同时打开多个图形窗口,并决定将哪个输出发送到哪个窗口。

RStudio是R语言的集成开发环境(IDE),它是一个独立的开源项目,它将许多功能强大的编程工具集成到一个直观、易于学习的界面中。RStudio可以在所有主要平台Windows、Mac、Linux上运行,也可以通过web浏览器(使用服务器安装)运行。如果你是一个R新手或者偏爱界面版的R环境,那么你会喜欢上RStudio,本书的目的之一即是缩短你与RStudio之间的距离。

森林图(forest plot),一般是指在平面直角坐标系中,以一条垂直于X轴的无效线(通常坐标X=1或0)为中心,用若干条平行于X轴的线段,来表示每个研究的效应量大小及其95%可信区间,并用一个棱形来表示多个研究合并的效应量及可信区间,它是Meta分析中最常用的结果综合表达形式。实际上,除了Meta分析,森林图还有很多用处。森林图可以直观的反映出效应量(例如RR、OR、HR或者WMD)大小及其95% CI等。

本篇文章利用ggplot2包进行绘制森林图(严格意义上应该叫meta分析效应量图),关于ggplot2的基本用法这里不在叙述。

这里想用发表在SBB上的一篇meta分析文章( https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.108118 )中的图作为模板,进行绘制。

[1] https://zhuanlan.zhihu.com/p/340207465

[2] Feng, J. G., Zhu, B., 2021. Global patterns and associated drivers of priming effect in response to nutrient addition. Soil Biology and Biochemistry 153, 108118. https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.108118 .