R语言ggtree:将进化树中的序列id改成物种名称

Python024

R语言ggtree:将进化树中的序列id改成物种名称,第1张

这个问题是来源于公众号的一位读者的提问

这样就替换过来了

这样就达成目的了

这样就没有问题了

现在假设你已经拿到了nwk格式的进化树文件,如下

现在进化树的所有信息都存储在了 tree 这个变量里

用到的的 geom_tiplab()

可以首先加上 theme_tree2() 函数显示出坐标轴范围,然后用 xlim() 函数更改坐标轴范围

这里布局的参数就不一一介绍了,可以参考 https://yulab-smu.top/treedata-book/chapter4.html