r语言中的linear函数用法

Python023

r语言中的linear函数用法,第1张

1、创建数据集

hospital <- c("New York", "California")patients <- c(150,350)

costs <- c(3.1,2.5)

df <- data.frame(hospital, patients, costs)

2、创建新的变量

df$totcosts <- df$patients * df$costs

3、改变变量的名称

df$costs_euro <- df$costs

df$costs <- NULL

df$patients <- ifelse(df$patients==150，100，ifelse(df$patients==350,300，NA))

4、合并数据集

finaldt <- merge(dataset1, dataset2, by="id")

或者

finaldt <- cbind(dataset1, dataset2)

finaldt <- rbind(dataset1, dataset2)

5、子数据集

dt <- iris[,c("Sepal.Length" ,"Sepal.Width")]

dt <- iris[,c(-2,-3)]#去除第2、3列变量数据

dt2<- subset(dt,Age>40&Sex==men)#对数据集dt筛选满足条件的数据

获取表达矩阵，处理TCGA的count数据，1表示为行。

导入数据

加 ENTREZID列，用于富集分析（symbol转entrezid，然后inner_join）

转化空格为NA

用花花的专属TCGA包，ID进行转换

把空着的值改为NA

以病人为中心，表达矩阵按病人ID去重复

去除重复

TPM数据做单个基因的生存分析file:///C:/Users/denghuan/Desktop/The%20learning%20of%20R%20software/Practice/%E7%94%9F%E5%AD%98%E5%88%86%E6%9E%90%20survival%20analysis/6.Survival.html

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str_detect(colnames(exp),"TCGA-W5-AA2R")