R语言安装DESeq2包

Python015

R语言安装DESeq2包,第1张

DESeq2用来处理转录组数据。那么先来完成第一步:安装。

1、传统方式安装

麻蛋,报错了!!!!为什么受伤的总是我。

2、开启查阅资料模式,然后得到的结论是这个包的安装需要利用BiocConductor或者BiocManager。

但是根据网上大神们的分享,尝试了各种方法。报错越来越多,并且越来越看不懂。

最后决定直接进入DESeq2的package官网上看吧。 https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DESeq2.html

3、最后按照Bioconductor指示安装,成功。

方法/步骤

首先,需要打开R studio,这是初始界面的,简洁干净。在右上方的Environment中,有之前使用留下的数据不用去管。

对于电脑中已经保存了的package,可以直接在左下方的“package”中找到。每次打开R studio时,都要重新安装使用。勾选即可安装。

而未勾选表示未安装。在跟勾选了之后,出现这样的一段代码,表示package安装完毕。

对于那些电脑中没有保存的package,就需要从网络上下载。如图,单击“install”,出现对话框“install package”。

输入需要下载安装的包的名称,同时设置下载地址,确认即可。

在右上方的红色角标表示正在从网上载入package,出现这一段代码。

等待几十秒钟后,显示下载成功,这个package有453KB等等的信息。

下载了的package在右侧可以找到,从这里安装进R中。

勾选“quantmod”,安装即可。